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DNA計算機(jī)

 yiyidaodao 2013-03-24

DNA計算機(jī)

DNA計算機(jī)DNA計算機(jī)

DNA計算機(jī)是一種生物形式的計算機(jī)。1994年,DNA計算機(jī)于南加利福尼亞大學(xué)萊昂那多·阿德萊曼(Leonard Adleman)教授的試管中問世。利用脫氧核糖核酸建立完整的信息技術(shù)形式,以編碼的DNA序列(通常意義上計算機(jī)內(nèi)存)為運算對象,通過分子生物學(xué)的運算操作以解決復(fù)雜的數(shù)學(xué)難題。

編輯摘要

生物邏輯門研制有新進(jìn)展,DNA計算機(jī)大規(guī)模使用指日可待:最近,英國科學(xué)家利用大腸桿菌,成功研制出生物邏輯門。這項進(jìn)展使得科學(xué)家朝著打造DNA計算機(jī)的夢想又向前邁進(jìn)了一步。專家預(yù)計,一旦DNA計算機(jī)發(fā)展成熟,將會給制藥業(yè)和生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域帶來革命性的改變。DNA計算機(jī)是一種生物形式的計算機(jī),“輸入”的是細(xì)胞質(zhì)中的RNA、蛋白質(zhì)以及其他化學(xué)物質(zhì),“輸出”的則是很容易辨別的分子信號。更新時間:2013-03-21 14:47:07

精彩點評

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上海科技:MIT的科學(xué)家們近日開發(fā)出一套能進(jìn)行邏輯操作的可存儲基因模塊,使其能在活細(xì)胞中執(zhí)行命令,就像計算機(jī)中所用的布爾邏輯門。讓DNA本身成為計算機(jī)的一部分,利用這些“基因線路”能追查一個細(xì)胞在何時到達(dá)其生命關(guān)鍵時刻,撥動基因開關(guān)改變細(xì)胞命運。

目錄

隱藏 ]
1 概念和特點
2 優(yōu)點
3 基本原理
4 研究進(jìn)展
5 應(yīng)用前景

DNA計算機(jī) - 概念和特點

DNA計算機(jī)DNA計算機(jī)
概括地講,DNA計算機(jī)是一種生物形式的計算機(jī)。它是利用DNA (脫氧核糖核酸)建立的一種完整的信息技術(shù) 形式,以編碼的DNA序列(通常意義上計算機(jī)內(nèi)存 )為運算對象,通過分子生物學(xué) 的運算操作以解決復(fù)雜的數(shù)學(xué)難題。由于起初的DNA計算要將DNA溶于試管 中實現(xiàn),這種計算機(jī)由一堆裝著有機(jī)液體的試管組成,因此有人稱之為“試管電腦”。

DNA計算機(jī)“輸入”的是細(xì)胞質(zhì)中的RNA、蛋白質(zhì)以及其他化學(xué)物質(zhì),“輸出”的則是很容易辨別的分子信號。在生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用上,DNA計算機(jī)能夠探測和監(jiān)控基因突變等細(xì)胞內(nèi)一切活動的特征信息,確定癌細(xì)胞等病變細(xì)胞以及自動激發(fā)微小劑量的治療行 。

DNA計算機(jī) - 優(yōu)點

1、體積小。其體積之小,可同時容納1萬億個此類計算機(jī)于一支試管中。
2)存貯量大。1立方米的DNA溶液,可以存貯1萬億億的二進(jìn)制數(shù)據(jù) 。1立方厘米空間的DNA可儲存的資料量超過1兆片CD容量。
3)運算快。其運算速度可以達(dá)到每秒10億次,十幾個小時的DNA計算,相當(dāng)于所有電腦問世以來的總運算量。
4)耗能低。DNA計算機(jī)的能耗非常低,僅相當(dāng)于普通電腦的10億分之一。如果放置在活體細(xì)胞內(nèi),能耗還會更低。
5)并行性。普通電腦采用的都是以順序執(zhí)行指令的方式運算,由于DNA獨特的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),數(shù)以億計的DNA計算機(jī)可以同時從不同角度處理一個問題,工作一次可以進(jìn)行10億次運算,即并行的方式工作,大大提高了效率。
此外,DNA計算機(jī)能夠使科學(xué)觀察與化學(xué)反應(yīng)同步,節(jié)省大筆的科研經(jīng)費。

DNA計算機(jī) - 基本原理

DNA計算機(jī)DNA
DNA分子是一條雙螺旋的長鏈,上面有四種堿基,分別為:腺嘌呤(A)、鳥嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)。DNA分子通過這些核甘酸的不同排列,能夠表達(dá)出生物體各種細(xì)胞擁有的大量信息。數(shù)學(xué)家、生物學(xué)家、化學(xué)家以及計算機(jī)專家從中得到啟迪。他們利用DNA能夠編碼信息的特點,先合成具有特定序列的DNA分子,使它們代表要求解的問題,然后通過生物酶的作用(相當(dāng)于加減乘除運算),使他們相互反應(yīng),形成各種組合,最后過濾掉非正確的組合而得到的編碼分子序列就是正確答案。

從最早的帕斯卡爾齒輪機(jī) 到今天最先進(jìn)的電子計算機(jī),其計算方式都是一種物理性質(zhì)的符號變換,具體是由“加”和“減”這種基本動作構(gòu)成的。然而,目前的DNA計算則有了本質(zhì)性的變化。計算不再是一種物理性質(zhì)的符號變換,而是一種化學(xué)性質(zhì)的符號變換,即不再是物理性質(zhì)的“加”、“減”操作而是化學(xué)性質(zhì)的切割和粘貼、插入和刪除。這種計算方式的變革是前所未有的,具有劃時代的意義[1] 。 


DNA計算機(jī) - 研究進(jìn)展

DNA計算機(jī)DNA計算機(jī)
2011年10月,英國,用細(xì)菌研制出生物邏輯門 

這是有史以來最先進(jìn)的“生物電路”。 這種生物邏輯門是模塊化的,它們可以被安裝在一起,從而為未來建立更復(fù)雜的生物處理器鋪平了道路。

2011年9月,美國,用生物計算機(jī)摧毀癌細(xì)胞
這種生物計算機(jī)能夠進(jìn)入人類細(xì)胞,通過對5種腫瘤特異性分子進(jìn)行邏輯組合分析識別出特異癌細(xì)胞,從而觸發(fā)癌細(xì)胞的毀滅過程。這一成果為開發(fā)出特異的抗癌治療奠定基礎(chǔ)。

2011年7月,以色列,用生物計算機(jī)探測多種不同類型分子
這種生物計算機(jī)能同時自動探測多種不同類型的分子,可用于診斷疾病、控制藥物釋放,實現(xiàn)診斷治療一體化。

2009年,美國,用大腸桿菌研制成細(xì)菌計算機(jī)
這種細(xì)菌計算機(jī)可解決復(fù)雜數(shù)學(xué)問題,且速度遠(yuǎn)快于任何以硅基礎(chǔ)的計算機(jī)。

2007年,美國,用DNA計算機(jī)實現(xiàn)RNA干擾機(jī)制
這種DNA計算機(jī)可進(jìn)行基本邏輯工作,能夠應(yīng)用于人工培養(yǎng)的腎細(xì)胞??茖W(xué)家將源于其他物種的單siRNA分子導(dǎo)入細(xì)胞,該DNA計算機(jī)能使編譯某種熒光蛋白 的目標(biāo)基因關(guān)閉。

2006年,美國,用DNA計算機(jī)快速準(zhǔn)確診斷禽流感病毒
這種DNA計算機(jī)能夠更快、更準(zhǔn)確地檢測西尼羅河病毒 和禽流感 病毒,以及其他疾病。

2005年,以色列,用DNA計算機(jī)運行10億種由DNA軟件分子設(shè)計的程序
這種DNA計算機(jī)采用了新的溶液處理工藝等技術(shù),能夠運行10億種用DNA軟件分子設(shè)計的程序,有潛力覺察到細(xì)胞中與多種癌癥有關(guān)的異常信使RNA,為癌癥診斷提供信息。

2004年,中國,第一臺DNA計算機(jī)在上海交大問世
這種DNA計算機(jī)是在以色列魏茨曼研究所的DNA計算機(jī)的基礎(chǔ)上進(jìn)行改進(jìn)后完成,其中包括用雙色熒光標(biāo)記對輸入與輸出分子進(jìn)行同時檢測,用測序儀對自動運行過程進(jìn)行實時監(jiān)測,用磁珠表面反應(yīng)法固化反應(yīng)提高可控性操作技術(shù)等,可在一定程度上完成模擬電子計算機(jī)處理0,1信號的功能。

2003年,美國,世界首臺可玩游戲的互動式DNA計算機(jī)問世
這種DNA計算機(jī)主要以生化酶為計算基礎(chǔ)來運算簡單游戲。

2000年,以色列,世界上第一臺DNA計算機(jī)問世
這是世界上第一臺成型的DNA計算機(jī),可以解決一些相對復(fù)雜的運算問題。在當(dāng)時它沒有什么實際用途,但它代表著DNA計算機(jī)已經(jīng)邁出科幻時代,并成為現(xiàn)實中一種初露端倪的技術(shù)。

1994年,美國,DNA計算機(jī)概念首次提出
科學(xué)家用一支裝有特殊DNA的試管,解決了著名的“推銷員問題”:有n個城市,一個推銷員要從其中某一個城市出發(fā),唯一走遍所有城市,再回到他出發(fā)的城市,求最短的路線。這個問題在當(dāng)時即使用最快的半導(dǎo)體來推算,也需要至少兩年以上的時間,但是科學(xué)家用DNA計算只花了7天時間,令人嘆為觀止,從而開辟了DNA計算機(jī)研究的新紀(jì)元[2][3] 。

DNA計算機(jī) - 應(yīng)用前景

未來的DNA計算機(jī)在研究邏輯、破譯密碼、基因編程 、疑難病癥防治以及航空航天等領(lǐng)域應(yīng)用的獨特優(yōu)勢, 現(xiàn)在電子計算機(jī)是望塵莫及,應(yīng)用前景十分樂觀。比如,DNA計算機(jī)的出現(xiàn),使在人體內(nèi)、在細(xì)胞內(nèi)運行的計算機(jī)研制成為可能,它能夠充當(dāng)監(jiān)控裝置,發(fā)現(xiàn)潛在的致病變化,還可以在人體內(nèi)合成所需的藥物,治療癌癥 、心臟病 、動脈硬化 等各種疑難病癥,甚至在恢復(fù)盲人 視覺方面,也將大顯身手。 

完全可以想象,一旦DNA計算技術(shù)全面成熟,那么真正的“人機(jī)合一”就會實現(xiàn)。因為大腦本身就是一臺自然的DNA計算機(jī),只要有一個接口,DNA計算機(jī)通過接口可以直接接受人腦的指揮,成為人腦的外延或擴(kuò)充部分,而且它以從人體細(xì)胞 吸收營養(yǎng)的方式來補充能量,不用外界的能量供應(yīng)。像科幻小說中向大腦植入以DNA為基礎(chǔ)的人造智能芯片,未來就像現(xiàn)象接種疫苗 一樣簡單。無疑,DNA計算機(jī)的出現(xiàn)將給人類文明帶來一個質(zhì)的飛躍,給整個世界帶來巨大的變化,有著無限美好的應(yīng)用前景。 

不過,由于受目前生物技術(shù)水平的限制,DNA計算過程中,前期DNA分子鏈 的創(chuàng)造和后期DNA分子鏈的挑選,要耗費相當(dāng)?shù)墓ぷ髁?。比如?a class="link_red" title="阿德勒曼" target="" style="color: rgb(222, 0, 0); text-decoration: none; ">阿德勒曼 的“試管電腦 ”在幾秒鐘內(nèi)就得出結(jié)果,但是他卻花掉數(shù)周的時間去挑選正確的結(jié)果。還有,如果實驗中城市數(shù)目增加到200個,那么計算所需的DNA重量將會超過地球的重量。而且數(shù)以億計的DNA分子非常復(fù)雜,在反應(yīng)過程中很容易發(fā)生變質(zhì)和損傷,甚至試管壁吸附殘留都可能發(fā)生致命錯誤。因此,DNA計算機(jī)真正進(jìn)入現(xiàn)實生活尚需時日。[3] 

附圖

 

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參考資料:
[1] ^  引用日期:2013-03-21
[2] ^  引用日期:2013-03-21
[3] ^  引用日期:2013-03-21

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