與阿莫西林有配伍禁忌的藥物有：硫酸阿米卡星、卡那霉素、慶大霉素、鏈霉素、磷酸克林霉素、鹽酸林可霉素、粘菌素甲磺酸鈉、多粘菌素B、琥珀氯霉素、紅霉素乙基琥珀酸鹽和乳糖酸鹽、四環(huán)素類注射劑、新生霉素、頭孢噻吩、萬古霉素、兩性霉素B、異丙嗪、苯妥英鈉、腎上腺素、間羥胺、多巴胺、阿托品、鹽酸肼酞嗪、水解蛋白、氯化鈣、葡萄糖酸鈣、維生素B族、維生素C、含有氨基酸的營養(yǎng)注射劑、多糖(如右旋糖酐40)和氫化可的松琥珀酸鈉等。此外，銅、鋅、汞、酸性溶液、氧化劑或還原劑中的羥基化合物及鋅化物制造的橡皮管及瓶塞均可使本藥活性下降。