(1)括約肌間型:是最常見的一種類型，約占肛瘺的70%，為肛周膿腫的后果。內口位于齒線附近，瘺管只穿過內括約肌，在內外括約肌之間行走，最后開口于肛門周圍皮膚，外口距肛緣較近，一般為3一5cm；

  (2)經括約肌型:也較常見，約占肛瘺的25%，為坐骨直腸窩膿腫的后果。瘺管穿過內括約肌，并在外括約肌的淺部和深部之間向肛門周圍皮膚上穿出。外口距肛緣稍遠，多在5cm左右。常有數個外口，并有支管互相溝通；

  (3)括約肌上型:為高位肛瘺，較少見，約占肛瘺近5%。瘺管穿破內括約肌后，向上蔓延，到達外括約肌上方，最后穿破肛提肌，在肛門周圍遠處皮膚上穿出。由于瘺管常累及肛管直腸環(huán)，故治療難度大，需分期手術；

  (4)括約肌外型:很少見，占肛瘺近1%。內口不在齒線附近，而在齒線上方的直腸壁，瘺管在內外括約肌外方經肛提肌而下，開口于肛門周圍遠處皮膚上。