基金委始終堅(jiān)持“依靠專(zhuān)家，發(fā)揚(yáng)民主，擇優(yōu)支持，公正合理”的評(píng)審原則，基金項(xiàng)目采用兩級(jí)評(píng)審制。

申報(bào)截止的45個(gè)工作日內(nèi)各學(xué)科處對(duì)每份申請(qǐng)書(shū)進(jìn)行形式審查（包括申請(qǐng)資格、申請(qǐng)內(nèi)容、申請(qǐng)人簽名、項(xiàng)目組成員簽名等）；

4月下旬至5月份及形式審查合格后，進(jìn)行第一輪的五位同行專(zhuān)家網(wǎng)上電子評(píng)審（專(zhuān)家的選擇主要是根據(jù)申請(qǐng)書(shū)中摘要內(nèi)容和申請(qǐng)代碼）在網(wǎng)上評(píng)審中，申請(qǐng)人可以要求回避對(duì)自己項(xiàng)目評(píng)審不利的評(píng)審專(zhuān)家；

6月份所有的同行專(zhuān)家評(píng)審意見(jiàn)返回后由學(xué)科處負(fù)責(zé)人遴選參加第二輪評(píng)審會(huì)的項(xiàng)目(上會(huì)項(xiàng)目數(shù)和資助項(xiàng)目數(shù)比為1：1.2—1.5)；

7-8月召開(kāi)學(xué)部評(píng)審會(huì)，在評(píng)審中基金委還對(duì)“非共識(shí)”項(xiàng)目進(jìn)行妥善處理，保護(hù)創(chuàng)新性強(qiáng)而風(fēng)險(xiǎn)性高的項(xiàng)目。

2019年，選擇重點(diǎn)項(xiàng)目與部分學(xué)科面上項(xiàng)目，試點(diǎn)開(kāi)展基于四類(lèi)科學(xué)問(wèn)題屬性的分類(lèi)申請(qǐng)與評(píng)審，即取決于申請(qǐng)人在填寫(xiě)申報(bào)書(shū)時(shí)選擇的科學(xué)問(wèn)題屬性。

分組：

按照科學(xué)處根據(jù)申請(qǐng)書(shū)數(shù)量和預(yù)先分配的名額分組，每組約16名專(zhuān)家，負(fù)責(zé)大約十幾個(gè)領(lǐng)域，個(gè)別領(lǐng)域可能有兩名專(zhuān)家分別負(fù)責(zé)。基金委的網(wǎng)絡(luò)評(píng)審是分成領(lǐng)域進(jìn)行評(píng)審的，同一領(lǐng)域的基金申請(qǐng)書(shū)分成若干組，每個(gè)組送給相同的一批專(zhuān)家進(jìn)行審稿。在最后上會(huì)評(píng)審階段，也是在同領(lǐng)域內(nèi)部競(jìng)爭(zhēng)，不同領(lǐng)域之間并不存在明顯的競(jìng)爭(zhēng)。可能出現(xiàn)有些申請(qǐng)人條件并不是太強(qiáng)，但是由于同領(lǐng)域內(nèi)具有相對(duì)好的競(jìng)爭(zhēng)力而得到資助，有些盡管條件很好，但是可能強(qiáng)中更有強(qiáng)中手，最終得不到資助。所以選題和相應(yīng)的領(lǐng)域非常重要，如果要提高命中率，選一個(gè)競(jìng)爭(zhēng)不太激烈的領(lǐng)域很重要。

上會(huì)評(píng)審資格：

所有的項(xiàng)目根據(jù)網(wǎng)絡(luò)評(píng)審意見(jiàn)自動(dòng)分級(jí)，根據(jù)每一個(gè)項(xiàng)目的評(píng)審意見(jiàn)，對(duì)于ABCD給予一個(gè)分值，資助和不資助也給相應(yīng)的分值。比如，優(yōu)先資助4分，資助3分，不予資助-3分，最后按照公式自動(dòng)計(jì)算每一個(gè)項(xiàng)目的得分。申請(qǐng)書(shū)網(wǎng)評(píng)意見(jiàn)至少為三份，最多四份。排名前12%（大體如此，分成兩種情況）的為A類(lèi)項(xiàng)目，12%到35%的為B類(lèi)項(xiàng)目，其他為C類(lèi)項(xiàng)目。原則上，A類(lèi)項(xiàng)目為必須資助，除非有特殊情況，后面介紹。B類(lèi)項(xiàng)目大約有一半多點(diǎn)項(xiàng)目可以資助，C類(lèi)項(xiàng)目不參與會(huì)評(píng)，自動(dòng)不予資助。項(xiàng)目分級(jí)和是否上會(huì)討論，由計(jì)算機(jī)自動(dòng)給出，并沒(méi)有人為干預(yù)。會(huì)評(píng)的重點(diǎn)就是決定哪A類(lèi)項(xiàng)目有沒(méi)有異常，哪些B類(lèi)項(xiàng)目應(yīng)該得到資助。是否上會(huì)完全取決于網(wǎng)評(píng)的好壞 ， 一般情況下， 不上會(huì)的項(xiàng)目評(píng)審意見(jiàn)絕大多數(shù)是三個(gè)不予資助， 如果一個(gè)項(xiàng)目有三位專(zhuān)家判為不予資助，基本上問(wèn)題都較多。個(gè)別項(xiàng)目，網(wǎng)絡(luò)評(píng)審意見(jiàn)為 C 類(lèi)， 但是如果有兩名知名學(xué)者獨(dú)立提出復(fù)議的意見(jiàn)， 也可以進(jìn)入會(huì)評(píng)， 這種項(xiàng)目稱(chēng)為非共識(shí)項(xiàng)目 。

會(huì)評(píng)流程：

會(huì)評(píng)按照青年、面上、地區(qū)項(xiàng)目順序進(jìn)行， 每一個(gè)類(lèi)別都會(huì)按照領(lǐng)域， 指定每一位專(zhuān)家負(fù)責(zé)一個(gè)領(lǐng)域， 稱(chēng)為主審專(zhuān)家 。 主審專(zhuān)家拿到項(xiàng)目申請(qǐng)書(shū)和網(wǎng)絡(luò)評(píng)審意見(jiàn)， 先進(jìn)行申請(qǐng)書(shū)和網(wǎng)評(píng)意見(jiàn)的閱讀和思考。這些工作都是會(huì)議之外的時(shí)間完成的。 因此，基金會(huì)評(píng)是個(gè)體力活，每天晚上都要加班看本子，寫(xiě)好每一個(gè)本子的意見(jiàn)， 白天就由每一個(gè)主審專(zhuān)家就主審的所有項(xiàng)目進(jìn)行排隊(duì)， 給項(xiàng)目一個(gè)順序， 并根據(jù)自己分配的名額決定哪些項(xiàng)目可以資助，哪些項(xiàng)目不能資助，哪些作為備選項(xiàng)目。 基本上， 網(wǎng)評(píng)結(jié)果好的申請(qǐng)書(shū)總體比網(wǎng)評(píng)較差的申請(qǐng)書(shū)質(zhì)量好， B 類(lèi)中排名靠后的申請(qǐng)書(shū)命中率比較低。 會(huì)評(píng)能夠改變順序的機(jī)會(huì)并不是很大 。