液態(tài)活檢破譯密碼
日期:2016-07-17 作者:辰宇 來源:文匯報 ![]() ![]() ![]() ![]() ■辰宇 編譯 一滴血里包含著很多信息,對科學(xué)家來說,關(guān)鍵是檢測什么?各種信息又意味著什么? 事實上在癌癥早期,腫瘤細胞的遺傳信息也會釋放進入血液循環(huán)中,從而泄露它們存在的蹤跡。 “液態(tài)活檢”可以幫助醫(yī)生讀懂這些線索,盡早阻止癌癥的發(fā)展。 凱西·利姆懷孕11周,從血液樣本中發(fā)現(xiàn)多個DNA片段異常。進一步分析表明,DNA突變并非來自胎兒,而是來自她自身的白細胞———兩年半前被她戰(zhàn)勝的濾泡性淋巴瘤的癌細胞,已悄然卷土重來。 在眾多癌癥患者中,利姆算是幸運的。通常癌癥在擴散和轉(zhuǎn)移之后才會被發(fā)現(xiàn),癌細胞強大的進化能力,以及抵御最佳治療方法的能力,使得癌癥成為人人談虎色變的可怕“殺手”。要想根除癌細胞,就要反復(fù)對腫瘤進行切片分析,這種侵入性治療方式對病人身體有很大的傷害,而且風(fēng)險很大。 那么我們?nèi)绾尾拍艹掷m(xù)關(guān)注癌細胞變化,隨時檢測是不是有癌細胞暗中生長起來,從而找出最好的方法來治愈癌癥呢? 如今新的研究發(fā)現(xiàn),關(guān)于癌細胞發(fā)展動向的答案可能就寫在我們的血液里。如果在血液中檢測到腫瘤細胞釋放到血液循環(huán)中的一小點DNA片斷,醫(yī)生就能早期發(fā)現(xiàn)癌癥的存在。 約翰霍普金斯大學(xué)路德維希癌癥基因治療中心主任伯特·沃格爾斯坦表示,“癌癥治療的最佳時機是在癌細胞數(shù)量很少的時候,這時它們很少有機會產(chǎn)生抗藥性?!?/p> 微弱的癌細胞基因信號 所有的細胞,包括癌細胞,死亡時都會將它們的DNA釋放進入血液中,而癌癥患者血液中這種自由漂浮的DNA比健康人更多。 沃格爾斯坦的實驗室是致力于研究通過血液檢測早期發(fā)現(xiàn)癌癥并追蹤癌細胞動向的實驗室之一。為了提高這種“液體活檢”在臨床應(yīng)用中的可靠性,他們需要找出并破解腫瘤細胞留在血液中的微弱的基因信號。 在癌癥的早期階段,癌細胞掉落下來的這種DNA碎片很小,難以覺察,但隨著腫瘤的生長,這種DNA片斷也變得越來越大。 這種DNA片斷被稱為循環(huán)腫瘤基因,簡稱為ctDNA,是一種特征性的腫瘤生物標(biāo)記。通過ctDNA檢測,可在血液樣本中跟蹤檢測到腫瘤的活動蹤跡。 上世紀(jì)90年代后期,丹尼斯·羅(如今在香港中文大學(xué)) 就開始研究早期發(fā)現(xiàn)癌癥的ctDNA檢測法。當(dāng)時他的研究重點是非侵入式的胎兒異常檢測,最終研究出了通過母親血清檢測胎兒DNA異常的方法。在此之后的10年里,他又開發(fā)了通過血檢發(fā)現(xiàn)唐氏綜合征的方法,同時他還將目光瞄準(zhǔn)了癌癥的早期檢測。 腫瘤DNA要比胎兒DNA少得多,但隨著基因測序技術(shù)的進步,科學(xué)家發(fā)現(xiàn)并解讀腫瘤DNA的能力也在提高。最簡單的方法是搜尋從切片檢查中已經(jīng)獲知的基因突變類型。 2007年,沃格爾斯坦的研究團隊利用這種方法,對18名大腸癌患者體內(nèi)的腫瘤細胞進行監(jiān)測。單鏈DNA片斷會粘附在相應(yīng)的核苷酸序列片斷上。只要獲得了血液樣本中所有DNA片斷的多份拷貝,利用一種叫做PCR的分子生物學(xué)技術(shù)放大特定的DNA片段,然后利用覆有目標(biāo)突變DNA序列拷貝的磁性小珠,吸附樣本中的突變DNA,由此計算出它們在血液中的濃度。 患者的腫瘤細胞經(jīng)手術(shù)切除后,血液檢測仍可以檢測到ctDNA。大多數(shù)手術(shù)后患者,雖然體內(nèi)癌細胞數(shù)量已大幅減少,但癌細胞不久又會卷土重來,但也有一小部分血檢中沒有檢測到腫瘤DNA的患者,癌癥沒有復(fù)發(fā)。顯然,通過血液檢測癌細胞活動狀態(tài)的這種“液體活檢”法,可以成為一種行之有效的癌癥檢測和監(jiān)測手段。 從那時開始,沃格爾斯坦發(fā)現(xiàn),幾乎所有類型癌細胞的DNA片斷都會進入血液中。2014年,他的團隊宣布,在一組640名各類癌癥患者中,其中75%患者的血液中都檢測到了ctDNA,包括晚期胰腺癌、卵巢癌、結(jié)腸直腸癌和乳腺癌。另外,腦癌、腎癌和前列腺癌進入血液中的癌細胞片斷似乎少一些,不過仍可在一半晚期患者的血液中檢測到。 關(guān)于癌細胞的一個極具諷刺的嚴(yán)峻事實是:癌細胞會通過不斷進化躲避各種治療手段,用的抗癌藥物越好,就越會激起癌細胞更強的抗藥性。美國麻省總醫(yī)院癌癥中心主任丹尼爾·哈伯介紹說:“有些治療癌癥的靶向藥物十分有效,是因為它們是根據(jù)癌細胞的重要生物學(xué)變化篩選出來的。其原理就是跟蹤監(jiān)測血液中癌細胞的動向?!?/p> 倫敦癌癥研究所的德莉拉·坦德菲爾德和她的同事進行的正是這方面的研究。他們每個月定期從晚期前列腺癌患者身上提取血樣,目的是觀察已知基因序列的變化,以預(yù)測患者對前列腺癌治療藥物阿比特龍的反應(yīng)。這種預(yù)測方法比傳統(tǒng)臨床預(yù)測方法,如CT掃描,可提前4個月發(fā)現(xiàn)預(yù)測癌細胞的抗藥性,醫(yī)生就可以采取另外的治療方案,而不再給病人服用阿比特龍,因為它對患者可能是有害無益的。 腫瘤標(biāo)記物非常罕見 “液態(tài)活檢”的前景十分誘人,但要投入實際應(yīng)用卻不是一個容易達成的目標(biāo)。最重要的是開發(fā)出一種能夠?qū)o癥狀患者做出早期診斷的測試方法。 鑒于目前幾乎半數(shù)癌癥都是在晚期才被診斷發(fā)現(xiàn)這一現(xiàn)實,一種能夠通過血檢早期診斷出癌癥的方法,顯然可以挽救數(shù)百萬人的生命。 但問題是,究竟要在血樣里檢測什么? 如果已經(jīng)有了癌組織的樣本,相對就比較容易,只要在血液樣本中尋找相關(guān)的基因突變就可以了。但是如果沒有可以對照的樣本,就不得不對所有類型的突變進行檢測篩查。更令人頭痛的是,癌癥初發(fā)階段血液里的ctDNA極為稀少。哈伯說:“血液里含有太多東西,相比之下,來自癌細胞的DNA片斷就顯得很不起眼了?!?/p> 還有一種辦法是對血液中所有的循環(huán)DNA進行測序,然后檢查染色體各部分比例是否有異常。任何異常復(fù)制、刪除或重新排列,都代表了癌癥的特點和標(biāo)志。 2012年,沃格爾斯坦的團隊對來自晚期乳腺癌、結(jié)腸直腸癌患者以及10名健康者的血液樣本進行了DNA測序,研究對比其結(jié)構(gòu)上的不同。研究發(fā)現(xiàn),所有癌癥患者的DNA結(jié)構(gòu)都出現(xiàn)了異常,而健康者的DNA結(jié)構(gòu)都很正常。 不過,目前還無法肯定這一技術(shù)是否一定能夠在早期檢測到癌癥的發(fā)生,因為這時可供分析的異常DNA片斷還太少,不能確定是否能夠檢測到具有診斷意義的變化,也無法區(qū)別有害與無害的變化。 另外,即使這種測試能達到足夠高的靈敏度和廣泛度,檢測到癌癥剛露頭時的蹤跡,也有可能因產(chǎn)生的假陽性而被誤導(dǎo) (見“相關(guān)鏈接”:當(dāng)“癌”非癌時),除非能通過某些成像技術(shù)對結(jié)果加以確認。 另外,即使能檢測到某種癌癥的基因信號,又如何知道癌細胞在身體的哪個部位呢? 不過,有些基因突變可提供一些線索,如KRAS基因突變通常與肺癌、結(jié)腸癌或胰腺癌相關(guān)。其他的一些基因突變,如p53基因突變,可能與所有的癌癥相關(guān)。 “液態(tài)活檢”的具體應(yīng)用 癌細胞從最初出現(xiàn)突變到發(fā)展成為轉(zhuǎn)移性腫瘤,平均需要20至30年。這是一個有著較大干預(yù)余地的窗口期,是一個尚未開發(fā)的醫(yī)學(xué)檢測領(lǐng)域。 好消息是,ctDNA不是血液中唯一的腫瘤衍生物,另外還有循環(huán)腫瘤細胞(CTC),只是它比ctDNA更難檢測到,通常每一百萬個細胞中只有一個CTC,而且還有可能要等癌癥發(fā)展到晚期才會進入血液循環(huán)中。 不過,要“逮住”它們也不是沒有辦法,例如,根據(jù)這種細胞體積較大的特點,將它們與較小的白細胞分開,或者通過可以附著在特殊細胞表面的磁性物質(zhì)將CTC分揀出來。與ctDNA相比較,CTC可以揭示更多關(guān)于癌癥的信息。 通過CTC不僅可以發(fā)現(xiàn)腫瘤DNA的信息,還可以發(fā)現(xiàn)RNA的相關(guān)信息,RNA是幫助將基因密碼轉(zhuǎn)化為蛋白質(zhì)的一種化學(xué)媒介。多了這些信息,就增加了鎖定癌癥發(fā)病部位的機會,提供了導(dǎo)致癌癥基因重組的更多線索,如DNA的位置轉(zhuǎn)移。如果染色體上的一部分DNA轉(zhuǎn)移到另一個不同位置上,會導(dǎo)致附近的基因表達發(fā)生變化。這類信息對于前列腺癌的診斷具有重要意義,因為這種癌癥的特點通常表現(xiàn)為DNA位置移動,而不是某種基因突變。 另一個可供選擇的檢測項目是血小板。受傷流血時,血液中的血小板可迅速凝血成塊,起到止血并促進傷口愈合的作用。在血液中循環(huán)時,血小板會將它們遇到的身體組織掉落的RNA碎片積聚起來,這其中也包括癌細胞的RNA片斷。通過對這些RNA的基因測序,在還無法檢測到CTC之前,就能盡早發(fā)現(xiàn)腫瘤細胞的存在。 阿姆斯特丹自由大學(xué)醫(yī)學(xué)中心的托馬斯·伍丁格和他的同事最近利用血小板RNA檢測方法區(qū)分癌癥患者和健康人,準(zhǔn)確率達到96%,確定腫瘤位置的準(zhǔn)確率達到71%。 另外可供檢測的還有外來體,指的是含有DNA、RNA和蛋白質(zhì)的微小分泌物團。去年,德克薩斯大學(xué)醫(yī)學(xué)中心的研究人員通過在血液樣本中尋找載有特殊蛋白質(zhì)的外來體,從健康人群中篩選出了胰腺癌患者。 在早期發(fā)現(xiàn)癌癥的診斷中,ctDNA雖然不是唯一的選擇項,但它仍然是一個強有力的競爭者。另外,研究人員解讀DNA片斷的技術(shù)也在提高和改進。例如,丹尼斯·羅的研究團隊開發(fā)了一種甲基檢測新技術(shù),甲基是一種粘附在DNA上的“化學(xué)標(biāo)簽”,通常會改變基因表達。研究人員可以根據(jù)這一特點跟蹤ctDNA。 凱西·利姆的癌癥能被及時發(fā)現(xiàn),是因為她將一份血樣給了羅,羅就是用這種新的技術(shù)方法檢測到了異常DNA,并一直跟蹤到凱西的免疫細胞。羅建議她盡早進行化療治療,“懷孕初期的患者通常都會選擇中止妊娠、接受化療,目前患者情況良好?!?/p> 羅和他的同事最近還發(fā)現(xiàn),來自腫瘤細胞DNA片斷的長度明顯異常,與正常細胞的DNA片斷相比較,不是太短,就是太長。實驗顯示,光是這些太短或太長的DNA片斷,就足以區(qū)別肝癌患者和健康人,甚至在癌癥剛開始出現(xiàn)的早期。 隨著這類檢測方法靈敏度的提高,將給癌癥檢測手段帶來真正的變革。在沃格爾斯坦看來,即使不能完全可靠地在最早階段檢測到癌癥,以血液檢查為基礎(chǔ)的“液態(tài)活檢”方法,仍然是一個非常有價值的開端。 相關(guān)鏈接 當(dāng)“癌”非癌時 癌癥發(fā)現(xiàn)越早,越容易治療。但近年來,早期的癌癥篩查法越來越不被看好,因為這種方法常會將健康人誤診為癌癥潛在患者。這不僅會給人們帶來許多不必要的精神壓力,同時還會導(dǎo)致許多本身帶有風(fēng)險的不必要的治療。 例如PSA篩查法,是通過前列腺特異抗原水平 (PSA指標(biāo)) 的升高來篩查前列腺癌的。但實際上也有例外,PSA水平高的人不一定患有前列腺癌,而PSA水平低的人有時反而會有前列腺癌。這是因為 PSA是由前列腺中所有細胞產(chǎn)生的,而不僅僅是癌細胞產(chǎn)生的。之所以前列腺癌患者的PSA水平通常會升高,是因為腫瘤的大量增殖會產(chǎn)生更多細胞,但普通的感染也會導(dǎo)致PSA水平升高。 如今研究人員開發(fā)的通過查找癌細胞基因“簽名”的血液檢查法,則可避免這類問題。這是因為與癌癥相關(guān)的基因突變是某種癌癥所特有的,尋找循環(huán)腫瘤DNA的測試方法不可能誤標(biāo)記良性腫瘤,因為它們不會脫落這種類型的DNA。 但這并不是說,利用DNA或腫瘤細胞產(chǎn)生的其他碎片的方法就完美無缺了。例如在血液里可檢測到癌細胞的DNA,但由于初期階段它們實在太小,即使是最先進的鏡像技術(shù)也無法探查到它們的存在。另外,即使發(fā)現(xiàn)了癌細胞的存在,也有可能無法確定它的具體位置、無法確定是否會有生命威脅。 專家建議,檢測發(fā)現(xiàn)癌細胞后,可在半年后再復(fù)查一次,如果 DNA“簽名”的數(shù)量增多,就意味著身體內(nèi)存在有生長中的腫瘤。 最初檢測到癌細胞的存在,幾乎都會讓患者驚慌失措,從而導(dǎo)致許多不必要的治療。“在我們的這個社會里,只要得知身體里可能有癌細胞的存在,是一件讓人很難接受的事情?!奔s翰霍普金斯大學(xué)的伯特?沃格爾斯坦說。 癌癥的血液檢測法被普遍接受之前,首先需要改變我們的一些觀念。醫(yī)生也會謹(jǐn)慎考慮如何利用這種測試方法。美國麻省總醫(yī)院癌癥中心主任丹尼爾?哈伯介紹說:“我們?nèi)缃裾谶M入一個新的時代,可以通過血液檢測了解以前無法獲得的一些信息。我們將面臨以前PSA檢測同樣的一些問題,如哪些人需要測試、積極的檢測意味著什么、如何解讀檢測結(jié)果等?!?/p> ●在英國, 46%的癌癥都是在晚期才被診斷出來。 ●美國癌癥研究院2014年的研究經(jīng)費中,只有用12.8%于癌癥的早期檢測和診斷。 ●在美國,只有的15%肺癌在發(fā)生轉(zhuǎn)移前被發(fā)現(xiàn)。 |
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