家禽的整個(gè)消化道含有大量的種類各異的微生物群落。消化道中細(xì)菌數(shù)量比宿主細(xì)胞總數(shù)還要多（Mead, 2000; Gordon, 2005）?，F(xiàn)代分子生物學(xué)和分析技術(shù)的應(yīng)用讓我們對(duì)家禽腸道微生物菌群有了空前的認(rèn)識(shí)。

微生物菌群的建立

家禽利用后腸道進(jìn)行發(fā)酵，在盲腸中容納有大量的不同種類的微生物。消化道中的微生物最開始粘附在腸粘膜或者食物顆粒表面，或者在腸腔中自由生長(zhǎng)。

微生物表面黏附生長(zhǎng)很重要，因?yàn)槟c道有些地方食物通過的速度很快，很容易將他們排出體外。這樣就不難理解微生物活動(dòng)最活躍的地方是條件相對(duì)穩(wěn)定，營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)可以保留較長(zhǎng)時(shí)間讓微生物很好生長(zhǎng)的地方（Mead,2000）。

微生物菌群的建立需要某些在腸道良好生長(zhǎng)而另一些微生物被抑制減少，最終達(dá)到菌群共生平衡狀態(tài)（Hentschel 等，2000）。在家禽要建立小腸微生態(tài)平衡需要出生后兩周才能完成，而盲腸要建立好的微生態(tài)平衡需要超過30天（Barnes 等, 1972）。建立速度慢的主要原因是孵化過程中的嚴(yán)格消毒以及對(duì)飼養(yǎng)環(huán)境嚴(yán)格消毒造成的，在這種情況下自然環(huán)境中的健康微生物很難進(jìn)入家禽的消化道。

腸道微生態(tài)系統(tǒng)的影響因素

與所有的生態(tài)系統(tǒng)一樣，腸道微生態(tài)系統(tǒng)的特征、種群組成和穩(wěn)定性受到三個(gè)因素的影響。1）生態(tài)系統(tǒng)的生理和化學(xué)條件；2）底物狀況和營(yíng)養(yǎng)平衡；3）微生物活性。

首先是細(xì)菌組成（數(shù)量和比例）是特異性的，因動(dòng)物的年齡、生理狀態(tài)、腸道不同部位的生理環(huán)境不同而改變。如果微生態(tài)系統(tǒng)的生理化學(xué)條件發(fā)生變化微生物群落的特性就會(huì)發(fā)生變化。其次，日糧組成影響營(yíng)養(yǎng)成分含量，這會(huì)導(dǎo)致腸道微生態(tài)系統(tǒng)發(fā)生改變。假如改變?nèi)占Z和營(yíng)養(yǎng)組成，腸道微生物會(huì)因底物的改變而迅速改變發(fā)酵特性，尤其是在前腸道消化吸收功能下降的情況下。

日糧的纖維物質(zhì)是共生微生物重要發(fā)酵底物，對(duì)微生物菌群數(shù)量和發(fā)酵有深刻的影響。最后，有很多的前營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)和生物活性物質(zhì)進(jìn)入到動(dòng)物的消化道微生態(tài)系統(tǒng)，可以是隨著日糧或者添加劑進(jìn)入的，也可以是由宿主分泌的，或是細(xì)菌發(fā)酵產(chǎn)生的。這些前營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)和生物活性物質(zhì)可能會(huì)對(duì)腸道微生態(tài)系統(tǒng)有復(fù)雜和深刻的影響，通常這些影響是有益的，但是有時(shí)候也可能是有害的。

腸道微生物是所有動(dòng)物不可分割的組成部分，像其他的生物一樣他們對(duì)環(huán)境和營(yíng)養(yǎng)有要求。細(xì)菌從日糧中獲得用于自身繁殖和生長(zhǎng)的能量。這些營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)要么是不能被動(dòng)物消化吸收要么就是動(dòng)物吸收速度太慢才能被腸道微生物所利用。

因?yàn)槲⑸锓N類不同，他們生長(zhǎng)所需要的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)和環(huán)境也不相同，飲食結(jié)構(gòu)和營(yíng)養(yǎng)組成決定了腸道微生物的組成和分布。細(xì)菌代謝底物和所需營(yíng)養(yǎng)的組成決定了動(dòng)物腸道微生態(tài)系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)（Wagner and Thomas, 1987)。因此更好的理解腸道微生態(tài)系統(tǒng)可以為設(shè)計(jì)更好的營(yíng)養(yǎng)策略來控制有害菌的數(shù)量，比如通過建明枯草芽孢桿菌PB6控制梭菌數(shù)量，提高有益菌的數(shù)量，減少腸道疾病的發(fā)生提供指導(dǎo)。

腸道蠕動(dòng)的作用

良好的腸道蠕動(dòng)能力對(duì)家禽食物消化、營(yíng)養(yǎng)吸收和保證腸道微生態(tài)平衡非常重要。食物的結(jié)構(gòu)（纖維含量、顆粒大小、顆粒完整性）對(duì)肌胃的發(fā)育和蠕動(dòng)很重要，肌胃控制著腸道蠕動(dòng)能力（Duke, 1994）。

與哺乳動(dòng)物不一樣，家禽的腸道逆蠕動(dòng)非常頻繁，這是其補(bǔ)償腸道過短的一種機(jī)制。

逆蠕動(dòng)將食物長(zhǎng)時(shí)間暴露在消化液當(dāng)中，充分與消化酶接觸提高消化率，用很短的腸道就能提高對(duì)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的吸收，同時(shí)還可以減少與宿主競(jìng)爭(zhēng)營(yíng)養(yǎng)的微生物或致病的微生物繁殖。

腸道紊亂，如腺胃炎，肌胃糜爛、腹瀉可能與食物加工過度造成的腸道蠕動(dòng)紊亂有關(guān)?，F(xiàn)代飼料加工（粉碎、加熱、膨化、制粒）的目標(biāo)是減少家禽采食的時(shí)間、提高飼料消化率、促進(jìn)最大采食量和最佳的生長(zhǎng)速度。

肌胃的作用

所有的投資都花在了減輕肌胃磨碎食物這個(gè)環(huán)節(jié)上，但是高度加工的飼料導(dǎo)致肌胃萎縮和功能障礙，這時(shí)肌胃不再是一個(gè)磨碎食物的器官，而是一個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)食物的器官。當(dāng)家禽采食高度加工的飼料后腸道不再發(fā)生逆蠕動(dòng)，為了消化大量的食物，必須分泌大量消化液進(jìn)入腸道，從而導(dǎo)致腹部發(fā)生肥大。

肌胃中差的胃蛋白酶對(duì)蛋白的消化將導(dǎo)致胰蛋白酶和十二指腸糜蛋白酶消化效率下降，隨之而來的結(jié)果是更多的蛋白進(jìn)入后腸道用于微生物發(fā)酵。綜上所述，差的蛋白消化率將導(dǎo)致微生物轉(zhuǎn)向分解蛋白，或者變?yōu)橛泻ξ⑸?，這是我們不愿意看到的。