《針灸甲乙經(jīng)》是我國現(xiàn)存?zhèn)魇雷钤绲囊徊酷樉膶Ｖ彩亲钤缱疃嗟厥占驼砉糯樉馁Y料的重要文獻。《針灸甲乙經(jīng)》共10卷，128篇。內(nèi)容涉及臟腑、經(jīng)絡、隃穴、病機、診斷、治療等。書中校正了當時的腧穴總數(shù)654個（包括單穴48個），記述了各部穴位的適應證和禁忌，說明了各種操作方法。這是我國現(xiàn)存最早的一部理論聯(lián)系實際、有重大價值的針灸學專著，一向被列為學醫(yī)必讀的古典醫(yī)書之一，皇甫謐也因此被人們做“中醫(yī)針灸學之祖”。唐代醫(yī)學家王燾評價它“是醫(yī)人之秘寶，后之學者，宣遵用之”。此書間世之后，唐代醫(yī)署始設針灸科，并把它作為醫(yī)生必修的教材。晉代以后的許多針灸學專著大都是在參考此書的基礎上編撰來的，內(nèi)容也都沒有超出它的范圍。此書也傳到國外，受到各國特別是日本和朝鮮的重視。公元701年，日本法令《大寶律令》明確規(guī)定《針灸甲乙經(jīng)》列為必讀的參考書之一，足見皇甫謐的《針灸甲乙經(jīng)》影響之深遠皇甫謐灸法理論有以下幾點。
（一）詳述施灸壯數(shù)
     《針灸甲乙經(jīng)》對施灸壯數(shù)，一般每次為3～5壯，其中，頭、面、頸、肩、背等處，多為灸3壯；腦、腋、腹部，多為灸5壯；最小者為井穴，只灸1壯；最多者為大椎穴等，灸9壯；個別穴位如環(huán)跳等，灸50壯?！夺樉募滓医?jīng)》第三卷，還提到“欲令灸瘡發(fā)者，灸復熨之，三日即發(fā)”。說明已運用發(fā)泡化膿灸法。
（二）詳列禁灸的穴位
     《針灸甲乙經(jīng)》還提出禁灸穴位，指出誤灸的不良后果，并提到誤灸引起不良后果的穴位有29個，《針灸禁忌第一》中提到，“頭維禁不可灸，承光禁不可灸，腦戶禁不可灸，風府禁不可灸，瘠門禁不可灸（灸之令人落），下關耳中有干適抵，禁不可灸（下關耳中有干適低無灸），耳門耳中有膿及適抵，禁不可灸，人迎禁不可條，絲竹空灸之不幸令人目小或盲承泣禁不可灸，脊中禁不可灸（灸之使入僂），白環(huán)俞禁不可灸，乳中禁不可灸，石門女子禁不可灸，氣街灸之不幸不得息，淵腋灸之不幸生腫蝕，經(jīng)渠禁不可灸（傷人神），鳩尾禁不可灸。陰市禁不可灸陽關禁不可灸。天府禁不可灸（使人逆息），伏兔禁不可灸，地五會禁不可灸（使人瘦），脈禁不可灸，右禁灸。”灸脊中可引起痿證；耳有膿，忌灸耳門；灸乳中、淵液可引起“蝕瘡”等，是對灸法的又一次總結(jié)。