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[上篇] 質(zhì)粒那些事兒

 ypgao 2018-07-20

質(zhì)粒大家并不陌生

那么實驗室里信手拈來的質(zhì)粒,從何而來?

又是如何成為你們手中的“萬能”載體的?

小金先和你聊聊質(zhì)粒那些事兒。


質(zhì)粒一詞從何而來?

                                  

第一個將染色體以外的遺傳物質(zhì)稱之為質(zhì)粒的是美國分子生物學(xué)家Joshua Lederberg

他在發(fā)表于 Physiological reviews的一篇論文中指出,那些對細胞質(zhì)遺傳物質(zhì)的描述例如原生質(zhì)、細胞質(zhì)基因或質(zhì)體基因等,由于概念表述的模糊性,無法統(tǒng)一,大大限制了對這些重要遺傳物質(zhì)的研究和利用。因此,他開創(chuàng)性地提出了質(zhì)粒(Plasmid)這一概念,并廣泛沿用至今。

此后,更多質(zhì)粒被分離出來,更多的生物學(xué)特性也被揭示,如Tsutomu Watanabe等日本科學(xué)家發(fā)現(xiàn)了細菌染色體外的抗生素抗性因子并做了大量研究。

到二十世紀六十年代,科學(xué)家陸續(xù)總結(jié)了質(zhì)粒的基本性質(zhì):自我復(fù)制能力、遷移性、不相容性和特定宿主范圍,這對發(fā)展質(zhì)?;A(chǔ)上的DNA重組技術(shù)奠定了基礎(chǔ)。

質(zhì)粒真正的面目

                                

 質(zhì)粒的神秘面紗逐步被揭開,但它在宿主中究竟是什么樣子的呢?

From Kleinschmidt,A.K., et.al, 1963. Science142(3594), pp.961-961


直到1962年,美國科學(xué)家Walter Fiers和Robert L. Sinsheimer才提出,質(zhì)粒DNA分子是環(huán)狀結(jié)構(gòu)。他們在對噬菌體φX174中存在的的兩種單鏈DNA分子(S1和S2)進行差速沉降等生物物理學(xué)實驗時,發(fā)現(xiàn)了環(huán)狀質(zhì)粒結(jié)構(gòu)存在的證據(jù)。

后續(xù)Albrecht K. Kleinschmidt等科學(xué)家用電鏡實驗證實了這一觀點。

那么是否所有的細菌質(zhì)粒都是環(huán)狀結(jié)構(gòu)呢?

事實并非如此,在十年后的八十年代早期,K. Sakaguchi等科學(xué)家陸續(xù)發(fā)現(xiàn),線性質(zhì)粒其實廣泛存在于不同的放線菌、分枝桿菌和紅球菌屬,這些發(fā)現(xiàn)完善了我們對質(zhì)粒的認知。

 質(zhì)粒大顯身手

                             

隨著質(zhì)粒性質(zhì)和結(jié)構(gòu)研究成果的豐富,科學(xué)家們大膽創(chuàng)新,開始以質(zhì)粒為載體進行DNA重組,基因工程技術(shù)得到了迅猛發(fā)展。

1

生化研究時期

·P. Berg等發(fā)現(xiàn)DNA可產(chǎn)生互補末端,并可利用T4連接酶連接 

·H. Boyer等分離出EcoRI,可用來切除特定的粘性末端

2

分子遺傳研究時期

·S. Cohen和H. Boyer合作完成了完整的基因克隆實驗,經(jīng)過EcoRI酶切和T4連接酶酶連,轉(zhuǎn)化篩選后得到高純度目的質(zhì)粒,為以后的克隆實驗奠定了重要基礎(chǔ)

3

應(yīng)用研究時期

·可用于克隆實驗的質(zhì)粒載體得到極大豐富,使基因工程技術(shù)得到了更加廣泛的利用

一次改變質(zhì)粒命運的偶遇

                                                  

其中S.Cohen和H.Boyer的合作無疑大大加速了分子克隆技術(shù)的成熟和發(fā)展,而這次至關(guān)重要的合作,源自一場特殊的質(zhì)粒會議。

這原本是T.Watanabe(前文R因子的主要研究學(xué)者)組織的美日間質(zhì)粒研究交流會,而會前T.Watanabe因病不幸逝世,幸運的是會議如期舉行,這為當時在遺傳工程領(lǐng)域的兩位佼佼者在熟食店相遇創(chuàng)造了條件。

當時,S.Cohen研究方向是質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化和篩選,而H.Boyer則是在限制性內(nèi)切酶EcoRI的應(yīng)用上成果豐碩。

會議期間,他們在熟食店偶遇,進行了酣暢淋漓的討論,很快做出了合作的決定,可能他們當時都沒有意識到,他們后來的合作研究成果將開啟基因工程的新時代。


除了質(zhì)粒之外,限制性內(nèi)切酶的發(fā)現(xiàn)也是遺傳工程發(fā)展的另一必要條件。

這得益于三位諾貝爾獎得主在這把“魔剪”上的研究。

正是科學(xué)家對限制性內(nèi)切酶的認知,才讓人類由此擁有了對遺傳基因進行改造的能力。

幾十年來,分子生物學(xué)工具迅速發(fā)展更新,應(yīng)用于各類創(chuàng)新性領(lǐng)域,因而質(zhì)粒的數(shù)量和使用頻率迅猛增加。


轉(zhuǎn)錄調(diào)控

蛋白質(zhì)工程

蛋白表達

微生物工程

基因編輯

基因治療

..........

例如各類高效表達難度蛋白的重組表達質(zhì)粒廣泛地應(yīng)用于微生物工程。

帶有熒光標記的融合表達載體大大推動了科學(xué)家在體內(nèi)水平對各類分子及其作用機制的研究;

包括Crispr/Cas在內(nèi)的新型基因編輯技術(shù)催生了大量的基因治療手段……

質(zhì)粒正在各種生物前沿領(lǐng)域的研究中扮演著越來越重要的作用。



但是

質(zhì)粒構(gòu)建不出來怎么辦?

質(zhì)粒多了沒法管理儲存怎么辦?

質(zhì)粒求不到又買不來怎么辦?




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