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NCBI在線查找基因序列及其上下游1000bp序列

 wuhuaguo88l 2017-08-14

最近研究6個疾病基因,需要在NCBI下載基因序列及其上下游1000bp序列,經朋友推薦,方法如下:

以基因BRAF為例

第一步:在NCBI的gene中輸入BRAF(human)如下:

http://www.ncbi.nlm./gene/673

第二步:點擊右上方Genomic regions, transcripts, and products,如圖:

NCBI在線查找基因序列及其上下游1000bp序列

 
出現以下頁面:
NCBI在線查找基因序列及其上下游1000bp序列

 
點擊:Go to reference sequence details,出現一下頁面:
NCBI在線查找基因序列及其上下游1000bp序列

 
選擇Reference GRCh37.p5 Primary Assembly(推薦使用),在Download GenBank, FASTA, Sequence Viewer (Graphics)中點擊GenBank,如圖所示:
 
NCBI在線查找基因序列及其上下游1000bp序列

 
選擇右上方的Change region shown,Selected region,對起始和終止位置加減即可達到選擇上下游區(qū)域的目的
 

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