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關(guān)于主成分分析matlab代碼實現(xiàn)的總結(jié)

 宗邑 2019-01-30

方法一:

1:用zscore函數(shù)對原始數(shù)據(jù)S進行標準化。

2:用cov函數(shù)求出標準化后的數(shù)據(jù)的協(xié)方差。

3:求出此協(xié)方差的特征向量與特征根(eig函數(shù))。

4:將產(chǎn)生的特征向量依據(jù)特征根大小從大到小進行排列(即將特征向量按列倒序)。

5:依據(jù)需求取出倒序后的向量的前幾列(一般根據(jù)特征根來算貢獻率,使得累計貢獻率大于85%),組成新的矩陣T

6:做S*T得到分析后的新的數(shù)據(jù)。

7:依據(jù)特征根算貢獻率,并繪圖。

代碼如下:

X=load('shuju.txt')

z=zscore(X)               %數(shù)據(jù)標準化

M=cov(z)                  %協(xié)方差

[V,D]=eig(M);             %求出協(xié)方差矩陣的特征向量、特征根

d=diag(D);                %取出特征根矩陣列向量(提取出每一主成分的貢獻率)

eig1=sort(d,'descend')      %將貢獻率按從大到小元素排列

v=fliplr(V)                %依照D重新排列特征向量

S=0;

i=0;

while S/sum(eig1)<0.85

    i=i 1;

    S=S eig1(i);

end                         %求出累積貢獻率大于85%的主成分

NEW=z*v(:,1:i)              %輸出產(chǎn)生的新坐標下的數(shù)據(jù)

W=100*eig1/sum(eig1)

figure(1)

pareto(W);                  %畫出貢獻率的直方圖

 

 

方法二:

1:用zscore函數(shù)對原始數(shù)據(jù)S進行標準化,(同上)。

2:利用matlab自帶的princomp函數(shù)直接求得其特征向量,新坐標下的數(shù)據(jù),特征根(并且已經(jīng)排列好了)。

3:選擇恰當?shù)那皫醉椫鞒煞峙c標準化后的數(shù)據(jù)相乘。得到在新坐標下的數(shù)據(jù)。

4:如方法一,利用特征根算貢獻率。

代碼如下:

X=load('shuju.txt')

x=zscore(X)                       %標準化

[coef,score,eig,t]=princomp(x);   %利用princomp處理矩陣

t                                 %每一組數(shù)據(jù)在新坐標下到原點的距離

s=0;

i=1;

while s/sum(eig)<0.85

    s=s eig(i);

    i=i 1;

end                              %獲得累計貢獻率大于85%幾組數(shù)據(jù)

NEW=x*coef(:,1:i-1)              %輸出新的數(shù)據(jù)

figure

pareto(eig/sum(eig));          %輸出貢獻率直方圖

figure(2)

plot(eig,'r ');

hold on

plot(eig,'b-');


二:令我糾結(jié)的一些東西

1:歸一化、均值化、標準化、白化

  歸一化:將數(shù)據(jù)歸結(jié)到某兩個數(shù)之間。

計算公式:y = (ymax - ymin)*(x - xmin)/(xmax - xmin) ymin

Matlab實現(xiàn)方法:利用mapminmax函數(shù),具體格式為[y,ps] = mapminmax(x,ymin,ymax)(矩陣中以行來歸一化)。

均值化:將數(shù)據(jù)中的每一個數(shù)除以其相應(yīng)指標的平均值(數(shù)據(jù)矩陣中由于一般每一列描述一個特征,matlab處理時要按列處理)(這種方法可以說修正了常用的標準化會浪費部分數(shù)據(jù)的情況,可以替代標準化對數(shù)據(jù)進行預(yù)處理)。

標準化:使數(shù)據(jù)均值為0方差為1,即將每一個數(shù)據(jù)減去所在列的均值后對數(shù)據(jù)矩陣每一列除以其對應(yīng)的方差。

Matlab實現(xiàn)方法:使用zscore函數(shù)。

主成分分析中,原始數(shù)據(jù)的單位不同,需要使用一種數(shù)據(jù)處理方法使其轉(zhuǎn)換為無量綱數(shù),歸一化與標準化都有消除量剛的作用,但是,主成分分析根據(jù)方差來建立新坐標系的,所以歸一化矩陣可能不適用于PCA中,所以,基本上主成分分析在數(shù)據(jù)預(yù)處理上都用的是標準化,但是,標準化矩陣本身會損失一部分信息,而均值化不會損失信息,均值化可以更好的改進PCA算法(網(wǎng)上找到的一篇論文中說到的)。

白化:白化通常為獨立成分分析中的數(shù)據(jù)處理方式,其與PCA處理方式基本一致,個人理解ICA就是對PCA數(shù)據(jù)作的進一步處理,找到其中相互獨立的部分。

2princomp函數(shù)與eig函數(shù)的不同

  在開始我一直以為利用princomp函數(shù)與eig函數(shù)產(chǎn)生的特征向量只有順序有所不同,但是我發(fā)現(xiàn),即使是同一組數(shù)據(jù),其產(chǎn)生的特征向量也有所不同,表現(xiàn)為某幾個數(shù)據(jù)正負號不同,具體如下:

原始數(shù)據(jù):

關(guān)于主成分分析matlab代碼實現(xiàn)的總結(jié)

使用eig函數(shù)的得到的特征向量:

關(guān)于主成分分析matlab代碼實現(xiàn)的總結(jié)
使用princomp函數(shù)的特征向量:

關(guān)于主成分分析matlab代碼實現(xiàn)的總結(jié)

可以看出,不僅是列的位置有所不同,某些數(shù)據(jù)的正負情況也有所不同,這也是我的一個疑惑:相同數(shù)據(jù)的特征向量為什么會有正負號的偏差?為保險起見,我覺得matlab自帶的princomp函數(shù)可能更準確。

 

3PCAICA的異同

幾何意義上:PCA是在找尋保留最大信息的方向,而ICA是在找尋各個獨立的分量,也就是說PCA的第一主成分貢獻率永遠最大并且貢獻率主成分次數(shù)增高逐漸降低,而ICA并沒有,他只是將原有的信號解混,并不考慮信息量的大小。

處理方式上:處理ICA時要先用PCA做白化處理,因為PCA協(xié)方差矩陣為對角陣,其必不相關(guān),獨立必不相關(guān),所以通過PCA使數(shù)據(jù)之間沒有相關(guān)性,之后再進行迭代操作,求出相互獨立的分量。

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