“個(gè)人基因測(cè)序服務(wù)又添新產(chǎn)品:想知道您能否長(zhǎng)命百歲?只需要刮取少量口腔上皮細(xì)胞,我們將為您解讀命運(yùn)的天書!” 面對(duì)這樣的廣告,你是急不可待,躍躍欲試?還是絞著手帕,萬(wàn)般糾結(jié)?若屬后者,令人心安的是這樣的產(chǎn)品遠(yuǎn)未上市;而對(duì)于前者,則有捷報(bào)傳來(lái)——科學(xué)家們向此目標(biāo)大大邁進(jìn)了一步。 波士頓大學(xué)生物統(tǒng)計(jì)系的保拉·薩巴斯蒂亞尼(Paola Sebastiani)與醫(yī)學(xué)院的托馬斯·波爾斯(ThomasPerls)所領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)在《科學(xué)》雜志上發(fā)表論文,聲稱通過分析150個(gè)遺傳基因的記號(hào),可以預(yù)測(cè)個(gè)人活過百歲的概率?!邦A(yù)測(cè)模型的正確率達(dá)到77%?!边@是否意味著已經(jīng)炙手可熱的個(gè)人基因測(cè)序業(yè)務(wù)將很快提供該項(xiàng)服務(wù)?波爾斯澄清:“作為文章作者,我們并不認(rèn)為時(shí)機(jī)已經(jīng)成熟?!贝送?,除了預(yù)測(cè),我們還能做些什么?這項(xiàng)研究是否意味著科學(xué)家們成功定位一百五十個(gè)“長(zhǎng)壽基因”,進(jìn)而很快就能弄清了長(zhǎng)壽的生物機(jī)制,甚至可以利用醫(yī)藥或者基因工程的方式來(lái)促使人人長(zhǎng)壽?薩巴斯蒂亞尼卻冷靜地告訴記者:“此刻所做的一切只是統(tǒng)計(jì)分析而已,若想要了解其中的生物機(jī)制,以及這些基因記號(hào)究竟為(人類長(zhǎng)壽)做出了多大貢獻(xiàn),還有許多工作要做。所以,這只是第一步?!蹦敲矗覀兙烤箲?yīng)該怎樣解讀這項(xiàng)科研的意義?且從這150個(gè)遺傳基因的記號(hào)從頭說起。 百里挑一的差異 我們絕大部分的遺傳密碼,記載在細(xì)胞核內(nèi)二十三對(duì)長(zhǎng)鏈般的DNA上,而每條長(zhǎng)鏈由四種核苷酸分子組成。你可以將核苷酸看做四色的珠子,千萬(wàn)顆乃至上億顆這樣的珠子串在一起,它們的顏色和順序,記載了我們從雙親那里繼承而來(lái)的遺傳信息。如果從北京街頭隨便抓來(lái)兩個(gè)毫無(wú)親緣關(guān)系的陌生人,他們體內(nèi)每條長(zhǎng)鏈99.5%以上的部分都是完全一致的。也就是說,這倆人之間,平均每上百顆珠子里,只有一顆的顏色不同。 如果在在一小段DNA里,只有一顆珠子在人群中有不同顏色(通常只有兩種顏色),這顆珠子所在的位置,就被稱作“單核苷酸多態(tài)性”(singlenucleotide polymorphism, 縮寫SNP,讀音snip)位點(diǎn)??v觀人類基因組,平均每一百到三百個(gè)核苷酸里會(huì)出現(xiàn)一個(gè)SNP位點(diǎn),而我們個(gè)體基因組中90%的花樣,都以SNP的形態(tài)存在??梢哉f,每人都有一套顏色特異的SNP珠子,它們雖然相對(duì)數(shù)量不大,卻使得我們遺傳密碼個(gè)性鮮明,并為個(gè)體差異起到可觀的決定作用。 既然SNP如此關(guān)鍵,近年來(lái),運(yùn)用一種叫做全基因組關(guān)聯(lián)(genomewide association, 縮寫GWA,讀音giwa)分析的特殊研究手段,從眾多SNP位點(diǎn)中找到與特定健康狀況“有關(guān)”的那些,成為遺傳界炙手可熱的領(lǐng)域。簡(jiǎn)而言之,這樣的研究通常找來(lái)兩組人群,一組有特定健康狀況——譬如患有某種疾病,而另一組沒有??茖W(xué)家們通過分子生物學(xué)的手段,確定每個(gè)被試個(gè)體體內(nèi)一組SNP珠子的顏色是紅是綠,再通過統(tǒng)計(jì)方法,計(jì)算紅色(或綠色)珠子是否特別容易出現(xiàn)在患有疾病的被試體內(nèi),如果答案衛(wèi)士,該SNP就被判為與這種疾病“相關(guān)”。 預(yù)示長(zhǎng)壽的密文 過去五年里,利用GWA,科學(xué)家們已經(jīng)先后發(fā)現(xiàn)成百上千個(gè)SNP,分別與四十多種疾病相關(guān)——其中包括心血管疾病、糖尿病、自閉癥、癌癥等常見疾病。而本文開頭所提到的研究者,則找來(lái)兩組已過世的老人的血樣:一組特別高壽,終年在95歲到119歲;而另一組則與廣大群眾差別不大,終年在53歲到90歲之間。研究者先從二十六萬(wàn)個(gè)SNP中,找出數(shù)十個(gè)各自與長(zhǎng)壽相關(guān)的單個(gè)SNP位點(diǎn);又建立統(tǒng)計(jì)模型,找到一套“具有預(yù)測(cè)性的”SNP,共有150個(gè)。通過確定每一個(gè)被試體內(nèi)這套SNP的顏色,他們可以計(jì)算出該個(gè)體活過百歲的概率——如果超過一半,就被定義為“很可能高壽”。由于被試的壽命都已知,把計(jì)算機(jī)算出來(lái)的結(jié)果和實(shí)際情況一比較,發(fā)現(xiàn)77%的百歲老人都確實(shí)被模型預(yù)測(cè)為高壽者,這,就是“準(zhǔn)確性達(dá)到77%”的來(lái)源。 那這是否意味著,如果有人對(duì)你體內(nèi)這150個(gè)SNP進(jìn)行測(cè)定,就能以77%的準(zhǔn)確度預(yù)測(cè)你能否活到百歲呢?顯然并不是這么簡(jiǎn)單。首先,GWA手段很容易受到被試的特定遺傳背景(譬如所屬人種)的影響,利用GWA手段所得到的類似研究結(jié)果,都需要在不同人群中得到多次重復(fù)確認(rèn),才能被學(xué)界認(rèn)可。而預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性,也很容易受到影響。事實(shí)上,波爾斯他們也在研究中重復(fù)過兩次,每次的準(zhǔn)確性都不相同。 其次,“統(tǒng)計(jì)是最大的謊言”雖然是一句行內(nèi)人的笑話,但也說明對(duì)統(tǒng)計(jì)結(jié)果的解釋,需要格外謹(jǐn)慎:用任何統(tǒng)計(jì)方法計(jì)算出來(lái)的、代表概率或準(zhǔn)確性的結(jié)果,嚴(yán)格來(lái)說,都只在統(tǒng)計(jì)學(xué)本身的范疇里有意義。在科學(xué)家們做出進(jìn)一步的功能性實(shí)驗(yàn)和分析之前,這些結(jié)果并沒有顯著的生物學(xué)意義。事實(shí)上,GWA所找到的大多數(shù)SNP,都很可能與長(zhǎng)壽毫無(wú)關(guān)系,只是因?yàn)檎`差、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的特點(diǎn),或者這些SNP正巧和導(dǎo)致長(zhǎng)壽的基因做了近鄰,才被找了出來(lái)。另外,這150個(gè)SNP遠(yuǎn)未涵蓋所有與長(zhǎng)壽相關(guān)的遺傳密碼——在異常高壽的老人中,有三十位被模型判斷為“活到百歲希望渺?!?,而他們之中不少人卻有著悠久的長(zhǎng)壽家族史,這就暗示著還有其他促進(jìn)長(zhǎng)壽的遺傳因素并未被發(fā)現(xiàn)。 最后,科學(xué)家們最擔(dān)心的,則是如果這項(xiàng)研究被直接用于個(gè)人基因測(cè)序,會(huì)對(duì)每個(gè)接受測(cè)序的顧客產(chǎn)生什么樣的心理暗示——如果你知道自己基因優(yōu)良,會(huì)不會(huì)縱容自己抽煙酗酒?又或者如果你發(fā)現(xiàn)自己活過百歲的可能性不大,會(huì)不會(huì)自暴自棄,變成一只沙發(fā)土豆?事實(shí)上,雖然遺傳密碼對(duì)我們的健康起到至關(guān)重要的作用,但外界環(huán)境的影響卻絕對(duì)不容忽視——在很多情況下,環(huán)境的作用甚至遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于基因。過于強(qiáng)調(diào)基因的作用,而忽略健康生活習(xí)慣的重要性,對(duì)于任何人,都將是一場(chǎng)災(zāi)難。有研究表明,基因?qū)ξ覀兪欠衲芑畹?5歲,只起到20-30%的作用。而就在這項(xiàng)研究之中,有15%的未活到百歲的被試卻被計(jì)算機(jī)定位為“高壽者”。換言之,他們很可能繼承了優(yōu)秀的長(zhǎng)壽密碼,卻因?yàn)槠渌蛩囟鵁o(wú)緣高壽。 剛剛起步的探索 對(duì)于生物醫(yī)學(xué)研究者,統(tǒng)計(jì)概率固然重要,但最關(guān)鍵的,恐怕是怎樣利用這些統(tǒng)計(jì)結(jié)果,來(lái)摸清生命現(xiàn)象之下的生理基礎(chǔ),并進(jìn)一步探索能為人類健康服務(wù)的道路。這些年來(lái),GWA研究之所以風(fēng)起云涌,則在于科學(xué)家們認(rèn)為,它能有效地為進(jìn)一步的研究指明方向,提供槍靶。在GWA之前,為了找到疾病的遺傳根源,遺傳學(xué)家往往需要做大量的家族連鎖分析。這樣的工作,相當(dāng)費(fèi)時(shí)費(fèi)力,并需要研究者提出預(yù)設(shè)猜想——猜測(cè)致病基因在DNA上的大致位置。而且,大多數(shù)常見疾病的罪魁禍?zhǔn)锥伎蓺w結(jié)于多個(gè)基因的共同作用,可傳統(tǒng)的遺傳連鎖分析卻對(duì)多基因分析效果不佳。而GWA相對(duì)簡(jiǎn)便快捷,不需要任何關(guān)于基因位置的預(yù)設(shè),可以同時(shí)分析數(shù)以十萬(wàn)計(jì)的遺傳基因位點(diǎn),一舉找出多個(gè)與疾病有統(tǒng)計(jì)相關(guān)性的基因密碼,自然備受研究者的青睞。 GWA找到的與健康狀況相關(guān)的SNP位點(diǎn)中,有兩種對(duì)生物醫(yī)學(xué)研究意義重大:一種能直接影響基因功能的SNP位點(diǎn)。這些位點(diǎn)是紅是綠,往往可以決定該基因所制造出來(lái)的蛋白質(zhì)的序列、功能,直接影響生理。2005年,科學(xué)家們?cè)?jīng)利用GWA一舉發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致老年性黃斑變性(age-relatedmacular degeneration,一種在老人中極為常見的致盲因素)的基因“補(bǔ)體因子H”(ComplementFactor H)。這個(gè)基因與炎癥相關(guān),似乎和視力風(fēng)馬牛不相及,若非GWA研究,恐怕很少有人會(huì)想到它是重要嫌犯之一。另一種SNP位點(diǎn),本身并不影響到任何基因的功能,可是卻因?yàn)榕c嫌犯在DNA上位置接近,被GWA發(fā)現(xiàn)??茖W(xué)家們于是可以順藤摸瓜,通過這些地圖標(biāo)識(shí)般的SNP,找到真正的罪魁禍?zhǔn)???峙麓蠖鄶?shù)的GWA研究所能找到的SNP,還是屬于這后一種情況。 薩巴斯蒂亞尼和波爾斯的研究中所找到的與長(zhǎng)壽相關(guān)的SNP,有一些似乎確實(shí)在衰老機(jī)制中有著一席之地。這些SNP曾在過去的遺傳相關(guān)性研究中被發(fā)現(xiàn),與老年癡呆、肌肉萎縮、骨骼代謝、免疫應(yīng)激等方面相關(guān)。今后,它們將會(huì)作為備選基因,供研究衰老的科學(xué)家細(xì)細(xì)省視。另外,當(dāng)這篇文章的作者們分析那些兩千多個(gè)已知的、與老年疾病相關(guān)的SNP位點(diǎn)時(shí),他們驚訝地發(fā)現(xiàn),這些SNP的分布,在長(zhǎng)壽組與對(duì)照組之間,并沒有任何區(qū)別。這可能預(yù)示著,長(zhǎng)壽的秘訣不在于免于繼承那些致病基因,而在于擁有一批“健康基因”,能延緩老年疾病的發(fā)作——事實(shí)上,大多數(shù)百歲老人,在他們九十來(lái)歲時(shí),還相當(dāng)健康,少有病痛。 不過,這樣研究結(jié)果的復(fù)雜性意味著:想通過一兩個(gè)基因來(lái)全面解釋為何有人能特別長(zhǎng)壽?這樣的努力不太可能“結(jié)出碩果”,英國(guó)紐卡斯特大學(xué)衰老與健康研究中心的主任托馬斯·柯克伍德(ThomasKirkwood)說,“我們不是在尋找那幾個(gè)設(shè)定生命時(shí)鐘的基因。事實(shí)的真相,當(dāng)它被揭露時(shí),將會(huì)異常繁雜?!?/p> 參考文獻(xiàn): 原文: Sebastianiet al., Genetic Signatures of Exceptional Longevity in Humans,Science DOI: 10.1126/science.1190532,http://www./cgi/content/abstract/science.1190532v1 其他參考論文: Cordell HJ, Clayton DG. Geneticassociation studies. 2005 Lancet366:1121-31. Dawn Teare M, Barrett JH. Geneticlinkage studies. 2005 Lancet 366:1036-1044 Klein RJ et al., Complement Factor HPolymorphism in Age-Related Macular Degeneration 2005 Science 308:385-389 Pearson TA How to Interpret aGenome-wide Association Study. 2008 JAMA 299:1335-1344 Psychiatric GWAS ConsortiumCoordinating Committee, Cichon S et al., Genomewide association studies:history, rationale, and prospects for psychiatric disorders. 2009 Am JPsychiatry. 166:540-556 |
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來(lái)自: 皖林專欄 > 《常識(shí)果殼網(wǎng)》