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機器學習開放課程(五):Bagging與隨機森林

 LibraryPKU 2019-02-11
來源:Medium
編譯:weakish

編者按:機器學習開放課程第五課,Mail.Ru數(shù)據(jù)科學家Yury Kashnitsky和You Scan數(shù)據(jù)科學家Vitaliy Radchenko深入淺出地介紹了集成、Bagging、隨機森林、特征重要性。

來源:Random Forest專輯

上一課,我們講述了不同的分類算法,以及驗證、評估模型的技術。

現(xiàn)在,假設你已經(jīng)為某一特定問題選中了最佳的模型,并在進一步提升其精確度上遇到了困難。在這一情形下,你將需要應用一些更高級的機器學習技術——集成(ensemble)

集成是一組協(xié)作貢獻的元素。一個熟悉的例子是合奏,組合不同的樂器創(chuàng)建動聽的和聲。在集成中,最終的整體輸出比任何單個部分的表現(xiàn)更重要。

概覽

  1. 集成

  2. Bootstraping

  3. Bagging

  4. 袋外誤差

  5. 隨機森林

  6. 特征重要性

  7. 相關資源

1. 集成

某種意義上,孔多塞陪審團定理描述了我們之前提到的集成。該定理的內(nèi)容為,如果評審團的每個成員做出獨立判斷,并且每個陪審員做出正確決策的概率高于0.5,那么整個評審團做出正確的總體決策的概率隨著陪審員數(shù)量的增加而增加,并趨向于一。另一方面,如果每個陪審員判斷正確的概率小于0.5,那么整個陪審團做出正確的總體決策的概率隨著陪審員數(shù)量的增加而減少,并趨向于零。

該定理形式化的表述為:

  • N為陪審員總數(shù);

  • m是構成多數(shù)的最小值,即m = (N+1)/2;

  • p為評審員做出正確決策的概率;

  • μ是整個評審團做出正確決策的概率。

則:

由上式可知,若p > 0.5,則μ > p。此外,若N -> ∞,則μ -> 1。

讓我們看另一個集成的例子:群體的智慧。1906年,F(xiàn)rancis Galton訪問了普利茅斯的一個農(nóng)村集市,在那里他看到一項競賽。800個參與者嘗試估計一頭屠宰的牛的重量。真實重量為1198磅。盡管沒人猜中這一數(shù)值,所有參與者的預測的平均值為1197磅。

機器學習領域采用類似的思路以降低誤差。

2. Bootstraping

Leo Breiman于1994年提出的Bagging(又稱Bootstrap aggregation,引導聚集)是最基本的集成技術之一。Bagging基于統(tǒng)計學中的bootstraping(自助法),該方法使得評估許多復雜模型的統(tǒng)計數(shù)據(jù)更可行。

bootstrap方法的流程如下:假設有尺寸為N的樣本X。我們可以從該樣本中有放回地隨機均勻抽取N個樣本,以創(chuàng)建一個新樣本。換句話說,我們從尺寸為N的原樣本中隨機選擇一個元素,并重復此過程N次。選中所有元素的可能性是一樣的,因此每個元素被抽中的概率均為1/N。

假設我們從一個袋子中抽球,每次抽一個。在每一步中,將選中的球放回袋子,這樣下一次抽取是等概率的,即,從同樣數(shù)量的N個球中抽取。注意,因為我們把球放回了,新樣本中可能有重復的球。讓我們把這個新樣本稱為X1。

重復這一過程M次,我們創(chuàng)建M個bootstrap樣本X1,……,XM。最后,我們有了足夠數(shù)量的樣本,可以計算原始分布的多種統(tǒng)計數(shù)據(jù)。

讓我們看一個例子,我們將使用之前的telecom_churn數(shù)據(jù)集。我們曾經(jīng)討論過這一數(shù)據(jù)集的特征重要性,其中最重要的特征之一是呼叫客服次數(shù)。讓我們可視化這一數(shù)據(jù),看看該特征的分布。

  1. import pandas as pd

  2. from matplotlib import pyplot as plt

  3. plt.style.use('ggplot')

  4. plt.rcParams['figure.figsize'] = 10, 6

  5. import seaborn as sns

  6. %matplotlib inline

  7. telecom_data = pd.read_csv('../../data/telecom_churn.csv')

  8. fig = sns.kdeplot(telecom_data[telecom_data['Churn'] == False]['Customer service calls'],

  9.                  label = 'Loyal')

  10. fig = sns.kdeplot(telecom_data[telecom_data['Churn'] == True]['Customer service calls'],

  11.                  label = 'Churn')        

  12. fig.set(xlabel='Number of calls', ylabel='Density')    

  13. plt.show()

如你所見,相比那些逐漸離網(wǎng)的客戶,忠實客戶呼叫客服的次數(shù)更少。估計每組客戶的平均呼叫客服數(shù)可能是個好主意。由于我們的數(shù)據(jù)集很小,如果直接計算原樣本的均值,我們得到的估計可能不好。因此我們將應用bootstrap方法。讓我們基于原樣本生成1000新bootstrap樣本,然后計算均值的區(qū)間估計。

  1. import numpy as np

  2. def get_bootstrap_samples(data, n_samples):

  3.    '''使用bootstrap方法生成bootstrap樣本。'''

  4.    indices = np.random.randint(0, len(data), (n_samples, len(data)))

  5.    samples = data[indices]

  6.    return samples

  7. def stat_intervals(stat, alpha):

  8.    '''生成區(qū)間估計。'''

  9.    boundaries = np.percentile(stat, [100 * alpha / 2., 100 * (1 - alpha / 2.)])

  10.    return boundaries

分割數(shù)據(jù)集,分組為忠實客戶和離網(wǎng)客戶:

  1. loyal_calls = telecom_data[telecom_data['Churn']

  2.                           == False]['Customer service calls'].values

  3. churn_calls= telecom_data[telecom_data['Churn']

  4.                           == True]['Customer service calls'].values

固定隨機數(shù)種子,以得到可重現(xiàn)的結果。

  1. np.random.seed(0)

使用bootstrap生成樣本,計算各自的均值。

  1. loyal_mean_scores = [np.mean(sample)

  2.                       for sample in get_bootstrap_samples(loyal_calls, 1000)]

  3. churn_mean_scores = [np.mean(sample)

  4.                       for sample in get_bootstrap_samples(churn_calls, 1000)]

打印區(qū)間估計值。

  1. print('忠實客戶呼叫客服數(shù): 均值區(qū)間',

  2.      stat_intervals(loyal_mean_scores, 0.05))

  3. print('離網(wǎng)客戶呼叫客服數(shù):均值區(qū)間',

  4.      stat_intervals(churn_mean_scores, 0.05))

結果:

  1. 忠實客戶呼叫客服數(shù): 均值區(qū)間 [1.4077193 1.49473684]

  2. 離網(wǎng)客戶呼叫客服數(shù):均值區(qū)間 [2.0621118 2.39761905]

因此,我們看到,有95%的概率,忠實客戶平均呼叫客服的次數(shù)在1.4到1.49之間,而離網(wǎng)客戶平均呼叫客服的次數(shù)在2.06到2.40之間。另外,注意忠實客戶的區(qū)間更窄,這是合理的,因為,相比多次呼叫客服,最終受夠了轉換運營商的離網(wǎng)客戶,忠實客戶呼叫客服的次數(shù)更少(0、1、2)。

3. Bagging

理解了bootstrap概念之后,我們來介紹bagging。

假設我們有一個訓練集X。我們使用bootstrap生成樣本X1, ..., XM。現(xiàn)在,我們在每個bootstrap樣本上分別訓練分類器ai(x)。最終分類器將對所有這些單獨的分類器的輸出取均值。在分類情形下,該技術對應投票(voting):

在回歸問題中,通過對回歸結果取均值,bagging將均方誤差降至1/M(M為回歸器數(shù)量)。

回顧一下上一課的內(nèi)容,模型的預測誤差有三部分構成:

bagging通過在不同數(shù)據(jù)集上訓練模型降低分類器的方差。換句話說,bagging可以預防過擬合。bagging的有效性來自不同訓練數(shù)據(jù)集上單獨模型的不同,它們的誤差在投票過程中相互抵消。此外,某些bootstrap訓練樣本很可能略去離散值。

讓我們看下bagging的實際效果,并與決策樹比較下。我們將使用sklearn文檔中的一個例子。

從上圖可以看到,就bagging而言,誤差中的方差顯著降低了。

上面的例子不太可能在實際工作中出現(xiàn)。因為我們做了一個很強的假定,單獨誤差是不相關的。對現(xiàn)實世界的應用而言,這經(jīng)常是過于樂觀了。當這個假定為假時,誤差的下降不會那么顯著。在后續(xù)課程中,我們將討論一些更復雜的集成方法,能夠在現(xiàn)實世界的問題中做出更精確的預測。

4. 袋外誤差

隨機森林不需要使用交叉驗證或留置樣本,因為在這一集成技術內(nèi)置了誤差估計。

隨機森林中的決策樹基于原始數(shù)據(jù)集中不同的bootstrap樣本構建。對第K棵樹而言,其特定bootstrap樣本大約留置了37%的輸入。

這很容易證明。設數(shù)據(jù)集中有l個樣本。在每一步,每個數(shù)據(jù)點最終出現(xiàn)在有放回的bootstrap樣本中的概率均為1/l。bootstrap樣本最終不包含特定數(shù)據(jù)集元素的概率(即,該元素在l次抽取中都沒抽中)等于(1 - 1/l)l。當l -> +∞時,這一概率等于1/e。因此,選中某一特定樣本的概率為1 - 1/e,約等于63%。

下面讓我們可視化袋外誤差(Out-of-Bag Error,OOBE)估計是如何工作的:

示意圖上方為原始數(shù)據(jù)集。我們將其分為訓練集(左)和測試集(右)。在測試集上,我們繪制一副網(wǎng)格,完美地實施了分類?,F(xiàn)在,我們應用同一副網(wǎng)格于測試集,以估計分類的正確率。我們可以看到,分類器在4個未曾在訓練中使用的數(shù)據(jù)點上給出了錯誤的答案。而測試集中共有15個數(shù)據(jù)點,這15個數(shù)據(jù)點未在訓練中使用。因此,我們的分類器的精確度為11/15 * 100% = 73.33%.

總結一下,每個基礎算法在約63%的原始樣本上訓練。該算法可以在剩下的約37%的樣本上驗證。袋外估計不過是基礎算法在訓練過程中留置出來的約37%的輸入上的平均估計。

5. 隨機森林

Leo Breiman不僅將bootstrap應用于統(tǒng)計,同時也將其應用于機器學習。他和Adel Cutler擴展并改進了Tin Kam Ho提出的的隨機森林算法。他們組合使用CART、bagging、隨機子空間方法構建無關樹。

在bagging中,決策樹是一個基礎分類器的好選項,因為它們相當復雜,并能在任何樣本上達到零分類誤差。隨機子空間方法降低樹的相關性,從而避免過擬合?;赽agging,基礎算法在不同的原始特征集的隨機子集上訓練。

以下算法使用隨機子空間方法構建模型集成:

  1. 設樣本數(shù)等于n,特征維度數(shù)等于d。

  2. 選擇集成中單個模型的數(shù)目M。

  3. 對于每個模型m,選擇特征數(shù)dm < d。所有模型使用相同的dm值。

  4. 對每個模型m,通過在整個d特征集合上隨機選擇dm個特征創(chuàng)建一個訓練集。

  5. 訓練每個模型。

  6. 通過組合M中的所有模型的結果,應用所得集成模型于新輸入??梢允褂么蠖鄶?shù)投票(majority voting)或后驗概率加總(aggregation of the posterior probabilities)。

5.1 算法

構建N樹隨機森林的算法如下:

對每個k = 1, ..., N

  • 生成bootstrap樣本Xk。

  • 在樣本Xk上創(chuàng)建一棵決策樹bk

    • 根據(jù)給定的標準選擇最佳的特征維度。根據(jù)該特征分割樣本以創(chuàng)建樹的新層次。重復這一流程,直到竭盡樣本。

    • 創(chuàng)建樹,直到任何葉節(jié)點包含不超過nmin個實例,或者達到特定深度。

    • 對每個分割,我們首先從d個原始特征中隨機選擇m個特征,接著只在該子集上搜索最佳分割。

最終分類器定義為:

分類問題使用多數(shù)投票,回歸問題使用均值。

在分類問題中,建議將m設定為d的平方根,取nmin = 1?;貧w問題中,一般取m = d/3,nmin = 5

你可以將隨機森林看成決策樹bagging加上一個改動,在每個分割處選擇一個隨機特征子空間。

5.2 與決策樹和bagging的比較

導入所需包,配置環(huán)境:

  1. import warnings

  2. import numpy as np

  3. warnings.filterwarnings('ignore')

  4. %matplotlib inline

  5. from matplotlib import pyplot as plt

  6. plt.style.use('ggplot')

  7. plt.rcParams['figure.figsize'] = 10, 6

  8. import seaborn as sns

  9. from sklearn.ensemble import RandomForestRegressor, RandomForestClassifier

  10. from sklearn.ensemble import BaggingClassifier, BaggingRegressor

  11. from sklearn.tree import DecisionTreeRegressor, DecisionTreeClassifier

  12. from sklearn.datasets import make_circles

  13. from sklearn.model_selection import train_test_split

  14. n_train = 150        

  15. n_test = 1000      

  16. noise = 0.1

生成數(shù)據(jù):

  1. def f(x):

  2.    x = x.ravel()

  3.    return np.exp(-x ** 2) + 1.5 * np.exp(-(x - 2) ** 2)

  4. def generate(n_samples, noise):

  5.    X = np.random.rand(n_samples) * 10 - 5

  6.    X = np.sort(X).ravel()

  7.    y = np.exp(-X ** 2) + 1.5 * np.exp(-(X - 2) ** 2)\

  8.        + np.random.normal(0.0, noise, n_samples)

  9.    X = X.reshape((n_samples, 1))

  10.    return X, y

  11. X_train, y_train = generate(n_samples=n_train, noise=noise)

  12. X_test, y_test = generate(n_samples=n_test, noise=noise)

單棵決策樹回歸:

  1. dtree = DecisionTreeRegressor().fit(X_train, y_train)

  2. d_predict = dtree.predict(X_test)

  3. plt.figure(figsize=(10, 6))

  4. plt.plot(X_test, f(X_test), 'b')

  5. plt.scatter(X_train, y_train, c='b', s=20)

  6. plt.plot(X_test, d_predict, 'g', lw=2)

  7. plt.xlim([-5, 5])

  8. plt.title('Decision tree, MSE = %.2f'

  9.          % np.sum((y_test - d_predict) ** 2))

決策樹回歸bagging:

  1. bdt = BaggingRegressor(DecisionTreeRegressor()).fit(X_train, y_train)

  2. bdt_predict = bdt.predict(X_test)

  3. plt.figure(figsize=(10, 6))

  4. plt.plot(X_test, f(X_test), 'b')

  5. plt.scatter(X_train, y_train, c='b', s=20)

  6. plt.plot(X_test, bdt_predict, 'y', lw=2)

  7. plt.xlim([-5, 5])

  8. plt.title('Bagging for decision trees, MSE = %.2f' % np.sum((y_test - bdt_predict) ** 2));

隨機森林:

  1. rf = RandomForestRegressor(n_estimators=10).fit(X_train, y_train)

  2. rf_predict = rf.predict(X_test)

  3. plt.figure(figsize=(10, 6))

  4. plt.plot(X_test, f(X_test), 'b')

  5. plt.scatter(X_train, y_train, c='b', s=20)

  6. plt.plot(X_test, rf_predict, 'r', lw=2)

  7. plt.xlim([-5, 5])

  8. plt.title('Random forest, MSE = %.2f' % np.sum((y_test - rf_predict) ** 2));

從上面的圖像和MSE值可以看到,10樹隨機森林比單棵決策樹和10樹bagging的表現(xiàn)要好。(譯者注:實際上,在這個例子中,隨機森林的表現(xiàn)并不穩(wěn)定,多次運行的結果是,隨機森林和bagging互有勝負。)隨機森林和bagging的主要差別在于,在隨機森林中,分割的最佳特征是從一個隨機特征子空間中選取的,而在bagging中,分割時將考慮所有特征。

接下來,我們將查看隨機森林和bagging在分類問題上的表現(xiàn):

  1. np.random.seed(42)

  2. X, y = make_circles(n_samples=500, factor=0.1, noise=0.35, random_state=42)

  3. X_train_circles, X_test_circles, y_train_circles, y_test_circles = train_test_split(X, y, test_size=0.2)

  4. dtree = DecisionTreeClassifier(random_state=42)

  5. dtree.fit(X_train_circles, y_train_circles)

  6. x_range = np.linspace(X.min(), X.max(), 100)

  7. xx1, xx2 = np.meshgrid(x_range, x_range)

  8. y_hat = dtree.predict(np.c_[xx1.ravel(), xx2.ravel()])

  9. y_hat = y_hat.reshape(xx1.shape)

  10. plt.contourf(xx1, xx2, y_hat, alpha=0.2)

  11. plt.scatter(X[:,0], X[:,1], c=y, cmap='autumn')

  12. plt.title('Decision tree')

  13. plt.show()

  14. b_dtree = BaggingClassifier(DecisionTreeClassifier(),n_estimators=300, random_state=42)

  15. b_dtree.fit(X_train_circles, y_train_circles)

  16. x_range = np.linspace(X.min(), X.max(), 100)

  17. xx1, xx2 = np.meshgrid(x_range, x_range)

  18. y_hat = b_dtree.predict(np.c_[xx1.ravel(), xx2.ravel()])

  19. y_hat = y_hat.reshape(xx1.shape)

  20. plt.contourf(xx1, xx2, y_hat, alpha=0.2)

  21. plt.scatter(X[:,0], X[:,1], c=y, cmap='autumn')

  22. plt.title('Bagging (decision trees)')

  23. plt.show()

  24. rf = RandomForestClassifier(n_estimators=300, random_state=42)

  25. rf.fit(X_train_circles, y_train_circles)

  26. x_range = np.linspace(X.min(), X.max(), 100)

  27. xx1, xx2 = np.meshgrid(x_range, x_range)

  28. y_hat = rf.predict(np.c_[xx1.ravel(), xx2.ravel()])

  29. y_hat = y_hat.reshape(xx1.shape)

  30. plt.contourf(xx1, xx2, y_hat, alpha=0.2)

  31. plt.scatter(X[:,0], X[:,1], c=y, cmap='autumn')

  32. plt.title('Random forest')

  33. plt.show()

上圖顯示了決策樹判定的邊界相當凹凸不平,有大量銳角,這暗示了過擬合,概括性差。相反,隨機森林和bagging的邊界相當平滑,沒有明顯的過擬合的跡象。

現(xiàn)在,讓我們查看一些有助于提高模型精確度的參數(shù)。

5.3 參數(shù)

scikit-learn庫提供了BaggingRegressorBaggingClassifier。

下面是創(chuàng)建新模型時需要注意的一些參數(shù):

  • n_estimators是森林中樹的數(shù)量;

  • criterion是衡量分割質(zhì)量的函數(shù);

  • max_features是查找最佳分割時考慮的特征數(shù);

  • min_samples_leaf是葉節(jié)點的最小樣本數(shù);

  • max_depth是樹的最大深度。

在真實問題中練習隨機森林

我們將使用之前的離網(wǎng)預測作為例子。這是一個分類問題,我們將使用精確度評估模型。

  1. import pandas as pd

  2. from sklearn.model_selection import cross_val_score, StratifiedKFold, GridSearchCV

  3. from sklearn.metrics import accuracy_score

  4. df = pd.read_csv('../../data/telecom_churn.csv')

首先,讓我們創(chuàng)建一個簡單的分類器作為基線。出于簡單性,我們將只使用數(shù)值特征。

  1. cols = []

  2. for i in df.columns:

  3.    if (df[i].dtype == 'float64') or (df[i].dtype == 'int64'):

  4.        cols.append(i)

分離數(shù)據(jù)集為輸入和目標:

  1. X, y = df[cols].copy(), np.asarray(df['Churn'],dtype='int8')

為驗證過程進行分層分割:

  1. skf = StratifiedKFold(n_splits=5, shuffle=True, random_state=42)

基于默認參數(shù)初始化分類器:

  1. rfc = RandomForestClassifier(random_state=42, n_jobs=-1, oob_score=True)

在訓練集上進行訓練:

  1. results = cross_val_score(rfc, X, y, cv=skf)

在測試集上評估精確度:

  1. print('交叉驗證精確度評分: {:.2f}%'.format(results.mean()*100))

結果:

  1. 交叉驗證精確度評分:91.48%

現(xiàn)在,讓我們嘗試改進結果,同時查看下修改基本參數(shù)時學習曲線的表現(xiàn)。

讓我們從樹的數(shù)量開始:

  1. skf = StratifiedKFold(n_splits=5, shuffle=True, random_state=42)

創(chuàng)建列表儲存訓練集和測試集上的精確度數(shù)值:

  1. train_acc = []

  2. test_acc = []

  3. temp_train_acc = []

  4. temp_test_acc = []

進行網(wǎng)格搜索:

  1. trees_grid = [5, 10, 15, 20, 30, 50, 75, 100]

在訓練集上訓練:

  1. for ntrees in trees_grid:

  2.    rfc = RandomForestClassifier(n_estimators=ntrees, random_state=42, n_jobs=-1, oob_score=True)

  3.    temp_train_acc = []

  4.    temp_test_acc = []

  5.    for train_index, test_index in skf.split(X, y):

  6.        X_train, X_test = X.iloc[train_index], X.iloc[test_index]

  7.        y_train, y_test = y[train_index], y[test_index]

  8.        rfc.fit(X_train, y_train)

  9.        temp_train_acc.append(rfc.score(X_train, y_train))

  10.        temp_test_acc.append(rfc.score(X_test, y_test))

  11.    train_acc.append(temp_train_acc)

  12.    test_acc.append(temp_test_acc)

打印結果:

  1. train_acc, test_acc = np.asarray(train_acc), np.asarray(test_acc)

  2. print('交叉驗證最佳精確度為 {:.2f}% 在 {} 樹時達到'.format(max(test_acc.mean(axis=1))*100,

  3.                                                        trees_grid[np.argmax(test_acc.mean(axis=1))]))

結果:

  1. 交叉驗證最佳精確度為 92.44% 在 50 樹時達到

接下來,我們繪制相應的學習曲線:

  1. plt.style.use('ggplot')

  2. fig, ax = plt.subplots(figsize=(8, 4))

  3. ax.plot(trees_grid, train_acc.mean(axis=1), alpha=0.5, color='blue', label='train')

  4. ax.plot(trees_grid, test_acc.mean(axis=1), alpha=0.5, color='red', label='cv')

  5. ax.fill_between(trees_grid, test_acc.mean(axis=1) - test_acc.std(axis=1), test_acc.mean(axis=1) + test_acc.std(axis=1), color='#888888', alpha=0.4)

  6. ax.fill_between(trees_grid, test_acc.mean(axis=1) - 2*test_acc.std(axis=1), test_acc.mean(axis=1) + 2*test_acc.std(axis=1), color='#888888', alpha=0.2)

  7. ax.legend(loc='best')

  8. ax.set_ylim([0.88,1.02])

  9. ax.set_ylabel('Accuracy')

  10. ax.set_xlabel('N_estimators');

如你所見,當達到特定數(shù)量時,測試集上的精確度非常接近漸近線。

上圖同時顯示了我們在訓練集上達到了100%精確度,這意味著我們過擬合了。為了避免過擬合,我們需要給模型加上正則化參數(shù)。

下面我們將樹的數(shù)目固定為100,然后看看不同的max_depth效果如何:

  1. train_acc = []

  2. test_acc = []

  3. temp_train_acc = []

  4. temp_test_acc = []

  5. max_depth_grid = [3, 5, 7, 9, 11, 13, 15, 17, 20, 22, 24]

  6. for max_depth in max_depth_grid:

  7.    rfc = RandomForestClassifier(n_estimators=100, random_state=42, n_jobs=-1, oob_score=True, max_depth=max_depth)

  8.    temp_train_acc = []

  9.    temp_test_acc = []

  10.    for train_index, test_index in skf.split(X, y):

  11.        X_train, X_test = X.iloc[train_index], X.iloc[test_index]

  12.        y_train, y_test = y[train_index], y[test_index]

  13.        rfc.fit(X_train, y_train)

  14.        temp_train_acc.append(rfc.score(X_train, y_train))

  15.        temp_test_acc.append(rfc.score(X_test, y_test))

  16.    train_acc.append(temp_train_acc)

  17.    test_acc.append(temp_test_acc)

  18. train_acc, test_acc = np.asarray(train_acc), np.asarray(test_acc)

  19. print('交叉驗證最佳精確度為 {:.2f}% 當 max_depth 為 {} 時達到'.format(max(test_acc.mean(axis=1))*100,

  20.                                                        max_depth_grid[np.argmax(test_acc.mean(axis=1))]))

結果:

  1. 交叉驗證最佳精確度為 92.68% 當 max_depth 為 17 時達到

  1. fig, ax = plt.subplots(figsize=(8, 4))

  2. ax.plot(max_depth_grid, train_acc.mean(axis=1), alpha=0.5, color='blue', label='train')

  3. ax.plot(max_depth_grid, test_acc.mean(axis=1), alpha=0.5, color='red', label='cv')

  4. ax.fill_between(max_depth_grid, test_acc.mean(axis=1) - test_acc.std(axis=1), test_acc.mean(axis=1) + test_acc.std(axis=1), color='#888888', alpha=0.4)

  5. ax.fill_between(max_depth_grid, test_acc.mean(axis=1) - 2*test_acc.std(axis=1), test_acc.mean(axis=1) + 2*test_acc.std(axis=1), color='#888888', alpha=0.2)

  6. ax.legend(loc='best')

  7. ax.set_ylim([0.88,1.02])

  8. ax.set_ylabel('Accuracy')

  9. ax.set_xlabel('Max_depth');

max_depth在我們的模型中起到了正則化的作用,模型不像之前過擬合得那么嚴重了。模型精確度略有提升。

另一個值得調(diào)整的重要參數(shù)是min_samples_leaf,它也能起到正則化作用。

  1. train_acc = []

  2. test_acc = []

  3. temp_train_acc = []

  4. temp_test_acc = []

  5. min_samples_leaf_grid = [1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15, 17, 20, 22, 24]

  6. for min_samples_leaf in min_samples_leaf_grid:

  7.    rfc = RandomForestClassifier(n_estimators=100, random_state=42, n_jobs=-1,

  8.                                 oob_score=True, min_samples_leaf=min_samples_leaf)

  9.    temp_train_acc = []

  10.    temp_test_acc = []

  11.    for train_index, test_index in skf.split(X, y):

  12.        X_train, X_test = X.iloc[train_index], X.iloc[test_index]

  13.        y_train, y_test = y[train_index], y[test_index]

  14.        rfc.fit(X_train, y_train)

  15.        temp_train_acc.append(rfc.score(X_train, y_train))

  16.        temp_test_acc.append(rfc.score(X_test, y_test))

  17.    train_acc.append(temp_train_acc)

  18.    test_acc.append(temp_test_acc)

  19. train_acc, test_acc = np.asarray(train_acc), np.asarray(test_acc)

  20. print('交叉驗證最佳精確度為 {:.2f}% 當 min_samples_leaf 為 {} 時達到'.format(max(test_acc.mean(axis=1))*100,

  21.                                                        min_samples_leaf_grid[np.argmax(test_acc.mean(axis=1))]))

結果:

  1. 交叉驗證最佳精確度為 92.41% 當 min_samples_leaf 為 3 時達到

  1. fig, ax = plt.subplots(figsize=(8, 4))

  2. ax.plot(min_samples_leaf_grid, train_acc.mean(axis=1), alpha=0.5, color='blue', label='train')

  3. ax.plot(min_samples_leaf_grid, test_acc.mean(axis=1), alpha=0.5, color='red', label='cv')

  4. ax.fill_between(min_samples_leaf_grid, test_acc.mean(axis=1) - test_acc.std(axis=1), test_acc.mean(axis=1) + test_acc.std(axis=1), color='#888888', alpha=0.4)

  5. ax.fill_between(min_samples_leaf_grid, test_acc.mean(axis=1) - 2*test_acc.std(axis=1), test_acc.mean(axis=1) + 2*test_acc.std(axis=1), color='#888888', alpha=0.2)

  6. ax.legend(loc='best')

  7. ax.set_ylim([0.88,1.02])

  8. ax.set_ylabel('Accuracy')

  9. ax.set_xlabel('Min_samples_leaf');

在這一情形下,我們沒在驗證集上看到精確度提升,但在驗證集上精確度保持92%以上的同時,降低了2%的過擬合。

考慮max_features這一參數(shù)。在分類問題中,所有特征數(shù)的平方根是默認選擇。讓我們看下4個特征是否是這個例子中的最佳選擇:

  1. train_acc = []

  2. test_acc = []

  3. temp_train_acc = []

  4. temp_test_acc = []

  5. max_features_grid = [2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16]

  6. for max_features in max_features_grid:

  7.    rfc = RandomForestClassifier(n_estimators=100, random_state=42, n_jobs=-1,

  8.                                 oob_score=True, max_features=max_features)

  9.    temp_train_acc = []

  10.    temp_test_acc = []

  11.    for train_index, test_index in skf.split(X, y):

  12.        X_train, X_test = X.iloc[train_index], X.iloc[test_index]

  13.        y_train, y_test = y[train_index], y[test_index]

  14.        rfc.fit(X_train, y_train)

  15.        temp_train_acc.append(rfc.score(X_train, y_train))

  16.        temp_test_acc.append(rfc.score(X_test, y_test))

  17.    train_acc.append(temp_train_acc)

  18.    test_acc.append(temp_test_acc)

  19. train_acc, test_acc = np.asarray(train_acc), np.asarray(test_acc)

  20. print('交叉驗證最佳精確度為 {:.2f}% 當 max_features 為 {} 時達到'.format(max(test_acc.mean(axis=1))*100,

  21.                                                        max_features_grid[np.argmax(test_acc.mean(axis=1))]))

結果:

  1. 交叉驗證最佳精確度為 92.59% 當 max_features 為 10 時達到

  1. fig, ax = plt.subplots(figsize=(8, 4))

  2. ax.plot(max_features_grid, train_acc.mean(axis=1), alpha=0.5, color='blue', label='train')

  3. ax.plot(max_features_grid, test_acc.mean(axis=1), alpha=0.5, color='red', label='cv')

  4. ax.fill_between(max_features_grid, test_acc.mean(axis=1) - test_acc.std(axis=1), test_acc.mean(axis=1) + test_acc.std(axis=1), color='#888888', alpha=0.4)

  5. ax.fill_between(max_features_grid, test_acc.mean(axis=1) - 2*test_acc.std(axis=1), test_acc.mean(axis=1) + 2*test_acc.std(axis=1), color='#888888', alpha=0.2)

  6. ax.legend(loc='best')

  7. ax.set_ylim([0.88,1.02])

  8. ax.set_ylabel('Accuracy')

  9. ax.set_xlabel('Max_features');

在我們的例子中,最佳特征數(shù)是10。

我們已經(jīng)查看了基本參數(shù)的不同值的學習曲線。下面讓我們使用GridSearch查找最佳參數(shù):

  1. parameters = {'max_features': [4, 7, 10, 13], 'min_samples_leaf': [1, 3, 5, 7], 'max_depth': [5,10,15,20]}

  2. rfc = RandomForestClassifier(n_estimators=100, random_state=42,

  3.                             n_jobs=-1, oob_score=True)

  4. gcv = GridSearchCV(rfc, parameters, n_jobs=-1, cv=skf, verbose=1)

  5. gcv.fit(X, y)

  6. gcv.best_estimator_, gcv.best_score_

返回:

  1. (RandomForestClassifier(bootstrap=True, class_weight=None, criterion='gini',

  2.             max_depth=10, max_features=10, max_leaf_nodes=None,

  3.             min_impurity_decrease=0.0, min_impurity_split=None,

  4.             min_samples_leaf=1, min_samples_split=2,

  5.             min_weight_fraction_leaf=0.0, n_estimators=100, n_jobs=-1,

  6.             oob_score=True, random_state=42, verbose=0, warm_start=False),

  7. 0.9270927092709271)

隨機森林最重要的一點是它的精確度不會隨著樹的增加而下降,所以樹的數(shù)量不像max_depth和min_samples_leaf那樣錯綜復雜。這意味著你可以使用,比如說,10棵樹調(diào)整超參數(shù),接著增加樹的數(shù)量至500,放心,精確度只會更好。

5.4 方差和去相關

隨機森林的方差可以用下式表達:

其中

  • p(x)為任何兩棵樹之間的樣本相關性;

  • Θ1(Z)Θ2(Z)為樣本Z上隨機選擇的元素上隨機選擇的一對樹;

  • T(x, Θi(Z))為第i個樹分類器在輸入向量x上的輸出;

  • σ2(x)為任何隨機選擇的樹上的樣本方差:

很容易將p(x)誤認為給定的隨機森林中訓練好的樹的平均相關性(將樹視為N維向量)。其實并非如此。

事實上,這一條件相關性并不和平均過程直接相關,p(x)的自變量x提醒了我們這一差別。p(x)是一對隨機樹在輸入x上的估計的理論相關性。它的值源自重復取樣訓練集以及之后隨機選擇的決策樹對。用統(tǒng)計學術語來說,這是由ZΘ取樣分布導致的相關性。

任何一對樹的條件相關性等于0,因為bootstrap和特征選取是獨立同分布。

如果我們考慮單棵樹的方差,它幾乎不受分割參數(shù)的影響(m)。但這一參數(shù)在集成中是關鍵。另外,單棵決策樹的方差要比集成高很多。The Elements of Statistical Learning一書中有一個很好的例子:

5.5 偏差

隨機森林、bagging的偏差和單棵決策樹一樣:

從絕對值上說,偏差通常比單棵樹要大,因為隨機過程和樣本空間縮減在模型上施加了它們各自的限制。因此,bagging和隨機森林在預測精確度上的提升單純源自方差降低。

5.6 極端隨機樹

極端隨機樹(Extremely Randomized Trees)在節(jié)點分岔時應用了更多隨機性。和隨機森林一樣,極端隨機樹使用一個隨機特征子空間。然而,極端隨機數(shù)并不搜尋最佳閾值,相反,為每個可能的特征隨機生成一個閾值,然后根據(jù)其中最佳隨機生成閾值對應的特征來分割節(jié)點。這通常是用少量偏差的增加交換方差的略微下降。

scikit-learn庫實現(xiàn)了[ ExtraTreesClassifier]和ExtraTreesRegressor。

如果你使用隨機森林或梯度提升遇到了嚴重的過擬合,可以試試極端隨機樹。

5.7 隨機森林和k近鄰的相似性

隨機森林和最近鄰技術有相似之處。隨機森林預測基于訓練集中相似樣本的標簽。這些樣本越常出現(xiàn)在同一葉節(jié)點,它們的相似度就越高。下面我們將證明這一點。

讓我們考慮一個二次損失函數(shù)的回歸問題。設Tn(x)為輸入x在隨機森林中第n棵樹的葉節(jié)點數(shù)。算法對輸入向量x的響應等于所有落入葉節(jié)點Tn(x)的訓練樣本的平均響應。

其中

故響應的構成為:

如你所見,隨機森林的響應為所有訓練樣本響應的加權和。

同時,值得注意的是,實例x最終出現(xiàn)的葉節(jié)點數(shù)Tn(x),本身是一個有價值的特征。例如,下面的方法效果不錯:

  1. 基于隨機森林或梯度提升技術在樣本上訓練較小數(shù)目的決策樹的復合模型

  2. 將類別特征T1(x),...,Tn(x)加入樣本

這些新特征是非線性空間分割的結果,它們提供了關于樣本之間的相似性的信息。The Elements of Statistical Learning一書中有一個很好的說明樣例,演示了隨機森林和k-近鄰技術的相似性:

5.8 轉換數(shù)據(jù)集為高維表示

隨機森林主要用于監(jiān)督學習,不過也可以在無監(jiān)督設定下應用。

使用scikit-learn的RandomTreesEmbedding方法,我們可以將數(shù)據(jù)集轉換為高維的稀疏表示。我們首先創(chuàng)建一些極端隨機樹,接著使用包含樣本的葉節(jié)點索引作為新特征。

例如,如果第一個葉節(jié)點包含輸入,我們分配1為特征值,否則,分配0. 這稱為二進制編碼(binary coding)。我們可以通過增減樹的數(shù)目和深度控制特征數(shù)量和稀疏性。由于鄰居的數(shù)據(jù)點傾向于落入同一葉節(jié)點,這一轉換提供了對數(shù)據(jù)點的密度的一個隱式的非參數(shù)估計。

5.9 隨機森林的優(yōu)勢和劣勢

優(yōu)勢:

  • 高預測精確度;在大多數(shù)問題上表現(xiàn)優(yōu)于線性算法;精確度與boosting相當;

  • 多虧了隨機取樣,對離散值的魯棒性較好;

  • 隨機子空間選取導致對特征縮放及其他單調(diào)轉換不敏感;

  • 不需要精細的參數(shù)調(diào)整,開箱即用。取決于問題設定和數(shù)據(jù),調(diào)整參數(shù)可能取得0.5%到3%的精確度提升;

  • 在具有大量特征和分類的數(shù)據(jù)集上很高效;

  • 既可處理連續(xù)值,也可處理離散值;

  • 罕見過擬合。在實踐中,增加樹的數(shù)量幾乎總是能提升總體表現(xiàn)。不過,當達到特定數(shù)量后,學習曲線非常接近漸近線;

  • 有成熟方法用于估計特征重要性;

  • 能夠很好地處理數(shù)據(jù)缺失,即使當很大一部分數(shù)據(jù)缺失時,仍能保持較好的精確度;

  • 支持整個數(shù)據(jù)集及單棵樹樣本上的加權分類;

  • 決策樹底層使用的實例親近性計算可以在后續(xù)用于聚類、檢測離散值、感興趣數(shù)據(jù)表示;

  • 以上功能和性質(zhì)可以擴展到未標注數(shù)據(jù),以支持無監(jiān)督聚類,數(shù)據(jù)可視化和離散值檢測;

  • 易于并行化,伸縮性強。

劣勢:

  • 相比單棵決策樹,隨機森林的輸出更難解釋。

  • 特征重要性估計沒有形式化的p值。

  • 在稀疏數(shù)據(jù)情形(比如,文本輸入、詞袋)下,表現(xiàn)不如線性模型好。

  • 和線性回歸不同,隨機森林無法外推。不過,這也可以看成優(yōu)勢,因為離散值不會在隨機森林中導致極端值。

  • 在某些問題上容易過擬合,特別是處理高噪聲數(shù)據(jù)。

  • 處理數(shù)量級不同的類別數(shù)據(jù)時,隨機森林偏重數(shù)量級較高的變量,因為這能提高更多精確度;

  • 如果數(shù)據(jù)集包含對預測分類重要度相似的相關特征分組,那么隨機森林將偏重較小的分組;

  • 所得模型較大,需要大量RAM。

6. 特征重要性

我們常常需要給出算法輸出某個特定答案的原因?;蛘?,在不能完全理解算法的情況下,我們至少想要找出哪個輸入特征對結果的貢獻最大?;陔S機森林,我們可以相當容易地獲取這類信息。

方法精要

下圖很直觀地呈現(xiàn)了,在我們的信用評分問題中,年齡比收入更重要?;?a target='_blank'>信息增益這一概念,我們可以形式化地解釋這一點。

在隨機森林中,某一特征在所有樹中離樹根的平均距離越近,這一特征在給定的分類或回歸問題中就越重要。按照分割標準,在每棵樹的每處最優(yōu)分割中取得的增益,例如基尼不純度(Gini impurity),是與分割特征直接相關的重要度測度。每個特征的評分值不同(通過累加所有樹得出)。

讓我們深入一些細節(jié)。

某個變量導致的平均精確度下降可以通過計算袋外誤差判定。由于除外或選定某一變量導致的精確度下降約大,該變量的重要性評分(importance score)就越高。

基尼不純度——或回歸問題中的MSE——的平均下降代表每個變量對所得隨機森林模型節(jié)點的同質(zhì)性的貢獻程度。每次選中一個變量進行分割時,計算子節(jié)點的基尼不純度,并與原節(jié)點進行比較。

基尼不純度是位于0(同質(zhì))到1(異質(zhì))之間的同質(zhì)性評分。為每個變量累加分割標準對應值的變動,并在計算過程的最后加以正則化?;岵患兌认陆递^高標志著基于該變量進行的分割可以得到純度更高的節(jié)點。

以上可以用分析形式表達為:

其中,πj表示選中或排除特征。當xj不在樹T中時,VIT(xj) = 0。

現(xiàn)在,我們可以給出集成的特征重要性計算公式。

  • 未經(jīng)正則化:

  • 使用標準差正則化后:

實際操作例子

讓我們考慮一項調(diào)查結果,關于Booking.com和TripAdvisor.com上列出的旅館。這里的特征是不同類別(包括服務質(zhì)量、房間狀況、性價比等)的平均評分。目標變量為旅館在網(wǎng)站上的總評分。

  1. import warnings

  2. warnings.filterwarnings('ignore')

  3. %matplotlib inline

  4. from matplotlib import pyplot as plt

  5. import seaborn as sns

  6. from matplotlib import rc

  7. font = {'family': 'Verdana',

  8.        'weight': 'normal'}

  9. rc('font', **font)

  10. import pandas as pd

  11. import numpy as np

  12. from sklearn.ensemble.forest import RandomForestRegressor

  13. hostel_data = pd.read_csv('../../data/hostel_factors.csv')

  14. features = {'f1':u'Staff',

  15. 'f2':u'Hostel booking',

  16. 'f3':u'Check-in and check-out',

  17. 'f4':u'Room condition',

  18. 'f5':u'Shared kitchen condition',

  19. 'f6':u'Shared space condition',

  20. 'f7':u'Extra services',

  21. 'f8':u'General conditions & conveniences',

  22. 'f9':u'Value for money',

  23. 'f10':u'Customer Co-creation'}

  24. forest = RandomForestRegressor(n_estimators=1000, max_features=10,

  25.                                random_state=0)

  26. forest.fit(hostel_data.drop(['hostel', 'rating'], axis=1),

  27.           hostel_data['rating'])

  28. importances = forest.feature_importances_

  29. indices = np.argsort(importances)[::-1]

  30. num_to_plot = 10

  31. feature_indices = [ind+1 for ind in indices[:num_to_plot]]

  32. plt.figure(figsize=(15,5))

  33. plt.title(u'Feature Importance')

  34. bars = plt.bar(range(num_to_plot),

  35.               importances[indices[:num_to_plot]],

  36.       color=([str(i/float(num_to_plot+1))

  37.               for i in range(num_to_plot)]),

  38.               align='center')

  39. ticks = plt.xticks(range(num_to_plot),

  40.                   feature_indices)

  41. plt.xlim([-1, num_to_plot])

  42. plt.legend(bars, [u''.join(features['f'+str(i)])

  43.                  for i in feature_indices]);

上圖顯示,消費者常常更為關心服務人員和性價比。這兩個因子對最終評分的影響最大。然而,這兩項特征和其他特征的差別不是非常大。因此,排除任何特征都會導致模型精確度的下降。基于我們的分析,我們可以建議旅館業(yè)主重點關注服務人員培訓和性價比。

7. 相關資源

  • Jerome H. Friedman、Robert Tibshirani、Trevor Hastie著Elements of Statistical Learning第15章。

  • scikit-learn庫的官方文檔提供了更多關于隨機森林和其他集成算法的應用示例。

  • 如果想要深入了解隨機森林的方差和去相關,請參閱原始論文。

原文地址:https:///open-machine-learning-course/open-machine-learning-course-topic-5-ensembles-of-algorithms-and-random-forest-8e05246cbba7

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