1、Q:要做胃粘膜組織的DNA含量及倍體檢查,但取材后要等幾個星期才會做流式細(xì)胞術(shù)檢查,請問:胃組織要怎樣保存好呢?用低溫保存,還是用乙醇固定?或者固定后再低溫下保存?
A:我做過乳腺細(xì)胞的DNA含量測定,取得組織以后,先處理成單細(xì)胞懸液,然后再加70%冰乙醇固定,要保證冰乙醇的最終濃度為50%,這樣固定的細(xì)胞懸液可以至少保存12小時,最多可保存一個月,上機檢測前再加PI綜合染液。我就是這樣做的,保存了將近三個星期,結(jié)果還可以,變異系數(shù)為5%.
2、實驗中想用PI分析細(xì)胞周期及凋亡率,請教幾個問題:
Q:(1)所用的RNAs酶用什么配制呢?用PBS配嗎?
A:RNaseA用PBS配制沒有問題,但是注意要沸水浴去除DNase的活性。
Q:(2)測細(xì)胞周期和凋亡率時都要用RNAs酶,可以一起檢測嗎?
A:用流式細(xì)胞儀測定時細(xì)胞周期和凋亡率是同時測定的,不用擔(dān)心。
Q:(3)Triton-x-100是固定劑吧,用了70%的冷乙醇(是4℃嗎?),是不是就不用Triton-x-100固定了?
A:Triton X-100是起透化作用的,不是固定劑,可以用75%的乙醇于-20度固定。
Q:(4)還要設(shè)什么內(nèi)參標(biāo)準(zhǔn)(5%雞紅細(xì)胞)嗎?
A:對照肯定是需要的,這個根據(jù)自己的需要進(jìn)行設(shè)置。
Q:(5)不用試劑盒行不行???
A:完全可以不用試劑盒。
以下提供一個自己的實驗步驟供參考:
(1)200×g離心10min收集細(xì)胞;
(2)棄去上清,PBS漂洗一次,將細(xì)胞重懸于預(yù)冷的80%乙醇中,-20°C固定24h以上;
(3)進(jìn)行流式細(xì)胞儀檢測前,200×g離心10min收集固定后的細(xì)胞;
(4)PBS洗滌一次,200×g離心10min收集細(xì)胞;
(5)將細(xì)胞重懸于含100ug/ml RNase A和50ug/ml PI的PBS中,室溫孵育30min;
(6)將經(jīng)PI染色和RNase A消化后的細(xì)胞懸液用300目的尼龍膜過濾后即可利用流式細(xì)胞儀進(jìn)行細(xì)胞周期分布和凋亡細(xì)胞定量的分析。
3、Q:流式檢測細(xì)胞周期時加RNA酶所需的溫度?
A:其實有關(guān)RNA酶在凋亡檢測制樣過程中使用的必要性問題尚有人持不同意見,該觀點的人認(rèn)為RNA酶在環(huán)境中無所不在,常規(guī)制樣過程中所接觸的試劑和環(huán)境中的RNA酶已足以降解樣品中的RNA,所以為了簡便實驗操作,也有人不加RNA酶或如你所參考的方法將其與PI染液一起使用。不過經(jīng)典的方法還是“先加RNA酶37度孵育30min,然后加PI 4度孵育30min”。
至于染色時使用4度,是因為低溫可減弱分子運動,增強熒光染料結(jié)合的穩(wěn)定性和減少可能的熒光損耗。上流式前細(xì)胞用75%乙醇固定行嗎?
4、Q:我養(yǎng)腫瘤細(xì)胞,測周期??吹教诱f70%乙醇必須用PBS和乙醇配,用水配細(xì)胞會碎裂,有帖子說PBS和乙醇配會出現(xiàn)絮狀物。上流式前細(xì)胞用75%乙醇固定,就用買來的現(xiàn)成的瓶裝75%乙醇,行嗎?必須那么嚴(yán)格嗎?
A:先用冷PBS懸浮細(xì)胞,大約1-2ml,充分懸浮,使細(xì)胞充分分散成單細(xì)胞。之后緩慢加入無水乙醇,終濃度為70-75%乙醇。不直接加75%乙醇的原因是:直接加入乙醇會導(dǎo)致細(xì)胞團(tuán)聚的現(xiàn)象,很難重懸成單細(xì)胞。乙醇固定之后沒有細(xì)胞沉淀。
5、Q:我要做流式分析細(xì)胞周期,我大概收集了10的6次方細(xì)胞,但細(xì)胞在乙醇固定之后,還看到有細(xì)胞沉淀的,但PBS洗滌兩次之后,就基本沒什么細(xì)胞沉淀了,上機發(fā)現(xiàn)就發(fā)現(xiàn)不了細(xì)胞了。這是怎么回事啊?怎么解決這個問題啊?
A:很可能是洗細(xì)胞的過程中丟失了,解決辦法有:
(1)盡量采用尖底的離心管和水平離心機
(2)離心后盡量用吸管吸取上清,不要傾倒;吸上清時最好殘留1mm左右的水膜,不要吸完。
(3)離心的轉(zhuǎn)速或時間可稍微增加一點兒
(4)每次加抗體時,吸頭最好不要接觸液面;混勻時最好不要用吸頭吹打,以免吸頭掛壁帶走部分細(xì)胞。
6、Q:流式細(xì)胞PI單染中為什么用RNAse?
A:在測細(xì)胞周期時,因為已經(jīng)在細(xì)胞膜打孔了,PI很容易透過細(xì)胞膜和DNA結(jié)合,但RNA也是核酸,也會被染色,為避免干擾染色前需用RNAse降解RNA。這樣PI只染DNA,能精確以熒光強度反映DNA的含量。
7、最近做了幾次流式細(xì)胞儀檢測細(xì)胞周期,發(fā)現(xiàn)有幾個問題:
Q:(1)我所用的是腫瘤細(xì)胞, 但是同樣的細(xì)胞類型,同樣的處理因素,雖然兩次獨立實驗作出來的結(jié)果總體趨勢都是在某種藥物干預(yù)后,S期比例下降,但兩次結(jié)果S期比列具體數(shù)值相差很大,同樣,G2/M期在干預(yù)前后無變化,但兩次獨立實驗數(shù)值卻相差很大,那么可以說,做流式是每次細(xì)胞狀態(tài)不一樣,結(jié)果也會相差很大,是不是細(xì)胞密度會對結(jié)果產(chǎn)生很大影響,那么如果細(xì)胞密度在60-70%時和細(xì)胞已經(jīng)長滿(90%以上)也會導(dǎo)致各期數(shù)值的差異?如果是這樣,長滿的細(xì)胞(不再增殖)是表現(xiàn)的G1或S或G2/M上升還是下降?
A:應(yīng)該是兩批細(xì)胞在實驗時本身所出周期不同所致,可以在實驗前進(jìn)行細(xì)胞的同步化處理,減少批間差異。實驗細(xì)胞應(yīng)處于對數(shù)生長期,而不能是完全長滿,一般在50~80%比較好。自然狀態(tài)下,不增殖的細(xì)胞應(yīng)該處于G0/G1期。
Q:(2)其次就是結(jié)果分析,細(xì)胞周期特異性藥物如抗代謝藥作用后主要表現(xiàn)的是S期比例下降,細(xì)胞被阻滯在G1期,自然G1期比列升高。而有些植物藥如長春堿類或紫杉醇類,主要作用于M期,那么結(jié)果是否表現(xiàn)為G2期比例升高,還是S期也相應(yīng)升高?還有就是細(xì)胞經(jīng)抗腫瘤藥物作用后反而出現(xiàn)的S期升高,可能是那些原因,如何分析?
A:周期特異性藥物阻滯哪一期,哪一期就升高,不會使其它階段細(xì)胞增多。
8、Q:我用流式做胃癌細(xì)胞周期分析時不出現(xiàn)S、G2/M峰?什么原因呢?自己分析可能為PI沒染上色,是不是染色時間太短呢?
A:你用了多少PI染色多久呢?一般來說30分鐘夠了.我覺得可能是打孔或者rna沒有處理掉沒有成功,染色時間并不是關(guān)鍵。
9、Q:做流式細(xì)胞時,PI 染色,PI的濃度應(yīng)該是多少?還有就是400目的篩網(wǎng)是什么?不用可以嗎?謝謝。
A:100ug/ml,一般用400目的篩網(wǎng)是用來將粘在一起的細(xì)胞團(tuán)濾掉的,否則會出現(xiàn)人為的多倍體干擾,分析的時候需要的是單個的細(xì)胞,不過如果經(jīng)驗豐富也可以gate掉的。如果你沒有條件,建議在染色之前將細(xì)胞彈的很散,再進(jìn)行染色
10、Q:流式細(xì)胞儀觀察細(xì)胞周期樣品怎樣準(zhǔn)備?
A:給你介紹一下我的實驗方法,我做的是周期檢測,要做平行樣,六孔板做的。
(1)收集先棄液,將你要實驗(你已經(jīng)處理好的)的細(xì)胞PBS洗兩次,加胰酶消化(注意:如果要是加藥物或者其他處理過的細(xì)胞,棄液和PBS洗液均收集);
(2)加培養(yǎng)基終止消化,打勻在分別收到各自離心管中(注意,收集過程中及后續(xù)過程中槍頭不要混用,要不平行樣也就沒意思了);
(3)離心,1000rpm,5min棄液;
(4)4度PBS(1到2ml)洗兩次,離心,1000rpm,5min棄液;
(5)加入負(fù)20度70%酒精(1到2ml)打勻,固定,至少半個小時以上,(不做的話,可放入4度冰箱保存2-3周問題不大);
(6)離心,1000rpm,5min棄酒精;
(7)4度PBS(1到2ml)洗,離心1000rpm,5min棄液;
(8)4度PBS(1到2ml)洗,打勻后,將細(xì)胞懸液用100 目的紗布直接過濾到流式檢測管中;
(9)離心,1000rpm,5min棄液;
(10)加PI染液染色(濃度為50ug/ml),PBS32.4ml ,PI 2.5mg,Rnase 0.5mg,(Triton-X-100 0.25ml,枸櫞酸鈉50mg,這兩我沒加也效果不錯)加PBS至50ml,4度避光保存數(shù)月。106細(xì)胞中加入1ml PI染液, 振蕩器振勻,避光染色至少30 min, 上機檢測;
(11)統(tǒng)計分析。
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