▎藥明康德/報(bào)道

每年全世界有超過(guò)1400萬(wàn)患者被診斷患上癌癥，其中大多數(shù)患者在確診時(shí)腫瘤已經(jīng)處于晚期或已經(jīng)擴(kuò)散。這時(shí)無(wú)論是手術(shù)還是藥物治療的效果都不佳。如果可以提早診斷，就有望提高癌癥生存率。

基于分析血液循環(huán)細(xì)胞DNA(cell-free DNA，cfDNA)的液體活檢(liquid biopsy)正在逐漸成為新一代癌癥的診斷方法。該技術(shù)的原理是癌癥患者的cfDNA中含有腫瘤細(xì)胞釋放的循環(huán)腫瘤DNA(circulating tumor DNA, ctDNA)。與高通量測(cè)序技術(shù)(NGS)和先進(jìn)算法相結(jié)合，研究人員已經(jīng)能夠通過(guò)ctDNA檢測(cè)確定腫瘤中的基因變異。但是這一手段目前大多被用于分析晚期癌癥患者的腫瘤。早期腫瘤釋放到血液中的ctDNA片段數(shù)目非常稀少，對(duì)液體活檢技術(shù)的應(yīng)用產(chǎn)生限制。

▲循環(huán)腫瘤DNA（ctDNA）是腫瘤細(xì)胞釋放到血液中的DNA片段，有可能反應(yīng)整個(gè)腫瘤基因組，因此具有臨床應(yīng)用潛力。(圖片來(lái)源：維基百科)

近期，約翰霍普金斯大學(xué)(Johns Hopkins University)醫(yī)學(xué)院的研究人員開(kāi)發(fā)出一種稱(chēng)為靶向錯(cuò)誤矯正測(cè)序(targeted error correction sequencing, TEC-Seq) 的超級(jí)敏感的ctDNA檢測(cè)方法，有望解決癌癥無(wú)創(chuàng)早期檢測(cè)的難題。這項(xiàng)研究發(fā)表在近期的《Science Translational Medicine》雜志上。

TEC-seq 是基于腫瘤組織的檢測(cè)原理開(kāi)發(fā)出的ctDNA的檢測(cè)方法。它對(duì)結(jié)直腸癌、乳腺癌、肺癌、卵巢癌等癌癥類(lèi)型中最常出現(xiàn)58種致癌基因進(jìn)行深度測(cè)序和分析。這58個(gè)基因片段總長(zhǎng)只有80930個(gè)堿基對(duì)，但是測(cè)序深度達(dá)到30000X。除了深度測(cè)序以外，研究人員還對(duì)測(cè)序流程做出了一系列改進(jìn)來(lái)提高檢測(cè)的靈敏度。其中包括：優(yōu)化測(cè)序庫(kù)的生成和靶向片段的捕捉，通過(guò)加入少量外源條形碼(barcode)最大化獨(dú)特ctDNA在測(cè)序庫(kù)中的呈現(xiàn)可能，以及在后期分析時(shí)過(guò)濾掉測(cè)序錯(cuò)誤和其它原因?qū)е禄蜃儺悺?/span>