從1993年第一部《侏羅紀(jì)公園》上映開始算起,加上昨天上映的《侏羅紀(jì)世界-隕落國度》,目前已經(jīng)陸續(xù)有五部系列主題電影上映。盡管侏羅紀(jì)公園電影歸屬于百分百的娛樂電影,但是整個系列的背后卻隱含一個嚴(yán)肅的科學(xué)問題: 在電影中,生物公司InGen在發(fā)掘恐龍化石的時(shí)候意外找到了含有恐龍時(shí)代蚊子的琥珀,科學(xué)家們利用蚊子體內(nèi)的恐龍血DNA復(fù)活了已經(jīng)滅絕的恐龍。 在系列電影第四部《侏羅紀(jì)世界1》中,科學(xué)家更是利用了基因編輯技術(shù),將多種生物的基因融合到恐龍的基因組中,制造出了暴虐龍(Indominus rex)這種兇猛巨大的肉食恐龍。根據(jù)背景簡介和電影中的片段,暴虐龍融合了至少包含霸王龍(Tyrannosaurus),迅猛龍(Velociraptor),樹蛙(tree frog)等物種在內(nèi)的基因。 侏羅紀(jì)公園電影是相當(dāng)優(yōu)秀的科幻電影,雖然談不上完全的“硬核科幻”,但是在交代故事背景上還有具有很強(qiáng)的科學(xué)性。 古DNA測序,基因/基因組編輯,生物克隆等技術(shù)如果在1993年聽起來還近乎于天方夜譚的話,似乎在15年后的現(xiàn)在,他們已經(jīng)不是那么遙不可及了,我們甚至已經(jīng)實(shí)現(xiàn)了其中的不少。 古DNA技術(shù) DNA,脫氧核糖核酸,是一種攜帶生物遺傳物質(zhì)的大分子,是基因的組成單位,主要儲存在細(xì)胞核中,在線粒體和葉綠體等細(xì)胞器中也有少許分布。可以說,一個生物個體的基因組攜帶了這個個體出生時(shí)幾乎全部的遺傳信息。經(jīng)過數(shù)十年的努力,我們今天已經(jīng)獲得了包括人類在內(nèi)的大量生物的DNA信息,甚至我們重建了已經(jīng)滅絕的不少古生物的基因組,其中就包括我們的近親尼安德特人(Homo neanderthalensis),以及猛犸象(Mammuthus)。 今天,就讓我們就從科學(xué)的角度,嚴(yán)肅地討論一下該如何復(fù)活一只恐龍。 大家可能會想,如果條件適合,再加上足夠的運(yùn)氣,我們或許可以從恐龍化石中提取出DNA,邁出復(fù)活恐龍的第一步。 但是很遺憾,這一點(diǎn)幾乎是不可能的。DNA作為一種生物大分子,離開了活的生物體就變得十分脆弱,我們體內(nèi)的DNA每天也在經(jīng)歷著各種各樣的突變,只有有賴于生物體內(nèi)完善的DNA修復(fù)功能,遺傳信息才得以延續(xù)。一旦生物死去,暴露在自然環(huán)境中的DNA會很快降解。 在自然界中,即使是很理想的低溫干燥環(huán)境,DNA的半衰期也只有500年左右,也就是說每隔500年,DNA的有效含量就會變?yōu)樵瓉淼囊话?/span>。如果經(jīng)歷了10萬年,生物體的DNA幾乎可以說分解得連渣都不剩,這也就是為什么我們很少看到報(bào)道超過10萬年的古DNA的論文。 最晚的非鳥類恐龍(Non-avian dinosaur)已經(jīng)在距今6600萬年前的白堊紀(jì)晚期滅絕,要想從恐龍化石或者琥珀中的蚊子血中提取有效的DNA信息,現(xiàn)在來說是一個不可能完成的任務(wù)。 基因編輯與合成生物學(xué) 如果我們不能從化石中提取恐龍的DNA片段,那么換一個思路,我們可不可以從頭去合成恐龍的基因組呢?理論上這一點(diǎn)是可以做到的,如果不考慮復(fù)雜的基因修飾,DNA脫氧核糖核酸都是由核苷酸單體構(gòu)成。核苷酸分子由一個磷酸集團(tuán),一個五碳糖和一個堿基組成,構(gòu)成DNA的核苷酸分為四種,唯一的區(qū)別在于堿基的不同。DNA中有A、G、C、T四種堿基,如果知道了序列,我們可以通過化學(xué)方法來從頭合成(de novo synthesis)特定的基因序列。 合成生物學(xué)(synthetic biology)是一門新興并快速發(fā)展的學(xué)科,通過模塊化的方法來設(shè)計(jì)、改造、合成生物元件,并可以通過組合生物學(xué)元件來構(gòu)成有功能的生物調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。簡單的說,合成生物學(xué)把基因序列當(dāng)做一個個零件,通過組合這些零件來獲得需要的功能,甚至獲得“人造生命”,就好像搭積木。其中,生物元件可以是生物體內(nèi)已有的,也可以是人為優(yōu)化過的,甚至可以從頭設(shè)計(jì)。 2010年5月20日,美國的生物學(xué)家文特爾(Craig Venter)率領(lǐng)的研究小組在《科學(xué)》雜志上報(bào)道了首例人造細(xì)胞,這是有史以來人類創(chuàng)造的第一個能夠自我復(fù)制的細(xì)胞。他們將這個細(xì)胞命名為“辛西婭”(Synthia),意為人造之子?!靶廖鲖I” 擁有大約900個基因,整個基因組序列包含超過100萬個堿基對。但是“辛西婭”是一個原核細(xì)胞,缺乏細(xì)胞核結(jié)構(gòu)和很多真核生物必要的細(xì)胞器。 2017年的3月10日,同樣也是在《科學(xué)》雜志上,中國科學(xué)家宣布人工合成了真核生物釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的4條染色體,這標(biāo)志著科學(xué)家現(xiàn)在有能力去合成大片段、有活性的真核細(xì)胞染色體,這也無疑是人類在“合成生命”的道路上邁出的一大步。 釀酒酵母 釀酒酵母的單個染色體大小在100萬個堿基對左右,總的基因組大小大約為12Mb,也就是相當(dāng)于大約1200萬個堿基對,而人類的基因組大小為3Gb,現(xiàn)生的動物中與非鳥類恐龍親緣關(guān)系接近的鳥類和鱷魚基因組大小也是Gb這個數(shù)量級,家雞的略大于1Gb,鱷魚的有大約2.5Gb。 我們可以推測恐龍的基因組大小應(yīng)該也在1到幾個Gb這個數(shù)量級,但是一方面,恐龍究竟有多少條染色體,每條染色體的長度,和最關(guān)鍵的基因序列信息,我們一無所知。另一方面,要人工合成幾十上百個Mb大小的染色體,目前來說還是非常困難的。 既然現(xiàn)在從頭合成這條路走不通,那么我們可不可以去修改一下那些和恐龍比較接近的動物的基因組,從而得到一只“恐龍雞”或者“恐龍鱷魚”呢?事實(shí)上,類似的項(xiàng)目很早就被提出,而且早已付諸實(shí)驗(yàn)。 可能與大家想象的不一樣,“復(fù)活恐龍”這一點(diǎn)在正兒八經(jīng)的恐龍研究中幾乎沒有市場,有點(diǎn)類似于“超光速飛船”課題在航天研究中的地位,盡管很吸引人很酷,但是實(shí)際的可行性上非常低。關(guān)于“恐龍雞”這樣的實(shí)驗(yàn)也是為了發(fā)育生物學(xué)的研究,研究者本人對于“復(fù)活恐龍”這一話題沒有表現(xiàn)出太多興趣。 回到問題,在2015年,耶魯大學(xué)的Bhuart-Anjan Bhullar課題組就通過對雞胚胎的基因編輯使其原本在發(fā)育過程當(dāng)中消失的牙齒保留了下來。 但是涉及到生物倫理學(xué)的問題,這批雞胚胎并沒有最終孵化成為“恐龍雞”。 Anjan本人表示不想創(chuàng)造類似“恐龍雞”的物種,也對復(fù)活恐龍缺乏興趣,他所在的研究團(tuán)隊(duì)只想了解在演化過程中恐龍長滿牙齒的嘴是如何變成鳥喙的。理論上,我們有可能通過修改現(xiàn)代鳥類的基因組來獲得一種更像恐龍而不是鳥的生物,但目前來說幾乎是不可能的。 在非鳥類恐龍向鳥類轉(zhuǎn)變的過程中,至少有上百個的特征發(fā)生了變化,每個特征的背后都是多個基因共同調(diào)控的結(jié)果,我們今天還沒有辦法完全破譯這些復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),而且生物的個體發(fā)育需要大量基因按照時(shí)空順序的精密調(diào)控,貿(mào)然修改部分序列可能會導(dǎo)致整個系統(tǒng)的崩潰。 就好像我們已經(jīng)拿到了一本書,但是卻沒有辦法正確地閱讀,因此修改書中的內(nèi)容也就無從談起。另一方面,現(xiàn)在的基因編輯技術(shù)對于同時(shí)改變多個序列,或者合成基因組規(guī)模的DNA序列依然存在較大困難。 克隆技術(shù) 世界上第一只克隆動物是1996年出生(1997年媒體對外公布)的克隆羊“多利”(Dolly),隨后人們又成功克隆了包括豬,牛,猴在內(nèi)的多種哺乳動物。 如果仔細(xì)觀察就會發(fā)現(xiàn),在已經(jīng)被克隆的生物名單中并不包括爬行動物(包括鳥類)這一大類卵生的生物。主要是由于以下原因: 1、爬行動物(包括鳥類)的生殖方式和哺乳動物大相徑庭,最重要的區(qū)別在于哺乳動物的胚胎發(fā)育是在母體子宮和輸卵管內(nèi)完成的,而大多數(shù)的爬行動物的胚胎發(fā)育是在蛋中完成的,而我們現(xiàn)在的技術(shù)還沒有辦法去復(fù)制一個“蛋”。同時(shí),鳥的卵細(xì)胞結(jié)構(gòu)和哺乳動物也有很大區(qū)別,在移除原有細(xì)胞核并植入新的細(xì)胞核時(shí)會有很大的困難。 2、相比哺乳動物,我們對爬行動物的基因和生殖方式了解很少,這就造成了很多技術(shù)細(xì)節(jié)上的困難。 3、大多數(shù)的畜牧業(yè)動物是哺乳動物,受到的關(guān)注明顯要多于其他類群的生物,也就造成了相對少的研究投入。 根據(jù)化石材料,我們相信恐龍是一種卵生的動物,如果要復(fù)活恐龍,無論是修改現(xiàn)有生物的基因組還是從頭合成,蛋都是無法繞開的一個步驟。 想要復(fù)活恐龍的第一步應(yīng)當(dāng)是克隆雞和鱷魚這些類似于恐龍的生物,之后才是基因?qū)用娴难芯?/span>。或許真的有一天,合成生物學(xué)可以讓我們隨心所欲的搭建生命,就像樂高積木那樣,在實(shí)驗(yàn)室里我們就可以造出兇猛的霸王龍和高大的梁龍,還可以去復(fù)活那些因?yàn)槲覀兌鴾缃^的生物。當(dāng)然,這其中會有很多很復(fù)雜的生物學(xué)問題,還會涉及到倫理學(xué),生態(tài)保護(hù)等等問題,但是無論怎樣,我們的想象力和創(chuàng)造力都不應(yīng)被限制。 |
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