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生物信息(bioinformation)數(shù)據(jù)庫(已整理)

 zhuqiaoxiaoxue 2015-09-25
主要序列數(shù)據(jù)庫

DDBJ序列數(shù)據(jù)庫
http://www.ddbj.
所有已知的核酸和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫,國際核酸序列數(shù)據(jù)庫合作項(xiàng)目

EMBL序列數(shù)據(jù)庫
http://www./embl.html
所有已知的核酸和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫,國際核酸序列數(shù)據(jù)庫合作項(xiàng)目

GenBank序列數(shù)據(jù)庫
http://www.ncbi.nlm.
所有已知的核酸和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫,國際核酸序列數(shù)據(jù)庫合作項(xiàng)目

STACK
http://www./Dbases.html
非冗余的基因簇

TIGR基因索引
http://www./tdb/index.shtml
非冗余的基因簇

UniGene
http://www.ncbi.nlm./UniGene/
非冗余的基因簇


比較基因組學(xué)(comparative genomics)


COG數(shù)據(jù)庫
http://www.ncbi.nlm./COG/
基于43個(gè)已完成基因組測序的微生物的蛋白質(zhì)的進(jìn)化分析的同源基因蔟

XREFdb
http://www.ncbi.nlm./XREFdb/
模式生物(model organism)遺傳學(xué)和哺乳類表型之間的交叉索引

ASDB
http://Cbcg./asdb
具有不同剪接形式基因的蛋白質(zhì)產(chǎn)物和表達(dá)模式

基因表達(dá)

Axeldb
http://www./abt0135/axeldb.htm
爪蟾的基因表達(dá)

BodyMap
http://Bodymap.ims.
人和小鼠基因表達(dá)數(shù)據(jù)

EpoDB
http://www.cbil./EpoDB/
脊椎動物(vertebrates)紅細(xì)胞基因表達(dá)

FlyView
http://Pbio07.
果蠅的發(fā)育和遺傳

GXD基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫
http://www.informatics./mgihome/GXD/aboutGXD.shtml
小鼠的基因表達(dá)和遺傳

腎臟發(fā)育數(shù)據(jù)庫(KDD)
http://golgi.ana./kidhome.html
腎臟發(fā)育和基因表達(dá)

MAGEST
http://www.genome./magest/welcome.html
海鞘基因表達(dá)模式

MethDB
http://www.
DNA甲基化數(shù)據(jù)、模式和輪廓

小鼠基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(MAGED)
http://Genex.hgu.
與組織相關(guān)的基因表達(dá)數(shù)據(jù)

PEDB
http://www./
正常和異常的前列腺基因表達(dá)

RECODE
http://Recode.genetics.
表達(dá)過程中采用程序化翻譯編碼的基因

斯坦福微陣列數(shù)據(jù)庫(SMD)
[url=http://genome-www./microarray]http://Genome-www.Stanford.edu/microarray[/url]
來自微陣列實(shí)驗(yàn)的原始和均一化了的數(shù)據(jù)

TRIPLES
http://Ygac.med./triples/triples.htm
酵母中轉(zhuǎn)座子—插入表型、定位和表達(dá)

牙齒發(fā)育數(shù)據(jù)庫(TDD)
http://Bite-it.Helsinki.fi
牙組織發(fā)育中的基因表達(dá)


基因特征和結(jié)構(gòu)


AllGenes
http://www.
人和小鼠基因索引、整合基因、轉(zhuǎn)錄和蛋白注釋

Ares Lab Intron Site
http://www.cse./research/compbio/yeast_introns.html
酵母剪接體和內(nèi)含子

COMPEL
http://compel.bionet./
復(fù)合調(diào)控元件(Composite regulatory elements)

CUTG
http://www.kazusa./codon/
遺傳密碼使用表

DBTBS
http://dbtbs./
枯草桿菌反式作用因子和啟動子

EID
http://mcb./gilbert/EID/
內(nèi)含子、外顯子數(shù)據(jù)庫

EPD
http://www.epd./
通過實(shí)驗(yàn)獲得的真核生物POL II啟動子非冗余數(shù)據(jù)庫

ExInt
http://intron.bic./exint/exint.html
真核生物外顯子和內(nèi)含子結(jié)構(gòu)

HUNT
http://www./HUNT
注釋了的人類全長cDNA序列

IDB/IEdb
http://nutmeg.bio./intron/index.html
內(nèi)含子序列和進(jìn)化

PLACE
http://www.dna.affrc./htdocs/PLACE
植物順式調(diào)控元件



遺傳學(xué)和物理圖譜


名稱
地址
說明

DRESH
http://www./LOCAL/drosophila/dros.html

果蠅突變基因同源的人cDNA克隆

G3-RH
http://www-shgc./RH/
斯坦福G3和TNG輻射雜交圖譜

GB4-RH
http://www.Sanger.ac.uk/Software/RHserver/RHserver.shtml
人輻射雜交圖譜Genebridge4 (GB4)

GDB
http://www./
人類基因和基因組圖譜

GenAtlas
http://www.dsi./genatlas/
人類基因、標(biāo)記和表型

GenMapdb
http://genomics.med./genmapdb
已經(jīng)定位的人BAC克隆

GenMap’99
http://www.ncbi.nlm./genemap/
國際輻射圖譜合作項(xiàng)目下的人類基因圖譜

HugeMap
http://www./services/Hugemap
人類基因組遺傳和物理圖譜數(shù)據(jù)

IXDB
http://ixdb.mpimg-berlin-dahlem./
人類x染色體物理圖譜

RHdb
http://www./RHdb
輻射雜交圖譜數(shù)據(jù)基因組數(shù)據(jù)庫


名稱
地址
說明

AceDB
http://www./Software/Acedb/
線蟲(C.elegans),酵母(S.pombe)的序列和基因組信息

AmmtDB
http://bighost.area.ba./mitochondriome/
寄生蟲(Metazoan)線粒體DNA序列

ArkDB
http://www./sites.html
農(nóng)業(yè)相關(guān)和其他動物的基因組數(shù)據(jù)庫

綜合的微生物資源(CMR)
http://www./tigr-scripts/CMR2/CMRHomePage.spl
已完成測序的微生物基因組

CropNet
http:///
農(nóng)作物基因組圖譜

CyanoBase
http://www.kazusa./cyano/

Synechocystis sp.基因組

EMGlib
http://pbil./emglib/emglib.html
已完成基因組測序的細(xì)菌、古細(xì)菌、酵母

EcoGene
http://bmb.med./EcoGene/EcoWeb/
大腸桿菌(Escherichia coli)(E.coli)K-12的序列

FlyBase
http://www./
果蠅基因序列和基因組信息

Full-Malaria
http://fullmal.ims./
紅細(xì)胞期惡性瘧原蟲的全長cDNA文庫

GOBASE
http://megasun.bch./gobase/gobase.html
細(xì)胞器基因組數(shù)據(jù)庫

GOLD
http://igweb./GOLD/
已完成和正在進(jìn)行測序項(xiàng)目的信息

HIV序列數(shù)據(jù)庫
http://hiv-web./


HIV的RNA序列

Human BAC Ends Database
http://www./tdb/humgen/bac_end_search/bac_end_intro.html
非冗余的人類BAC末端序列

ICB
http://www./icb
采用蛋白編碼進(jìn)行細(xì)菌的分類和鑒定

INE
http://rgp.dna.affrc./giot/INE.html
水稻(Rice)的遺傳學(xué)、物理圖譜和序列數(shù)據(jù)

MITOMAP
http://www./
人類線粒體基因組

MITOP
http://mips./proj/medgen/mitop/
線粒體蛋白、基因和疾病

苜蓿屬基因組數(shù)據(jù)庫(MGI)
http://www./medicago/


模式苜蓿屬莢果(1egumeMedicago)的ESTs、基因表達(dá)和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)

Mendel數(shù)據(jù)庫
http://www./
利用基因家族信息注釋的植物EST和STS序列數(shù)據(jù)庫

MitoDat
http://www-lecb./mitoDat/
線粒體蛋白(以人類為主)

小鼠基因組數(shù)據(jù)庫(MGD)
http://www.informatics./


小鼠遺傳學(xué)和基因組

慕尼黑蛋白質(zhì)序列信息中心(MIPS)
http://www.mips.biochem./


蛋白質(zhì)和基因組序列

NRSub
http://pbil./nrsub/nrsub.html


枯草芽胞桿菌(Bacillus subtilis)基因組

PlasmoDB
http:///


瘧原蟲屬(Plasmodium)基因組

酵母基因組數(shù)據(jù)庫(SGD)
[url=http://genome-www./Saccharomyces]http://genome-www./Saccharomyces[/url]


釀酒酵母基因組

TIGR微生物數(shù)據(jù)庫
http://www./tdb/mdb/mdbcomplete.html


微生物基因組和染色體

擬南芥(Arabidopsis thaliana)信息資源(TAIR)
http://www./


擬南芥(Arabidopsis thaliana)基因組

ZFIN
http://www./


斑馬魚遺傳學(xué)、基因組和發(fā)育數(shù)據(jù)

ZmDB
http://zmdb./


玉米基因組數(shù)據(jù)庫






分子間相互作用



名稱
地址
說明

生物分子交互作用網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(BIND)
http:///


分子間相互作用、復(fù)合物和通路

DIP
http://dip.doe-mbi./


蛋白質(zhì)之間相互作用目錄

DPInteract
http://arep.med./dpinteract/


大腸桿菌(Escherichia coli)DNA結(jié)合蛋白的結(jié)合位點(diǎn)

核糖體交叉鏈接數(shù)據(jù)庫(DRC)
http://www.mpimg-berlin-dahlem./~ag_ribo/ag_brimacombe/drc/



名稱
地址
說明

ENZYME
http://www./enzyme/


酶命名

EcoCyc
http:///ecocyc/


大腸桿菌(Escherichia coli)(K-12)基因組、基因產(chǎn)物和代謝通路

EpoDB
http://www.cbil./EpoDB/


人紅細(xì)胞生成過程中的基因表達(dá)

京都基因和基因組百科全書(KEGG)
http://www.genome./kegg/


代謝和調(diào)節(jié)通路

LIGAND
http://www.genome./dbget/ligand.html


酶的配體、底物和反應(yīng)

RegulonDB
http://kinich.cifn.:8850/db/regulondb_intro.frameset


大腸桿菌(Escherichia coli)轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)和操縱子結(jié)構(gòu)

UM-BBD
http://www.labmed./umbbd/


微生物生物催化反應(yīng)和生物降解通路

WIT2
http://wit.mcs./WIT2/


功能治療和代謝模型發(fā)育的集成系統(tǒng)




突變數(shù)據(jù)庫



名稱
地址
說明

ALFRED
http://alfred.med./alfred/index.asp


等位基因頻率和DNA多態(tài)性

雄激素受體基因的突變(ARGMD)

哮喘基因數(shù)據(jù)庫(AGD)
http://www./androgendb/


雄激素受體基因的突變

哮喘和變態(tài)反應(yīng)數(shù)據(jù)庫
http://cooke./asthmagen/main.cfm


哮喘和變態(tài)反應(yīng)中的連鎖和突變研究

腫瘤學(xué)和血液學(xué)中的遺傳學(xué)和細(xì)胞傳學(xué)信息庫
http://www./services/chromcancer/


癌癥(cancer)中染色體異常

BTKbase
http://www./laitokset/imt/bioinfo/BTKbase/


X-連鎖血丙種球蛋白缺乏中的突變

CASRDB
http://www.casrdb./


引起FHH,NSHPT和ADH的CASR突變

GRAP突變數(shù)據(jù)庫
http://tinygrap./GRAP/


G蛋白偶聯(lián)受體的突變(GRAP)

HGBASE
http://hgbase./


基因內(nèi)部序列多態(tài)性

HIV-RT
http://hivdb./hiv/


HIV反轉(zhuǎn)錄酶和蛋白酶序列變異

嗜血菌B突變數(shù)據(jù)庫
http://www./ip/petergreen/haemBdatabase.html
Factor IX基因中的點(diǎn)突變、短插入和短缺失

人類基因突變數(shù)據(jù)庫 (HGMD)
http://archive./uwcm/mg/hgmd0.html


已知發(fā)表的人類遺傳性疾病的基因損傷

人類PAX2等位基因變異數(shù)據(jù)庫
http://pax2.hgu./


人類PAX2基因突變

人類PAX6等位基因變異數(shù)據(jù)庫
http://pax6.hgu./


人類PAX6基因突變

人類I型和III型膠原基因突變數(shù)據(jù)庫
http://www./genetics/collagen/


人類I型和Ⅲ型膠原基因突變

HvrBase
http://www./


靈長類線粒體DNA控制區(qū)域序列

KMDB
http://www.knowledge./KMDB/


人類眼睛疾病基因的突變

KinMutBase
http://www./imt/bioinfo/KinMutBase/


致病的蛋白激酶突變

Mutation Spectra Database
http://info.med./mutbase/


病毒、細(xì)菌、酵母和哺乳類基因的突變

NCL Mutations
http://www./ncl/


神經(jīng)元蠟樣質(zhì)脂褐質(zhì)沉積癥基因突變和多態(tài)性

在線式人類孟德爾遺傳數(shù)據(jù)庫(OMIM)
http://www.ncbi.nlm./Omim/


人類遺傳學(xué)和基因組紊亂目錄

PAHdb
http://www.pahdb./


苯丙氨酸羥化酶基因突變

PHEXdb
http://data.mch./phexdb


導(dǎo)致X-連鎖低磷酸血癥的PHEX基因突變

PMD
http://www.phexdb.


蛋白質(zhì)突變數(shù)據(jù)集

PTCH1突變數(shù)據(jù)庫
http://www./PTCH/ptchbase.html


PTCHl中的突變和SNP

RB1基因突變數(shù)據(jù)庫
http://www./Rb/


人類視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤基因(RB1)的突變

dbSNP
http://www.ncbi.nlm./SNP/


單核苷酸多態(tài)性

iARC p53數(shù)據(jù)庫
http://www./p53/


文獻(xiàn)報(bào)告的人類p53基因錯義突變和小片段缺失

p53數(shù)據(jù)庫
http://metalab./dnam/mainpage.html


人類p53和hprt基因突變、嚙齒類轉(zhuǎn)基因lacI和lacZ突變






病理學(xué)



名稱
地址
說明

小鼠腫瘤生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(MT
http://tumor.informatics./


小鼠腫瘤名稱、分類、發(fā)病串、病理學(xué)、遺傳因素

口腔癌基因數(shù)據(jù)庫(OCGD)
http://www./Oral/oral.html


口腔癌相關(guān)基因的細(xì)胞、分子和生物學(xué)數(shù)據(jù)

PEDB
http://chroma_mbt.washington.edu/PEDB/


前列腺組織和細(xì)胞類型特異的cDNA文庫的序列

腫瘤基因家族數(shù)據(jù)庫(TGDBs)
http://www./tgdf.html


多種癌癥(cancer)相關(guān)基因的細(xì)胞、分子和生物學(xué)數(shù)據(jù)






蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫



名稱
地址
說明

AARSDB
http://rose.man./aars/index.html


氨酰tRNA合成酶序列

DatA
http://luggagefast./group/arabprotein/


擬南芥(Arabidopsis thaliana)中注釋了的編碼序列

ESTHER
http://www.ensam./cholinesterase/


酯酶和α/β水解酶及相關(guān)分子

內(nèi)源性GPCR列表
http://www./GPCR.html


細(xì)胞系中表達(dá)的G蛋白偶聯(lián)受體

GPCRDB
http://www./7tm/


G蛋白偶聯(lián)受體

HIV分子免疫學(xué)數(shù)據(jù)庫
http://hiv-web./immunology/


HIV的抗原決定簇

HUGE
http://www.kazusa./huge/


較大的(50kDa)人類蛋白質(zhì)和cDNA序列

組蛋白數(shù)據(jù)庫
http://genome.nhgri./histones/


組蛋白、組蛋白折疊序列和結(jié)構(gòu)

IMGT
http://imgt.:8104/


人類和其他脊椎動物(vertebrates)的免疫球蛋白、T細(xì)胞受體和MHC序列

IMGT/HLA
http://www./imgt/hla/


人類主要組織相容性復(fù)合體

InBase
http://www./neb/inteins.html


插入蛋白質(zhì)序列和基序(motif)

LGICdb
http://www./recherche/banques/LGIC/LGIC.html


配體門控離子通道(ion channel)亞基序列

MHCPEP
http://wehih./mhcpep/


MHC結(jié)合肽

MetaFam
http://metafam.ahc./


集成的蛋白質(zhì)家族信息

核受體資源
http://nrr./nrr/nrr.html


核受體超家族

PKR
http://pkr./


蛋白激酶序列、酶學(xué)、遺傳學(xué)、分子和結(jié)構(gòu)特性

PPMdb
http://sphinx.:8080/ppmdb/index.html


擬南芥(Arabidopsis thaliana)質(zhì)膜蛋白序列和表達(dá)數(shù)據(jù)

Peptaibol
http://www.cryst./peptaibol/welcome.html


抗生素(antibiotic)肽序列

PhosphoBase
http://www.cbs./databases/PhosphoBase/


蛋白質(zhì)磷酸化位點(diǎn)

PlantsP
http://plantsp./


植物蛋白激酶和蛋白磷酸化

Prolysis
http://delphi.phys./Prolysis/


蛋白酶、天然和合成的蛋白酶抑制劑(protease inhibitor)

蛋白質(zhì)信息資源(PIR)
http://pir./


綜合的、注釋的、非冗余的蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫

核糖核酸酶P數(shù)據(jù)庫
http://www.mbio./RNaseP/home.html


RNaseP序列、對齊和結(jié)構(gòu)

SWISS-PROT/TrEMBL
http://www./sprot


蛋白質(zhì)序列

TIGRFAMs
http://www./TIGRFAMs


功能明確蛋白質(zhì)家族的資源

TRANSFAC
http://transfac./TRANSFAC/index.html
轉(zhuǎn)錄因子和結(jié)合位點(diǎn)

OoTFD
http://www./


轉(zhuǎn)錄因子和基因表達(dá)

TrEST、trGEN和Hits
http://hits./


預(yù)測的蛋白質(zhì)序列






蛋白質(zhì)序列Motif



名稱
地址
說明

BLOCKS
http://blocks./
蛋白質(zhì)家族的序列保守區(qū)域

CluSTr
http://www./clustr/
將SWISS-PROT+TrEMBL蛋白自動歸類

InterPro
http://www./interpro/


蛋白質(zhì)家族、結(jié)構(gòu)域和位點(diǎn)的集成信息資源

PIR-ALN
http://www-nbrf./pirwww/dbinfo/piraln.html


蛋白質(zhì)序列聯(lián)配

PRINTS
http://www.bioinf./dbbrowser/PRINTS/


分層的基因家族指紋

PROSITE
http://www./prosite/


具有生物學(xué)意義的蛋白模式和輪廓

ProtoMap
http://protomap./


對SWISS-PROT蛋白質(zhì)進(jìn)行自動分類

SBASE
http://hydra.icgeb./~kristian/SBASE/


注釋了的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域序列

SMART
http://smart./


結(jié)構(gòu)域序列

SYSTERS
http://systers.molgen./


基于多種資源對蛋白質(zhì)序列進(jìn)行分類

Emotif
http://motif./emotif


蛋白質(zhì)序列模體查詢

Iproclass
http://pir./iproclass/


注釋了的蛋白質(zhì)分類數(shù)據(jù)庫






蛋白質(zhì)組資源



名稱
地址
說明

Aaindex
http://www.genome./dbget/


肽的物理化學(xué)屬性

Proteome Analysis Database
http://www./proteome/


應(yīng)用interpro和clustr在線式進(jìn)行全基因組中蛋白質(zhì)的功能分類

SWISS-2DPAGE
http://www./ch2d/


注釋了的2D-PAGE數(shù)據(jù)庫

釀酒酵母蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(YPD)
http://www./databases/index.html


釀酒酵母蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫






RNA序列



名稱
地址
說明

ARED


http://rc./


富含AU元件的mRNAs

Collection of mRNA-like Noncoding RNAs
http://biobases.ibch./ncRNA/


非編碼蛋白的RNA轉(zhuǎn)錄

歐洲人小亞基核糖體RNA數(shù)據(jù)庫
http://rrna./ssu/index.html


利用二級結(jié)構(gòu)信息對核糖體RNA小亞基序列進(jìn)行聯(lián)配

HyPaLib
http://bibiserv.techfak./HyPa/


RNA分類的結(jié)構(gòu)元件特征

Intronerator
http://www.cse./~kent/intronerator/


C.elegans的RNA剪接和基因結(jié)構(gòu);C.briggsae和C.elegans基因組聯(lián)配

RNA中非標(biāo)準(zhǔn)作用
http://prion.bchs./bp_type/


已知RNA結(jié)構(gòu)中非標(biāo)準(zhǔn)的堿基-堿基相互作用

RISSC
http://ulises./RISSC


核糖體16S-23S RNA基因間隔區(qū)域

RNA修飾數(shù)據(jù)庫
http://medlib.med./RNAmods/


RNA中天然修飾的核苷

核糖體數(shù)據(jù)庫項(xiàng)目(RDP)
http://rdp.cme./


rRNA序列,聯(lián)配和系統(tǒng)發(fā)生

SRPDB
http://psyche./dbs/SRPDB/SRPDB.html


信號識別顆粒RNA、蛋白質(zhì)和受體信息

小RNA數(shù)據(jù)庫
http://mbcr.bcm./smallRNA


原核生物和真核生物小RNA序列的直接測序數(shù)據(jù)

TmRNA網(wǎng)站
http://www./~tmrna


TmRNA序列、折疊和聯(lián)配

tRNA序列
http://www./departments/biochemie/trna/


tRNA和tRNA的基因序列

tmRDB
http://psyche./dbs/tmRDB/tmRDB.html


tmRNA(10SaRNA)序列







結(jié)構(gòu)



名稱
地址
說明

ASTRAL
http://astral./


已知結(jié)構(gòu)、選擇亞群和序列——相關(guān)的結(jié)構(gòu)域序列

BioMagResBank
http://www.bmrb./


蛋白質(zhì)、肽和核酸的核磁共振數(shù)據(jù)

CE
http://cl./ce.html


計(jì)算和觀察3維結(jié)構(gòu)對齊

CKAAPsDB
http://ckaaps./perl/browser.pl


序列不同而結(jié)構(gòu)相似的蛋白質(zhì)

CSD
http://www.ccdc./prods/csd/csd.html


有機(jī)物和金屬有機(jī)物復(fù)合體的晶體結(jié)構(gòu)信息

大分子運(yùn)動數(shù)據(jù)庫
http://bioinfo.mbb./MolMovDB/


蛋白質(zhì)和大分子運(yùn)動的描述

HIC-Up
http://alpha2.bmc./hicup/


小分子(異源復(fù)合物)的結(jié)構(gòu)

HSSP
http://www.sander./hssp/


結(jié)構(gòu)家族和對齊,結(jié)構(gòu)保守區(qū)域和結(jié)構(gòu)域骨架

IMB Jena生物大分子圖象庫
http://www./IMAGE.html


生物多聚物結(jié)構(gòu)的三維觀察和分析

ISSD
http://www.protein.bio./issd/


集成的序列和結(jié)構(gòu)信息

LPFC
http://www-smi./projects/helix/LPFC/


蛋白質(zhì)家族和新結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫

MMDB
http://www.ncbi.nlm./Structure/


所有經(jīng)實(shí)驗(yàn)確定了的三維結(jié)構(gòu)

NTDB
http://ntdb.chem./


核酸的熱力學(xué)數(shù)據(jù)

PDB


http://www./pdb/
通過X射線晶體衍射和NMR測定的結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)

PDBsum
http://www.biochem./bsm/pdbsum


PDB結(jié)構(gòu)的總結(jié)和分析

ProTherm
http://www.rtc.riken./jouhou/protherm/protherm.html


野生型和突變蛋白質(zhì)的熱力學(xué)數(shù)據(jù)

RESID
http://www-nbrf./pirwww/dbinfo/resid.html


蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)修飾

Sloop
http://www-cryst.bioc./~sloop/


蛋白質(zhì)loop區(qū)域分類






轉(zhuǎn)基因



名稱
地址
說明

Cre轉(zhuǎn)基因數(shù)據(jù)庫
http://www.mshri./nagy/cre.htm


轉(zhuǎn)基因小鼠(Transgenic Mice)系

轉(zhuǎn)基因動物(Transgenic animals)和打靶突變數(shù)據(jù)庫
http://tbase./


轉(zhuǎn)基因動物(Transgenic animals)和打靶突變的信息






其他生物醫(yī)學(xué)資源



名稱
地址
說明

Dbcat
http://www./services/dbcat/


數(shù)據(jù)庫分類

LocusLink/RefSeq
http://www.ncbi.nlm./LocusLink/


遺傳基因座的序列和描述信息

MPDB
http://www.biotech.ist./interlab/mpdb.html


被證明有用的合成的寡核苷酸如引物或探針的信息

分子探針數(shù)據(jù)庫
http://srs./


合成的寡核苷酸、探針和PCR引物的信息

NCBI分類瀏覽器
http://www.ncbi.nlm./Taxonomy/taxonomyhome.html

至少含有一條核苷酸或蛋白質(zhì)序列的遺傳數(shù)據(jù)庫中所涉及到的物種名稱列表

PubMed
http://www.ncbi.nlm./PubMed/

MEDLINE和Pre-MEDLINE文獻(xiàn)引用數(shù)據(jù)庫

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