利用單細(xì)胞質(zhì)譜技術(shù)，來自斯坦福大學(xué)的Paul Utz, Purvesh Khatri, Alex Kuo課題組合作發(fā)現(xiàn)，染色質(zhì)信號可以用于預(yù)測免疫細(xì)胞的細(xì)胞身份（cell identity）；在衰老過程中，個體間與細(xì)胞間的染色質(zhì)信號的異質(zhì)性增加；通過對雙胞胎的研究發(fā)現(xiàn)，衰老過程中的染色質(zhì)信號異質(zhì)性主要由環(huán)境因素（而遺傳因素）導(dǎo)致（圖1）。該研究發(fā)表在Cell上。

全文鏈接：

https:///10.1016/j.cell.2018.03.079

圖 1單細(xì)胞質(zhì)譜：免疫細(xì)胞與衰老過程的表觀遺傳學(xué)變化

真核生物的DNA纏繞著組蛋白八聚體，而組蛋白上發(fā)生的多種化學(xué)修飾，以及多種組蛋白變體，可以改變?nèi)旧|(zhì)結(jié)構(gòu)、招募不同的識別蛋白，進(jìn)而調(diào)控基因表達(dá)、DNA修復(fù)、DNA復(fù)制等過程。

對這些表觀遺傳學(xué)信號進(jìn)行研究的手段多種多樣，如ChIP-seq可以研究組蛋白修飾、組蛋白變體或轉(zhuǎn)錄因子在整個基因組上的分布位置，但一次只能研究一種蛋白或修飾。而質(zhì)譜則可以同時研究多種組蛋白修飾、組蛋白變體等的豐度。在免疫細(xì)胞分化過程中，以及衰老過程中，利用質(zhì)譜對表觀遺傳學(xué)信號的動態(tài)豐度進(jìn)行研究，有助于我們發(fā)掘這些過程中關(guān)鍵的表觀遺傳學(xué)信號。

常規(guī)的質(zhì)譜打組蛋白修飾的變化，一般至少需要1萬個細(xì)胞。而本文卻可在單細(xì)胞層面進(jìn)行研究。這得益于他們開發(fā)的EpiTOF技術(shù)（epigenetic landscape profiling using cytometry by time-of-flight）。簡而言之，該技術(shù)首先用抗體增加靈敏度，然后又用重金屬標(biāo)記抗體，將細(xì)胞氣化后留下金屬離子，用TOF質(zhì)譜打重金屬（而非肽段），進(jìn)一步增加了靈敏度，從而做到了單細(xì)胞分辨率。

技術(shù)細(xì)節(jié)：

（1）將70種抗體（包括22類免疫細(xì)胞的表面marker抗體，8類組蛋白修飾的抗體，4種組蛋白變體的抗體）都標(biāo)記上鑭系元素同位素（可能因為鑭系元素有非常多的同位素，可以同時標(biāo)記很多種抗體；它們擁有相似的化學(xué)性質(zhì)，標(biāo)記抗體的能力相似；并且它可能更容易耦合抗體）。

（2）將細(xì)胞與重金屬同位素標(biāo)記的多種抗體共同孵育，洗去非特異結(jié)合抗體。

（3）將單細(xì)胞用電感耦合等離子體氣化，只留下金屬離子，并過濾留下100Da以上的重金屬離子，進(jìn)入飛行時間質(zhì)譜儀（TOF-MS）。

（4）利用離子在電場中的飛行時間，計算質(zhì)荷比（m/z），從而分析出每個細(xì)胞的鑭系元素離子的類型、豐度，進(jìn)而得知細(xì)胞類型（通過免疫細(xì)胞的表面marker抗體），以及組蛋白修飾和組蛋白變體的豐度。

質(zhì)譜流程圖見圖2。

圖 2 質(zhì)譜流程圖

（圖片來自bitesizebio.com）

在抗體選擇上，研究者檢測了150多種chromatin marks的抗體的特異性，用RNAi敲低或CRISPR敲除表觀遺傳修飾的酶，或者用小分子藥物抑制表觀遺傳修飾酶的活性，然后用流式細(xì)胞術(shù)檢測組蛋白修飾的抗體的特異性，最終得到了40種特異的組蛋白修飾（圖3C），將其加上鑭系元素同位素標(biāo)記做EpiTOF。研究者還用組蛋白H3的核心體抗體，以及H4 tail抗體作為背景對照。此外又用22類免疫細(xì)胞的表面marker抗體做細(xì)胞分型。共使用70種抗體。（文末附好用抗體列表。）

研究者選取了24位健康人（CMV陰性）的外周血單核細(xì)胞，分為兩組作為生物學(xué)重復(fù)，每組有25歲以下的3男3女，和65歲以上的3男3女。兩組的人口統(tǒng)計學(xué)特征相同。對他們的免疫細(xì)胞經(jīng)過EpiTOF分析，可以看到不同類型的免疫細(xì)胞具有不同的表觀遺傳學(xué)特征（圖3C）。

首先，髓系和淋系免疫細(xì)胞擁有很大的差異。髓系CD14⁺單核細(xì)胞的大部分染色質(zhì)修飾的水平都比淋系高，尤其是cleaved H3 Thr22（H3尾巴可在Thr22處被酶切，切掉前21個氨基酸，快速去除組蛋白修飾）和蛋白質(zhì)精氨酸脫亞氨酶PADI4（催化組蛋白精氨酸脫亞氨化/瓜氨酸化，調(diào)控干細(xì)胞多能性）。而淋系免疫細(xì)胞擁有更高的H3.3和H3K27me3水平。

在淋系免疫細(xì)胞中，CD4⁺T細(xì)胞和CD8⁺T細(xì)胞的染色質(zhì)修飾很相似。而NK細(xì)胞的絕大部分染色質(zhì)修飾都很低。

在個體差異的分析中，雖然個體的基因背景差異很大，但染色質(zhì)修飾的個體差異不大（通過Inverse Simpson’s Diversity Index計算）。其中個體差異最大的是H3K14ac，cleaved H3 Thr22和H2A.Z。個體差異最小的是macroH2A，PADI4，H2BK120ub。

（個體差異較大可能因為基因背景，生活環(huán)境與生活方式等的差異，也可能因為該修飾本身不穩(wěn)定。而個體差異小則可能因為該修飾是組成型存在的，在不同個體中被穩(wěn)定地調(diào)控，也許有穩(wěn)定的調(diào)控作用。）

為驗證EpiTOF的結(jié)果，研究者用FACS分選出單核細(xì)胞，B細(xì)胞，T細(xì)胞進(jìn)行western blot，發(fā)現(xiàn)染色質(zhì)修飾的水平差異與EpiTOF相符（圖3D）。

圖 3 各類型免疫細(xì)胞的染色質(zhì)修飾譜 | PBMC：外周血單核細(xì)胞（髓系）；CLPs：共同淋巴祖細(xì)胞；CMPs：共同髓系祖細(xì)胞。

值得注意的是，T細(xì)胞和B細(xì)胞（淋系）的H3K27me3水平高于髓系單核細(xì)胞，研究者又分析了Corces et al., 2016的RNA-seq結(jié)果^[1]，發(fā)現(xiàn)共同淋巴祖細(xì)胞的EZH1和EZH2（催化產(chǎn)生H3K27me3，參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控）水平高于共同髓系祖細(xì)胞。結(jié)合ChIP-seq與RNA-seq分析發(fā)現(xiàn)H3K27me3淋系比髓系高的基因，表達(dá)水平淋系低于髓系。這個發(fā)現(xiàn)支持了H3K27me3參與調(diào)控造血干細(xì)胞向髓系與淋系不同方向分化的假說，H3K27me3的差別在淋系與髓系祖細(xì)胞中就已出現(xiàn)。

我們常說各種表觀遺傳學(xué)信號組成了“表觀遺傳學(xué)風(fēng)貌（Epigenetic landscape）”，參與決定細(xì)胞命運。那么用本文中的40種染色質(zhì)修飾信號，能否區(qū)分出免疫細(xì)胞的細(xì)胞身份（cell identity）呢？

下面，研究者將40種染色質(zhì)修飾平均分成兩個panel（圖3B），用主成分分析（PCA, Principal Component Analysis）算法，將每個panel的20種染色質(zhì)修飾的數(shù)據(jù)降維成3維信息。這里可以簡單理解成，20種染色質(zhì)修飾的數(shù)據(jù)是一個20維的圖形，但我們是沒法看到20維的圖形的，所以就尋找它的3維投影，看哪個投影可以最大程度地把各個點區(qū)分開，最大程度地減少失真。最后得到的3維投影的XYZ軸，是20種染色質(zhì)修飾數(shù)據(jù)的3個不同的線性函數(shù)。這三個函數(shù)可以最大程度地區(qū)分各個樣品，提取其主要特征。雖然失真不可避免，但由于提取了主要特征，便于后面的計算和分析。

PCA結(jié)果見圖4A，上下圖是兩個不同的panel的染色質(zhì)修飾的結(jié)果。在圖中，我們可以看哪些點聚集到了一起，這些點是否具有某些共同的性質(zhì)?？梢钥吹?，不同類型的免疫細(xì)胞被很好地區(qū)分開了，同類細(xì)胞聚到了一起。其中骨髓來源的單核細(xì)胞與淋系免疫細(xì)胞區(qū)別很大。此外，兩個panel的染色質(zhì)修飾均有較好的區(qū)分度（圖4B，4C。AUC越接近1，區(qū)分度越好）。24個個體分成的2個生物學(xué)重復(fù)，也具有很好的重復(fù)性（圖4B，4C）。

圖 4 染色質(zhì)修飾可以用于預(yù)測免疫細(xì)胞的細(xì)胞身份 | （A）上下為兩個panel的各20個染色質(zhì)修飾的PCA結(jié)果。左圖為PCA計算后的三維圖，每個點是一個細(xì)胞，右圖為不同類細(xì)胞的染色質(zhì)修飾差異，單核細(xì)胞與其它細(xì)胞有較大差異。（B）用第一組個體計算的AUC，兩個panel的染色質(zhì)修飾均可很好地區(qū)分細(xì)胞身份。（C）用第二組個體的數(shù)據(jù)驗證第一組個體的PCA函數(shù)的結(jié)果，發(fā)現(xiàn)細(xì)胞身份的區(qū)分度也很好，說明重復(fù)性好，該P(yáng)CA函數(shù)可用于預(yù)測細(xì)胞身份。

如果再多看一些細(xì)節(jié)，研究者發(fā)現(xiàn)T細(xì)胞的各個亞群也擁有不同的組蛋白修飾特征（圖5A，5B，5C）。

表達(dá)αβ TCR的T細(xì)胞與表達(dá)γδ TCR的T細(xì)胞擁有不同的組蛋白修飾譜（圖5A左）。

Na?ve T細(xì)胞被聚成了一類，而效應(yīng)T細(xì)胞和記憶T細(xì)胞則與na?ve T細(xì)胞有很大差別（圖5A，5B）。

記憶T細(xì)胞有更多的活躍修飾，如H3S10ph, H3K27me1, H3K36me1，以及更低的異染色質(zhì)修飾水平。說明記憶T細(xì)胞可能有更開放的染色質(zhì)環(huán)境（圖5B）。

與總的CD4⁺T細(xì)胞相比，Treg細(xì)胞有更高的H3K27me1和H3K27ac，更低的H3K27me3。這也支持了前人研究發(fā)現(xiàn)的H3K27修飾對Treg細(xì)胞功能的重要作用^[2]（圖5C）。

而NK細(xì)胞的兩個亞群也擁有不同的染色質(zhì)修飾模式（圖5D，5E）。

NK細(xì)胞可用CD56分為兩類，一類是主要發(fā)揮細(xì)胞殺傷作用的CD56^dim NK細(xì)胞，約占90%。另一類是主要分泌細(xì)胞因子的CD56^bright NK細(xì)胞。研究者發(fā)現(xiàn)，用染色質(zhì)修飾同樣可以把NK細(xì)胞分為兩類，并且與CD56的分類相符（圖5D）。兩類NK細(xì)胞的具體的染色質(zhì)修飾的差別見圖5E。

圖 5 T細(xì)胞和NK細(xì)胞的不同功能亞群具有不同的染色質(zhì)修飾譜 | （A）不同T細(xì)胞亞群的染色質(zhì)修飾譜，最左邊是聚類情況，右邊是熱圖，顏色越紅水平越高，點越大，個體差異越小。（D）CD56分類的兩個NK細(xì)胞亞群擁有不同的染色質(zhì)修飾譜，圖中每個點是一個NK細(xì)胞，按CD16和CD56分為左上角和右下角兩類，顏色表示染色質(zhì)修飾降維成PC1的強(qiáng)度，可以看到和CD56，CD16分類的情況相符。

以上研究證明了染色質(zhì)修飾可以很好地區(qū)分免疫細(xì)胞的細(xì)胞身份，支持了業(yè)界長久以來的認(rèn)識。同時也為免疫細(xì)胞的功能與表觀遺傳學(xué)調(diào)控間的關(guān)系提供了研究基礎(chǔ)。

首先，研究者發(fā)現(xiàn)衰老個體的造血輸出減少，免疫細(xì)胞功能受損，CD45RO⁺記憶T細(xì)胞增多，這與前人的研究相符^[3]。然后，對65歲以上老人和25歲以下年輕人各12人的20種免疫細(xì)胞的40種染色質(zhì)修飾進(jìn)行分析（圖6A），利用PCA算法降成2維，可以代表72.7%的數(shù)據(jù)差異，可以將年輕人與老年人的特征分開，而不同性別則沒有明顯差異。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，年輕人染色質(zhì)修飾的個體間差異更小，而老年人的染色質(zhì)修飾譜則非常離散，個體間差異很大（圖6B）。但兩者的組蛋白H3和H4的水平并無明顯區(qū)別，主要是修飾的區(qū)別。

將對比老年人和年輕人的各類型的免疫細(xì)胞，染色質(zhì)修飾也有很大差異（圖6C）。可以看到，老年人的大部分類型的免疫細(xì)胞，大部分染色質(zhì)修飾都均多于年輕人。但CD45RO⁺CD197⁺中央記憶CD8⁺T細(xì)胞是個例外。它的絕大部分組蛋白修飾都低于年輕人（圖6C），這是由于其組蛋白H3和H4水平降低。

圖 6 老年人免疫細(xì)胞染色質(zhì)修飾的個體間差異更大

如果對比老年人和年輕人的染色質(zhì)修飾的細(xì)胞間差異，可以看到老年人的細(xì)胞間差異更大（圖7A）。

其中，在衰老后，由PRC1，PRC2介導(dǎo)的組蛋白修飾（H3K27me3，H3K27me2，H2AK119ub）的細(xì)胞間差異最大（圖7B）。

那么衰老前后的染色質(zhì)修飾與轉(zhuǎn)錄水平有何關(guān)系呢？研究者尚未進(jìn)行人的單細(xì)胞RNA-seq，于是他們分析了前人做的年輕和衰老的小鼠的na?ve CD4⁺T細(xì)胞的ChIP-seq和單細(xì)胞RNA-seq結(jié)果^[4]，發(fā)現(xiàn)H3K27me3標(biāo)記的基因在衰老后有更大的轉(zhuǎn)錄異質(zhì)性，而H3K4me3標(biāo)記的基因則沒有。

圖 7 衰老后染色質(zhì)修飾的細(xì)胞間差異增大

這些數(shù)據(jù)提示，在衰老后，染色質(zhì)修飾的噪音/異質(zhì)性的上升（尤其是PRC介導(dǎo)的H3K27me3），將導(dǎo)致細(xì)胞間染色質(zhì)狀態(tài)的差異與轉(zhuǎn)錄噪音的增加。

為了研究衰老后的染色質(zhì)修飾譜變化，到底更受遺傳因素還是非遺傳因素影響，研究者選取了9對同卵雙胞胎（基因組100%相同）和10對異卵雙胞胎（基因組50%相同）進(jìn)行研究（圖8A），并且對比隨機(jī)選取的非雙胞胎個體對的數(shù)據(jù)，檢測雙胞胎與非雙胞胎在衰老后的變化有無差異。

首先，與上文的研究相符，年老的雙胞胎也有更高的染色質(zhì)修飾異質(zhì)性，并且中央記憶CD8⁺T細(xì)胞的染色質(zhì)修飾水平在衰老后下降。

利用經(jīng)典ACE模型^[5]分析遺傳因素對衰老后各類型細(xì)胞的染色質(zhì)修飾差異的影響，發(fā)現(xiàn)遺傳因素只能解釋30%的差異，而非遺傳因素可以解釋70%（圖8B）。

根據(jù)PCA分析，年輕的雙胞胎的染色質(zhì)修飾譜更接近（雙胞胎組內(nèi)與組間個體都很接近）。而年老雙胞胎的個體間差異增大（雙胞胎組內(nèi)與組間個體的差異都很大）（圖8C）。

對比雙胞胎與非雙胞胎的數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)無論是否是雙胞胎，染色質(zhì)修飾譜的異質(zhì)性都會在衰老后增大，提示衰老后的異質(zhì)性增大可能更受非遺傳因素影響（圖8D）。

進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，年輕個體的染色質(zhì)修飾譜的異質(zhì)性，同卵雙胞胎 < 異卵雙胞胎=""><>（圖8E上），表明年輕時的染色質(zhì)修飾譜可能更受上一代給予的遺傳信息（包括遺傳學(xué)或表觀遺傳學(xué)信息）的影響。

而年老個體，無論是同卵雙胞胎、異卵雙胞胎，還是非雙胞胎，其染色質(zhì)修飾譜的異質(zhì)性都差不多大（圖8E下），表明衰老后的染色質(zhì)修飾譜可能更受非遺傳因素影響（包括環(huán)境因素，及體細(xì)胞突變影響）

為了進(jìn)一步增強(qiáng)結(jié)論，研究者對同卵雙胞胎進(jìn)行了研究，發(fā)現(xiàn)盡管同卵的兩個雙胞胎從上一代獲得的遺傳信息相同，大部分染色質(zhì)修飾（32/40）都是只在年輕的雙胞胎中相似，而年老后異質(zhì)性增加。這進(jìn)一步說明了衰老后的染色質(zhì)修飾異質(zhì)性增加主要由非遺傳因素影響。

圖 8 非遺傳因素可以解釋衰老前后大部分的染色質(zhì)修飾譜的差異 | （B）大部分的染色質(zhì)修飾的差異受非遺傳因素影響。橫軸為20種免疫細(xì)胞，縱軸為40種染色質(zhì)修飾（按受遺傳因素影響從強(qiáng)到弱排序），顏色表示可以解釋遺傳或非遺傳因素可以解釋的染色質(zhì)修飾差異的程度，70%的深色的點都是非遺傳因素影響的。（C）年輕與年老的雙胞胎的染色質(zhì)修飾的PCA分析，年老的雙胞胎個體間差異更大。（D）和（E）是每對雙胞胎內(nèi)，或隨機(jī)配對的兩個個體間的染色質(zhì)修飾的個體差異。（F）是每對同卵雙胞胎的兩個個體間，年輕VS年老個體的染色質(zhì)修飾的相關(guān)性。每個點是一種染色質(zhì)修飾。大部分的點在左上角，說明大部分的染色質(zhì)修飾都是在年輕的雙胞胎中更相似，到了年老就不相似了。

延伸思考

1. 本研究借助獨特的重金屬標(biāo)記抗體技術(shù)與TOF技術(shù)，開發(fā)了EpiTOP平臺，在單細(xì)胞層面研究了20種免疫細(xì)胞的40種染色質(zhì)修飾的豐度，發(fā)現(xiàn)染色質(zhì)修飾可以用于預(yù)測免疫細(xì)胞的細(xì)胞身份（cell identity）；在衰老過程中，個體間與細(xì)胞間的染色質(zhì)修飾的異質(zhì)性增加；并且衰老的染色質(zhì)修飾的異質(zhì)性增加主要受環(huán)境因素影響（用年輕與年老的雙胞胎進(jìn)行研究）。

   
   

2. 本研究開發(fā)的EpiTOF技術(shù)，與免疫熒光術(shù)、流式細(xì)胞術(shù)本質(zhì)類似。它們都是單細(xì)胞精度的研究手段。只是免疫熒光術(shù)和流式細(xì)胞術(shù)一般用熒光標(biāo)記抗體，而熒光可選取的共同標(biāo)記的數(shù)目更加有限。因此，本研究用重金屬同位素標(biāo)記抗體，用其質(zhì)荷比區(qū)分抗體，增加了抗體共標(biāo)的數(shù)目。但仍需注意，抗體的效價，特異性，以及抗體之間的影響等因素，會增大數(shù)據(jù)的bias。

   
   

3. 本文的一個重要意義是證明了染色質(zhì)修飾譜可以用于預(yù)測細(xì)胞身份，支持了學(xué)界長久以來的認(rèn)識。

   
   

   但有趣的是，研究者將40種染色質(zhì)修飾分成兩個panel去預(yù)測細(xì)胞身份，發(fā)現(xiàn)兩個panel居然都能很好地預(yù)測細(xì)胞身份，這可能會讓一些人懷疑該計算體系的可信度（雖然染色質(zhì)修飾確實存在很多crosstalk，這兩個panel可能都足區(qū)分細(xì)胞身份）?；蛟S可以嘗試尋找，這40種染色質(zhì)修飾的數(shù)據(jù)中，最少由哪幾種組合成一個panel就足以預(yù)測細(xì)胞身份。而哪幾種修飾組合后（種類越多越好），在該計算體系下，無論如何都無法預(yù)測細(xì)胞身份。甚至可以進(jìn)一步分析不同的panel組成方式，在PCA計算后，區(qū)分細(xì)胞身份的力度（AUC）。這或許強(qiáng)化該體系的可信度。同時，該分析也將有助于尋找哪些染色質(zhì)修飾在區(qū)分細(xì)胞身份時，有更大的相關(guān)性、可能有更強(qiáng)的crosstalk（當(dāng)然直接對40種染色質(zhì)修飾進(jìn)行PCA分析也可以）。

   
   

4. 本研究發(fā)現(xiàn)在衰老過程中，個體間與細(xì)胞間的染色質(zhì)修飾的異質(zhì)性的增加，主要受環(huán)境因素（非遺傳因素）影響。這里本研究用雙胞胎來研究遺傳因素VS非遺傳因素的影響。那我們可以想一想，如果是追蹤每個個體的衰老過程，用自身對照（自身的遺傳因素相同），那么如果發(fā)現(xiàn)衰老后染色質(zhì)異質(zhì)性增加，能否也說明異質(zhì)性增加主要是環(huán)境的影響呢？

   
   

   不一定。

   
   

   為什么呢？首先我們要明白，衰老可能既是一個環(huán)境因素影響的結(jié)果，也有可能是一個遺傳因素影響的結(jié)果（即遺傳信息已經(jīng)編碼好了衰老過程）。所以在這個個體衰老的過程中出現(xiàn)的變化（包括染色質(zhì)修飾異質(zhì)性增加），不能論證該變化是環(huán)境因素影響的結(jié)果。（萬一是遺傳信息已經(jīng)編碼好了，衰老后染色質(zhì)修飾異質(zhì)性就會增加呢。）

   
   

   那么本研究用雙胞胎是否可以避免這一點呢？

    

   只能在很大程度上避免這一點。

   
   

   同卵雙胞胎從上一代遺傳的信息相同，所以如果遺傳信息很精確地編碼了衰老后染色質(zhì)修飾的異質(zhì)性將如何增加，那么同卵雙胞胎的染色質(zhì)異質(zhì)性將以相同的方式增加。而本研究的發(fā)現(xiàn)排除了這一種情況。

   但還有一種情況，就是遺傳信息只寫到，衰老后染色質(zhì)修飾會變亂（或者說維持染色質(zhì)均質(zhì)性的機(jī)制只在年輕時有用），但并不規(guī)定將會怎樣變亂（也許是隨機(jī)變亂），那還是無法弱化遺傳因素的影響。（不過我們還是更相信，這種情形下，染色質(zhì)修飾可能不是隨機(jī)變亂的，而是受環(huán)境影響變亂的。兩者仍需證明。）

   
   

5. 本研究的發(fā)現(xiàn)更加突出了polycomb repressive complex介導(dǎo)的修飾（尤其是H3K27me3）在免疫細(xì)胞發(fā)育中的作用。

   
   

6. PADI4是一種蛋白質(zhì)精氨酸脫亞氨酶，催化組蛋白精氨酸脫亞氨化/瓜氨酸化，目前已發(fā)現(xiàn)可調(diào)控干細(xì)胞多能性。本研究發(fā)現(xiàn)它和cell identity有很大關(guān)系。這提示組蛋白精氨酸脫亞氨化/瓜氨酸化與細(xì)胞命運決定之間的關(guān)系還很值得研究。

   
   

7. 本研究通過各種免疫細(xì)胞的染色質(zhì)修飾譜的聚類，發(fā)現(xiàn)CD56^bright NK細(xì)胞與髓系單核細(xì)胞更接近，而CD56^dim NK細(xì)胞與淋系T細(xì)胞，B細(xì)胞，NKT細(xì)胞更接近（原文Figure S3）?；蛟S這兩種NK細(xì)胞是不同來源的，或者經(jīng)歷了類似髓系和淋系的兩種不同的發(fā)育途經(jīng)。

   
   

   本文感謝胡亞君在質(zhì)譜方面的討論與指導(dǎo)，感謝陳釗熊在生物信息方面的討論與指導(dǎo)！

好用的抗體列表

參考文獻(xiàn)

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