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我國(guó)創(chuàng)造了世界首個(gè)單染色體酵母,但卻留不住該論文第一作者,背后原因值得深思!

 昵稱w4l7 2018-08-06

中國(guó)生物學(xué)界出了件大事:中國(guó)科學(xué)家獨(dú)立搞出了一種新的酵母!這被認(rèn)為是繼上世紀(jì)60年代,中國(guó)人工合成牛胰島素和tRNA之后,中國(guó)在合成生物學(xué)領(lǐng)域的又一個(gè)重要貢獻(xiàn)和重大突破。

(一)

8月2日,國(guó)際頂尖的科學(xué)期刊《自然》同時(shí)上線了兩篇重量級(jí)論文,一篇來(lái)自紐約大學(xué)系統(tǒng)遺傳學(xué)研究所的Jef Boeke團(tuán)隊(duì),他們成功將釀酒酵母的16條染色體彼此“融合”,縮減到2條染色體。而另一篇出自中科院上海生命科學(xué)研究院,植物生理生態(tài)研究所的覃重軍等實(shí)驗(yàn)室則更進(jìn)一步,將釀酒酵母的全部16條染色體融合成了1條染色體。


歷經(jīng)4年努力攻關(guān),他們?cè)趪?guó)際上,首次人工創(chuàng)建了單條染色體的真核細(xì)胞。這項(xiàng)工作完全由中國(guó)科學(xué)家獨(dú)立完成,是在“人造生命”領(lǐng)域具有里程碑意義的重大突破。

“染色體”這個(gè)概念,大家多多少少應(yīng)該都有聽(tīng)過(guò)。諸如動(dòng)物、植物和真菌之類擁有復(fù)雜細(xì)胞結(jié)構(gòu)的生物(也就是真核生物),它們的遺傳物質(zhì)——DNA就存在這種叫做染色體的結(jié)構(gòu)上。生物學(xué)教科書中,將自然界存在的生命體,分為真核生物和原核生物。所有真核生物細(xì)胞含有的染色體有多條,且都是線型結(jié)構(gòu),如人類、小鼠、釀酒酵母等都是真核生物。而原核生物細(xì)胞含有的染色體通常只有一條,且是環(huán)型結(jié)構(gòu),如大腸桿菌、破傷風(fēng)菌等許多細(xì)菌。

染色體結(jié)構(gòu)示意圖。

不同的真核生物所擁有的染色體數(shù)量可謂天差地別:比如人類擁有23對(duì)染色體,我們做實(shí)驗(yàn)的小白鼠有20對(duì)染色體,家里的汪星人則有39對(duì)染色體。在這之前,自然界從沒(méi)發(fā)現(xiàn)過(guò)一條染色體的真核生物。

人類能否創(chuàng)造生命?

2010年,《科學(xué)》雜志曾報(bào)道,美國(guó)科學(xué)家做出世界首個(gè)“人造生命”:與天然染色體序列幾乎相同的原核生物支原體,但由于科學(xué)家對(duì)其生命密碼沒(méi)有完全掌握,并未對(duì)其進(jìn)行任何改造,只是單純地復(fù)制。

此次,覃重軍團(tuán)隊(duì)把釀酒酵母細(xì)胞里原本天然的16條染色體,人工融合成單條染色體,且仍具有正常的細(xì)胞功能。既改變了染色體的結(jié)構(gòu),又仍保有生命的“活性”,人工蛻變出一個(gè)全新細(xì)胞。該項(xiàng)工作表明,天然復(fù)雜的生命體系也可通過(guò)“人造”變簡(jiǎn)約,自然生命的界限可以被人為打破,甚至可以人工創(chuàng)造全新的自然界不存在的生命,為人類對(duì)生命本質(zhì)的研究開(kāi)辟新的方向。

為什么選擇釀酒酵母?

作為1996年第一個(gè)完成基因組測(cè)序的真核生物,釀酒酵母是日常發(fā)酵中最常用的生物種類,不僅用于制作面包、啤酒等,還是用于生命科學(xué)研究的代表性真核生物。

值得一提的是,覃重軍等在論文中利用Hi-C技術(shù)表征了含有1條、2條、9條和16條染色體的酵母基因組3D結(jié)構(gòu)。與野生型菌株相比,在只有1條染色體的酵母細(xì)胞中,幾乎所有(99.7%)的染色體間顯著相互作用都消失了,并且引入了一些新的染色體間相互作用,與此同時(shí),67.4%的染色體內(nèi)相互作用也消失了。非常有趣的是,論文還表征了更加細(xì)微的基因尺度的染色質(zhì)相互作用,結(jié)果顯示,包含不同染色體數(shù)目的酵母有很相似的局部染色質(zhì)結(jié)構(gòu)?;谶@些數(shù)據(jù),作者推測(cè),在酵母中染色體間相互作用對(duì)總體基因轉(zhuǎn)錄影響很小,真正影響的可能是局部的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)。與此用時(shí),釀酒酵母通常還是研究染色體異常的重要模型,其1/3基因和具有23對(duì)染色體的人類基因同源。覃重軍團(tuán)隊(duì)創(chuàng)建的單條線型染色體酵母將來(lái)或?yàn)楸姸嘌芯空n題提供模型。同時(shí),它還可以為研究人類端粒功能及細(xì)胞衰老提供模型。

此次,覃重軍研究團(tuán)隊(duì)在 “合并染色體”的國(guó)際競(jìng)爭(zhēng)中拔得頭籌。連他最強(qiáng)勁的競(jìng)爭(zhēng)對(duì)手——美國(guó)科學(xué)院院士、紐約朗格尼醫(yī)學(xué)中心的杰夫·博伊克,都忍不住來(lái)問(wèn)他,究竟是怎么會(huì)想到要這么做,又是怎樣完成染色體 “十六合一”的?因?yàn)椴┮量说膶?shí)驗(yàn)室用了相同的技術(shù)路線,但只融合到兩條染色體。

“這是只有外行才敢想的念頭,一開(kāi)始沒(méi)多少人覺(jué)得我能做出來(lái)?!?/span>覃重軍非常感謝植生所給了他寬松的氛圍,支撐他度過(guò)了最艱難的時(shí)光,“整整五年,我沒(méi)有發(fā)表一篇與酵母相關(guān)的論文,換在別的單位,或許早就讓卷鋪蓋走人了。”

(二)

研究結(jié)果出來(lái)后,多名國(guó)際同行都向覃重軍發(fā)出了合作邀請(qǐng),希望能盡快將這種酵母進(jìn)行產(chǎn)業(yè)化??神剀娪X(jué)得,他身上還肩負(fù)著更重要的使命,他想用這種酵母,開(kāi)展人類疾病的研究。位于染色體兩頭的端粒是他的下一個(gè)目標(biāo)。科學(xué)家已經(jīng)知道,人類的衰老、基因突變、腫瘤形成等都與端粒的縮短密不可分,當(dāng)端粒變得不能再短時(shí),細(xì)胞就會(huì)死亡。

覃重軍(右)與團(tuán)隊(duì)成員邵洋洋在實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行試驗(yàn)研究

但是,覃重軍在媒體面前也流露出內(nèi)心焦慮:論文的第一作者、掌握了自己學(xué)術(shù)思想和實(shí)驗(yàn)關(guān)鍵技術(shù)的博士生邵洋洋正在申請(qǐng)海外博士后,其中就包括此次與他們同時(shí)發(fā)表類似論文的美國(guó)同行實(shí)驗(yàn)室。

照理說(shuō),這樣的研究所對(duì)優(yōu)秀博士畢業(yè)生應(yīng)該具有相當(dāng)吸引力。但邵洋洋斟酌再三,還是決定申請(qǐng)海外博士后。的確,以此次單染色體人工酵母的工作,她可以申請(qǐng)到全球合成生物學(xué)領(lǐng)域任何一個(gè)頂尖實(shí)驗(yàn)室。去那些實(shí)驗(yàn)室接受訓(xùn)練和熏陶,這是每個(gè)年輕博士所向往的。

“為了學(xué)生的前途考慮,我希望她出國(guó),但為國(guó)家考慮,我真希望能留住她?!?/span>覃重軍無(wú)奈地說(shuō),按照國(guó)內(nèi)學(xué)術(shù)圈現(xiàn)行的 “游戲規(guī)則”,年輕人若在國(guó)外實(shí)驗(yàn)室做出好的工作再回國(guó),就能比不出國(guó)的青年科學(xué)家獲得更多科研經(jīng)費(fèi)支持和房貼,申請(qǐng)人才計(jì)劃、科研項(xiàng)目都更有優(yōu)勢(shì)。

《Nature》曾調(diào)查超過(guò)3600名研究員的薪水,超過(guò)半數(shù)表示自己為了科研事業(yè)犧牲了生活質(zhì)量,其中有20%的被調(diào)查者表示不會(huì)向?qū)W生推薦科研職業(yè)。對(duì)于大多數(shù)普通人來(lái)說(shuō),搞科學(xué)研究充滿風(fēng)險(xiǎn)且代價(jià)昂貴。數(shù)個(gè)世紀(jì)以前,科學(xué)家多數(shù)是貴族出生,而今天的情況比那時(shí)也沒(méi)好多少。其中對(duì)中國(guó)的研究顯示,進(jìn)入頂尖大學(xué)的官員和富商的子女比例更高。出生于貧困家庭的科學(xué)家經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)很重,對(duì)博士后和初級(jí)研究員來(lái)說(shuō)壓力更大,所以很多人因此轉(zhuǎn)向了海外。雖然有關(guān)部門已經(jīng)開(kāi)始利用高薪吸引海外科學(xué)家歸國(guó),但能夠得到高薪的科學(xué)家畢竟只是其中的極少一部分人。

雖然研究組人手十分緊張,但是作為導(dǎo)師有什么理由阻止她出國(guó)做博士后呢?寬松而有活力的 “學(xué)術(shù)土壤”在國(guó)內(nèi)盡管還不多,但越來(lái)越多的 “星星之火”已經(jīng)出現(xiàn)。不必遠(yuǎn)尋,就在生命科學(xué)領(lǐng)域,上海就有多個(gè)研究所具備了專注學(xué)術(shù)、寬容失敗、奮力創(chuàng)新科研氛圍,而且具備了國(guó)際一流的研究實(shí)力。但從整個(gè)科研大環(huán)境來(lái)看,“海歸”標(biāo)簽依然在科研經(jīng)費(fèi)獲取、人才評(píng)價(jià)等方面起著重要作用。不久之前,中國(guó)科學(xué)院神經(jīng)科學(xué)研究所博士后劉真受聘為研究組長(zhǎng),他也曾為是否出國(guó)做博士后而糾結(jié)過(guò)。盡管他留在國(guó)內(nèi)并做出了世界首批克隆猴這樣的杰出工作,但在科研啟動(dòng)期所獲得的資助仍比不上 “海歸”們。

“一個(gè)優(yōu)秀博士生的流失,不僅意味著一段黃金創(chuàng)造力的流失,也可能將國(guó)內(nèi)實(shí)驗(yàn)室的創(chuàng)新科研思路帶給競(jìng)爭(zhēng)對(duì)手?!?/span>痛心之余,覃重軍疾呼,能否更公平地對(duì)待不同路徑成長(zhǎng)起來(lái)的人才,適時(shí)轉(zhuǎn)變?nèi)瞬旁u(píng)價(jià)方式,讓優(yōu)秀博士生不必為了“海歸”標(biāo)簽而出國(guó)。

能否根據(jù)真實(shí)學(xué)術(shù)水平和實(shí)際科研貢獻(xiàn),給予海內(nèi)外青年人才同等待遇?這個(gè)話題再次擺在了我們面前。


編輯整理:科協(xié)改革進(jìn)行時(shí) 

文章來(lái)源:中國(guó)科協(xié)(有刪改)

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