從miRTarBase數(shù)據(jù)庫上下載了經(jīng)試驗(yàn)驗(yàn)證的miRNA靶基因信息，.xlsx后綴文件，也就是常說的excel文件，文件大小23.5M。

在使用xlsx包讀取該文件時(shí)報(bào)錯(cuò)：

Error in .jcall('RJavaTools', 'Ljava/lang/Object;', 'invokeMethod', cl, :java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space

如字面意思，內(nèi)存不足，但電腦還有超過3G的內(nèi)存空間...

方法1：

為其分配更多的內(nèi)存

https:///questions/34624002/r-error-java-lang-outofmemoryerror-java-heap-space

使用 options 函數(shù)修改設(shè)置。注意，該命令需要在加載 rJava 或 xlsx 包之前執(zhí)行，故推薦重啟R，然后運(yùn)行：

此時(shí)再讀取'.xlsx'文件則不會(huì)報(bào)錯(cuò)，但是讀取文件時(shí)仍需要花費(fèi)大量時(shí)間和內(nèi)存資源，且不一定能順利解決問題！

方法2：

打開'.xlsx'文件，另存為'.csv'格式，再使用 read.csv 函數(shù)進(jìn)行數(shù)據(jù)讀取！

database = read.csv('filename.csv', h = T)

方法3：

使用readxl包中的 read_excel 函數(shù)，根據(jù)文件名后綴自行判斷是 .xlsx 還是 .xls 文件并相應(yīng)讀?。?/p>

相對(duì)來說，方法3的執(zhí)行更簡便、速度較快、且占用資源少，推薦使用！

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